281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0078 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0078  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  100 
 
 		 153 aa  315  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  93.24 
 
 		 422 aa  293  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  44.08 
 
 		 400 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  42.38 
 
 		 403 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  42.38 
 
 		 403 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  43.54 
 
 		 403 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  46.15 
 
 		 406 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  42.38 
 
 		 402 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  42.38 
 
 		 402 aa  131  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  41.72 
 
 		 402 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  45.83 
 
 		 431 aa  130  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  41.72 
 
 		 387 aa  130  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  41.06 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  41.06 
 
 		 402 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  41.06 
 
 		 402 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  41.06 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  41.06 
 
 		 402 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  41.06 
 
 		 402 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  42.38 
 
 		 413 aa  128  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  42.18 
 
 		 402 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  41.06 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  40.4 
 
 		 402 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  41.72 
 
 		 411 aa  116  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  40.4 
 
 		 411 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  40.46 
 
 		 382 aa  115  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  40.46 
 
 		 382 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  39.07 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  39.07 
 
 		 411 aa  110  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  39.74 
 
 		 411 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  35.9 
 
 		 399 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0716  transposase  30.26 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0633864  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2033  IS605 family transposase OrfB  44.68 
 
 		 109 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  30.41 
 
 		 402 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  33.95 
 
 		 408 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  33.33 
 
 		 408 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.77 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  33.77 
 
 		 381 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  33.77 
 
 		 381 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0100  IS891/IS1136/IS1341 transposase  31.62 
 
 		 401 aa  82  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  35.67 
 
 		 422 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4789  IS605 family transposase OrfB  38.83 
 
 		 326 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  32.58 
 
 		 416 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  39.81 
 
 		 375 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  37.86 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  36.89 
 
 		 377 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  38 
 
 		 368 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  39.42 
 
 		 377 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  39 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  31.9 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  38 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1890  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.89 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.27 
 
 		 401 aa  75.1  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  30.61 
 
 		 383 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  30.61 
 
 		 383 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  37 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  35.51 
 
 		 391 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37 
 
 		 381 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  30.32 
 
 		 417 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  32.24 
 
 		 371 aa  71.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  36.73 
 
 		 406 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3287  transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.46 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.0427677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  35 
 
 		 385 aa  70.9  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  30.67 
 
 		 370 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  30.56 
 
 		 383 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  33.01 
 
 		 391 aa  70.5  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  30.61 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  29.53 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1008  IS605 family transposase OrfB  27.14 
 
 		 387 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0937506  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  30.56 
 
 		 383 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  33.01 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  33.01 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  30.56 
 
 		 383 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  30.56 
 
 		 383 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  29.93 
 
 		 383 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  32.04 
 
 		 410 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0148  ISCpe4, transposase  27.86 
 
 		 387 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  32.67 
 
 		 391 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  31.97 
 
 		 348 aa  68.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  30.48 
 
 		 362 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  30.7 
 
 		 395 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0278  ISCpe4, transposase  27.86 
 
 		 396 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1629  IS605 family transposase OrfB  26.43 
 
 		 387 aa  67.8  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.817421  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  34.34 
 
 		 424 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  27.89 
 
 		 383 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  33.66 
 
 		 373 aa  67.4  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  31.68 
 
 		 390 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  33 
 
 		 405 aa  67  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.21 
 
 		 396 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  31.69 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  32.08 
 
 		 393 aa  67  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  33 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  29.33 
 
 		 370 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  31.69 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  31.69 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0505  ISCpe2, transposase orfB  23.49 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  31.69 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  31.69 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  27.91 
 
 		 377 aa  65.1  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>