226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2033 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2033  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 		 109 aa  229  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  95.88 
 
 		 402 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  94.85 
 
 		 402 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  94.85 
 
 		 402 aa  194  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  94.85 
 
 		 402 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  94.85 
 
 		 402 aa  192  9e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  94.85 
 
 		 402 aa  192  9e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  94.85 
 
 		 402 aa  192  9e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  93.81 
 
 		 402 aa  192  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  93.81 
 
 		 387 aa  192  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  92.78 
 
 		 402 aa  191  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  93.81 
 
 		 402 aa  189  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  91.75 
 
 		 402 aa  188  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  78.35 
 
 		 402 aa  166  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  96.1 
 
 		 382 aa  158  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  96.1 
 
 		 382 aa  158  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  65.98 
 
 		 400 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  65.98 
 
 		 411 aa  122  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  63.92 
 
 		 411 aa  120  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  61.86 
 
 		 411 aa  119  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  58.51 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  57.73 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  57.73 
 
 		 403 aa  117  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  61.86 
 
 		 411 aa  117  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  63.92 
 
 		 413 aa  117  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  58.51 
 
 		 406 aa  116  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  61.86 
 
 		 411 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  55.79 
 
 		 431 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0716  transposase  50 
 
 		 164 aa  87.8  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0633864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0078  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  44.68 
 
 		 153 aa  87.4  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  45.05 
 
 		 422 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  45.16 
 
 		 391 aa  77.8  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  39.8 
 
 		 422 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1629  IS605 family transposase OrfB  41.3 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  41.3 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  37.78 
 
 		 371 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  41.3 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  38.3 
 
 		 416 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0100  IS891/IS1136/IS1341 transposase  39.36 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  36.67 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  36.67 
 
 		 390 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  40.66 
 
 		 383 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  40.66 
 
 		 383 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  36.67 
 
 		 391 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  36.67 
 
 		 403 aa  63.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  37.23 
 
 		 402 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  35.56 
 
 		 395 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  36.96 
 
 		 408 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  36.96 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  54.41 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  54.41 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  35.56 
 
 		 391 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 		 381 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  37.36 
 
 		 403 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  37.36 
 
 		 403 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  37.36 
 
 		 403 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  37.36 
 
 		 403 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  35.56 
 
 		 385 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  37.08 
 
 		 417 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  37.36 
 
 		 403 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  33.33 
 
 		 368 aa  61.6  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.44 
 
 		 376 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  34.44 
 
 		 391 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0120  family transposase, OrfB  34.44 
 
 		 372 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000180959 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0093  family transposase, OrfB  34.44 
 
 		 372 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 		 362 aa  60.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  37.36 
 
 		 383 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3287  transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.63 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.0427677 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  37.36 
 
 		 383 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  37.36 
 
 		 383 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  37.36 
 
 		 383 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  40 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.22 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.22 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  35.42 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  35.87 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 		 410 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0667  transposase  53.03 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000584643  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  51.52 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  35.11 
 
 		 405 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  34.78 
 
 		 382 aa  58.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  32.26 
 
 		 410 aa  57.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 		 410 aa  57.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  40 
 
 		 394 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  36.08 
 
 		 367 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  34.44 
 
 		 373 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  35.11 
 
 		 405 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 		 377 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  31.18 
 
 		 377 aa  57  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0067  IS605 family transposase OrfB  38.46 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  33.7 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0099  transposase, OrfB family  38.46 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000414813  hitchhiker  0.000000000012514 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  34.04 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  34.38 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  36.08 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  34.04 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  32.29 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0121  IS605 family transposase OrfB  29.67 
 
 		 395 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  35.11 
 
 		 399 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  35.16 
 
 		 383 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>