122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10617 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10617  transposase  100 
 
 
247 aa  502  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000002302  normal  0.279462 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12804  transposase  86.97 
 
 
459 aa  421  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00653678  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13861  transposase  84.58 
 
 
407 aa  417  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12993  transposase  85.65 
 
 
459 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000929698  normal  0.662784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12899  transposase  83.54 
 
 
460 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0267522  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10940  transposase  44.4 
 
 
550 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3430  transposase  38.02 
 
 
442 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5114  IS605 family transposase OrfB  37.71 
 
 
461 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279407  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1615  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  40.2 
 
 
420 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00623083  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  37.3 
 
 
442 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  37.3 
 
 
442 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1223  transposase  34.45 
 
 
440 aa  106  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1890  transposase OrfB  30.43 
 
 
335 aa  79  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  30.43 
 
 
398 aa  78.6  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  30.43 
 
 
398 aa  78.6  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  30 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3275  transposase  29.15 
 
 
405 aa  72.4  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151083  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  31 
 
 
399 aa  69.3  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  30.8 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5487  IS605 family transposase OrfB  41 
 
 
293 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643829  normal  0.289527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2775  transposase, IS605 OrfB  36.61 
 
 
356 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3267  transposase, IS605 OrfB  36.61 
 
 
356 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.244566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  27.52 
 
 
405 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  28.02 
 
 
411 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  25 
 
 
402 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  24.55 
 
 
402 aa  56.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  27.16 
 
 
413 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  27.75 
 
 
411 aa  55.8  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  25.94 
 
 
377 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3034  transposase, IS605 OrfB family  25.22 
 
 
394 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  23.25 
 
 
440 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  27.35 
 
 
377 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.13 
 
 
431 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  27.81 
 
 
348 aa  55.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  27.81 
 
 
348 aa  55.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  26.5 
 
 
377 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  25 
 
 
402 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  27.15 
 
 
348 aa  53.1  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0272  transposase  24.57 
 
 
370 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215661  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  21.79 
 
 
384 aa  52  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  25.42 
 
 
383 aa  52  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  28.4 
 
 
375 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  21.94 
 
 
383 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  22.36 
 
 
384 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  21.94 
 
 
384 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  25.66 
 
 
411 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  27.11 
 
 
411 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  24.12 
 
 
383 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  21.52 
 
 
384 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  24.11 
 
 
387 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3268  hypothetical protein  36.84 
 
 
112 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.220278 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  21.94 
 
 
384 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  26.11 
 
 
399 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  26.11 
 
 
399 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  21.94 
 
 
384 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0723  ISCpe2, transposase orfB  21.94 
 
 
384 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  23.5 
 
 
402 aa  49.7  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  24.11 
 
 
402 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1629  IS605 family transposase OrfB  23.5 
 
 
402 aa  49.3  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  23.5 
 
 
402 aa  49.3  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0126  ISCpe2, transposase orfB  21.94 
 
 
384 aa  49.3  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  21.94 
 
 
384 aa  49.3  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0067  IS605 family transposase OrfB  25.43 
 
 
370 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0099  transposase, OrfB family  25.43 
 
 
370 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000414813  hitchhiker  0.000000000012514 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  23.66 
 
 
402 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  23.66 
 
 
402 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  23.66 
 
 
402 aa  48.9  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  21.94 
 
 
384 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0679  ISCpe2, transposase orfB  21.94 
 
 
384 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  22.5 
 
 
370 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  22.08 
 
 
370 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  26.01 
 
 
400 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0472  ISCpe2, transposase orfB  21.52 
 
 
384 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0626  ISCpe2, transposase orfB  21.52 
 
 
384 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.202409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0711  ISCpe2, transposase orfB  21.94 
 
 
384 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.489014  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1049  ISCpe2, transposase orfB  21.52 
 
 
384 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00154487  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  23.66 
 
 
402 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4789  IS605 family transposase OrfB  26.03 
 
 
326 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  23.66 
 
 
402 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1343  transposase, IS607 family  27.56 
 
 
393 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  23.5 
 
 
383 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  22.77 
 
 
402 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  26.22 
 
 
409 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1008  IS605 family transposase OrfB  22.61 
 
 
387 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0937506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  29.87 
 
 
417 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  23.21 
 
 
402 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  23.36 
 
 
370 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  21.67 
 
 
370 aa  45.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  23.21 
 
 
402 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  23.95 
 
 
370 aa  45.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  22.71 
 
 
385 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  24.78 
 
 
403 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  24.03 
 
 
393 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  24.05 
 
 
370 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  24.24 
 
 
393 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  24.78 
 
 
403 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0505  ISCpe2, transposase orfB  20.68 
 
 
236 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0716  transposase  25.75 
 
 
164 aa  45.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0633864  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  24.78 
 
 
403 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3922  IS605 family transposase OrfB  21.97 
 
 
394 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>