More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0667 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0667  transposase  100 
 
 		 134 aa  275  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000584643  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0716  transposase  89.55 
 
 		 164 aa  248  2e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0633864  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  87.6 
 
 		 348 aa  234  3e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  87.6 
 
 		 348 aa  234  3e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  86.82 
 
 		 348 aa  232  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  57.26 
 
 		 402 aa  149  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  57.26 
 
 		 402 aa  148  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  56.45 
 
 		 402 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  56.45 
 
 		 382 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  56.45 
 
 		 402 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  56.45 
 
 		 382 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  56.45 
 
 		 402 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  56.45 
 
 		 402 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  55.65 
 
 		 402 aa  144  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  56.45 
 
 		 402 aa  144  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  56.45 
 
 		 402 aa  144  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  56.45 
 
 		 402 aa  143  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  56.45 
 
 		 387 aa  144  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  54.84 
 
 		 402 aa  141  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  55.65 
 
 		 402 aa  140  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  52.85 
 
 		 411 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  56.91 
 
 		 411 aa  138  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  56.1 
 
 		 411 aa  136  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  54.47 
 
 		 411 aa  134  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  50.79 
 
 		 403 aa  130  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  50.79 
 
 		 403 aa  130  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  50.79 
 
 		 403 aa  127  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  50.41 
 
 		 411 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  48.41 
 
 		 406 aa  123  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  45.24 
 
 		 431 aa  121  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  49.19 
 
 		 413 aa  121  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  42.86 
 
 		 400 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  46.96 
 
 		 381 aa  98.2  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  46.96 
 
 		 381 aa  98.2  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  43.38 
 
 		 384 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  43.55 
 
 		 416 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  44.8 
 
 		 391 aa  93.6  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0100  IS891/IS1136/IS1341 transposase  46.96 
 
 		 401 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  42.62 
 
 		 383 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  42.62 
 
 		 383 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  42.62 
 
 		 383 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  42.62 
 
 		 383 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  40.98 
 
 		 383 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  40.98 
 
 		 383 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  40.98 
 
 		 383 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  41.94 
 
 		 402 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  38.71 
 
 		 385 aa  88.2  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  38.71 
 
 		 385 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  42.99 
 
 		 383 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  40.98 
 
 		 405 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  42.99 
 
 		 383 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  36.29 
 
 		 371 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  37.5 
 
 		 405 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  37.5 
 
 		 405 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4972  IS891/IS1136/IS1341 transposase  38.52 
 
 		 402 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  38.52 
 
 		 461 aa  80.5  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  38.33 
 
 		 399 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  39.46 
 
 		 440 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0778  transposase, IS605 OrfB family  41.59 
 
 		 500 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4361  transposase, IS605 OrfB family  39.29 
 
 		 386 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  38.93 
 
 		 422 aa  77.8  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  38.02 
 
 		 396 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  34.43 
 
 		 404 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  34.43 
 
 		 404 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  37.7 
 
 		 394 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  37.7 
 
 		 394 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  38.21 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3183  transposase, IS605 OrfB family  41.18 
 
 		 496 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  32.46 
 
 		 363 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0008  family transposase  34.15 
 
 		 332 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  39.02 
 
 		 370 aa  71.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  33.33 
 
 		 422 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  38.21 
 
 		 370 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  33.33 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  32.52 
 
 		 372 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  32.52 
 
 		 373 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  38.21 
 
 		 370 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  38.21 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  38.21 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2181  transposase, IS605 OrfB family  28.57 
 
 		 380 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.538688 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  34.38 
 
 		 370 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  37.4 
 
 		 370 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  37.4 
 
 		 370 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  38.21 
 
 		 393 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  38.21 
 
 		 370 aa  67.8  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1199  transposase, IS605 OrfB family  29.37 
 
 		 380 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000673457  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  35.29 
 
 		 383 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3187  transposase, IS605 OrfB family  28.57 
 
 		 380 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.742933 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  31.58 
 
 		 363 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  32.81 
 
 		 370 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  31.58 
 
 		 363 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  31.58 
 
 		 363 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  31.58 
 
 		 363 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  31.58 
 
 		 363 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  31.58 
 
 		 363 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  32.52 
 
 		 372 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1741  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  28.57 
 
 		 354 aa  67.4  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  33.33 
 
 		 372 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  31.58 
 
 		 363 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>