More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0716 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0716  transposase  100 
 
 		 164 aa  336  9.999999999999999e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0633864  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  93.8 
 
 		 348 aa  252  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0667  transposase  89.55 
 
 		 134 aa  248  3e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000584643  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  82.17 
 
 		 348 aa  225  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  82.17 
 
 		 348 aa  225  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  58 
 
 		 402 aa  185  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  55.33 
 
 		 402 aa  176  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  55.33 
 
 		 402 aa  176  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  54.67 
 
 		 402 aa  176  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  55.33 
 
 		 387 aa  175  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  54.67 
 
 		 402 aa  174  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  55.33 
 
 		 402 aa  174  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  54.67 
 
 		 402 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  56.76 
 
 		 411 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  54.67 
 
 		 402 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  54.67 
 
 		 402 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  54.67 
 
 		 402 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  54.67 
 
 		 402 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  54 
 
 		 402 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  57.05 
 
 		 411 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  57.43 
 
 		 411 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  53.38 
 
 		 411 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  51.92 
 
 		 403 aa  164  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  51.92 
 
 		 403 aa  164  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  51.92 
 
 		 403 aa  164  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  53.59 
 
 		 411 aa  163  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  56.72 
 
 		 382 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  51.33 
 
 		 413 aa  159  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  50 
 
 		 406 aa  159  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  56.72 
 
 		 382 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  43.14 
 
 		 431 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  47.37 
 
 		 400 aa  147  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  45.95 
 
 		 383 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  45.95 
 
 		 383 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  45.95 
 
 		 383 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  45.95 
 
 		 383 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  45.27 
 
 		 383 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  43.92 
 
 		 383 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  43.92 
 
 		 383 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  43.56 
 
 		 384 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0100  IS891/IS1136/IS1341 transposase  46.62 
 
 		 401 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  44.67 
 
 		 391 aa  114  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  43.92 
 
 		 416 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  41.61 
 
 		 422 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  40.72 
 
 		 381 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  40.72 
 
 		 381 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  43.24 
 
 		 383 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  43.24 
 
 		 383 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  41.24 
 
 		 440 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0008  family transposase  40.52 
 
 		 332 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  43.92 
 
 		 402 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  39.87 
 
 		 373 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  39.87 
 
 		 373 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  36.18 
 
 		 385 aa  105  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  39.87 
 
 		 373 aa  103  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  39.87 
 
 		 373 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  40.52 
 
 		 383 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  40.52 
 
 		 383 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  39.47 
 
 		 372 aa  101  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  38.82 
 
 		 372 aa  101  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  39.22 
 
 		 373 aa  101  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  39.22 
 
 		 373 aa  101  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  39.22 
 
 		 373 aa  101  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  38.82 
 
 		 372 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  34.21 
 
 		 371 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  39.22 
 
 		 383 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  38.16 
 
 		 372 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  32.24 
 
 		 422 aa  98.2  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  34.64 
 
 		 385 aa  98.6  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  39.86 
 
 		 399 aa  97.1  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  38.93 
 
 		 396 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  34.62 
 
 		 370 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  38.41 
 
 		 405 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  34.67 
 
 		 404 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  34.67 
 
 		 404 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  36.42 
 
 		 399 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  34.62 
 
 		 370 aa  91.3  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  37.82 
 
 		 382 aa  90.1  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0078  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  30.26 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  38.69 
 
 		 405 aa  88.2  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  38.69 
 
 		 405 aa  88.2  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2033  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 		 109 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  37.09 
 
 		 370 aa  87.8  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  37.84 
 
 		 394 aa  87.8  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  37.84 
 
 		 394 aa  87.8  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1623  IS605 family transposase OrfB  35.22 
 
 		 391 aa  86.7  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0227  IS605 family transposase OrfB  35.22 
 
 		 391 aa  86.7  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0173812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  37.75 
 
 		 370 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  37.82 
 
 		 382 aa  86.3  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  36.43 
 
 		 377 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  37.09 
 
 		 370 aa  85.5  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  37.58 
 
 		 394 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  35.62 
 
 		 461 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  38.56 
 
 		 399 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1629  IS605 family transposase OrfB  40.6 
 
 		 402 aa  85.5  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  38.56 
 
 		 399 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  40.6 
 
 		 402 aa  85.5  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  40.6 
 
 		 402 aa  85.5  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  37.09 
 
 		 370 aa  85.1  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  37.09 
 
 		 393 aa  85.1  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>