More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3021 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2592  peptidase M16 domain-containing protein  73.84 
 
 
929 aa  1471    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3155  zinc metallopeptidase  38.72 
 
 
936 aa  706    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3083  M16 family peptidase  74.27 
 
 
929 aa  1478    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2773  peptidase M16 domain-containing protein  73.74 
 
 
929 aa  1468    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.368865  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3021  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
929 aa  1928    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1660  peptidase insulinase family protein  45.33 
 
 
939 aa  887    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002859  peptidase insulinase family  45.02 
 
 
925 aa  892    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1533  peptidase M16-like protein  69.54 
 
 
929 aa  1377    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1603  peptidase M16 domain protein  73.63 
 
 
929 aa  1464    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1412  Insulysin  74.6 
 
 
929 aa  1485    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528026  normal  0.896637 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2420  peptidase M16 domain-containing protein  78.49 
 
 
925 aa  1550    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1477  peptidase M16 domain-containing protein  74.49 
 
 
929 aa  1486    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.602507  normal  0.234952 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2671  peptidase M16 domain-containing protein  70.29 
 
 
929 aa  1383    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03118  hypothetical protein  45.34 
 
 
904 aa  878    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2756  peptidase M16 domain-containing protein  73.74 
 
 
929 aa  1465    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2455  peptidase M16 domain-containing protein  73.41 
 
 
929 aa  1458    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1465  peptidase M16 domain-containing protein  74.6 
 
 
929 aa  1480    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987023 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2850  peptidase M16 domain-containing protein  73.74 
 
 
929 aa  1466    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196347 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1634  peptidase M16 domain-containing protein  84.39 
 
 
929 aa  1647    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.554729  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2163  M16 family peptidase  71.23 
 
 
929 aa  1406    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.744451  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1666  peptidase M16-like  33.22 
 
 
945 aa  599  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2134  zinc metallopeptidase  36.54 
 
 
968 aa  593  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02695  peptidase, M16 family protein  34.83 
 
 
915 aa  580  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0492613  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2509  peptidase M16 domain-containing protein  32.05 
 
 
947 aa  530  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244446  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3023  peptidase M16-like protein  32.13 
 
 
941 aa  521  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00252323  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2863  peptidase M16 domain-containing protein  32.28 
 
 
963 aa  469  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000086513 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08044  a-pheromone processing metallopeptidase Ste23 (AFU_orthologue; AFUA_5G02010)  30.15 
 
 
1100 aa  431  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.356116  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18335  predicted protein  30.53 
 
 
995 aa  427  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3480  peptidase M16 domain-containing protein  29.02 
 
 
958 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.56201 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56651  predicted protein  29.5 
 
 
1074 aa  395  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.798232  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05710  insulin degrading enzyme, putative  29.45 
 
 
1162 aa  385  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0913  peptidase M16 domain protein  29.07 
 
 
986 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3815  peptidase M16 domain-containing protein  28.49 
 
 
962 aa  382  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0788727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3390  peptidase M16 domain protein  29.3 
 
 
982 aa  382  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3079  Pitrilysin  28.56 
 
 
946 aa  379  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3190  Pitrilysin  28.6 
 
 
967 aa  375  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1042  peptidase M16 domain-containing protein  27.56 
 
 
962 aa  366  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.923143  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3232  protease III precursor  27.45 
 
 
962 aa  364  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.730606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0990  protease III  27.45 
 
 
962 aa  364  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45399  predicted protein  28.19 
 
 
916 aa  360  6e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3008  Pitrilysin  28 
 
 
981 aa  353  7e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50598  predicted protein  27 
 
 
1008 aa  345  2.9999999999999997e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732398  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  28.56 
 
 
962 aa  336  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.436713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  28.56 
 
 
962 aa  336  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  28.45 
 
 
962 aa  336  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  28.56 
 
 
962 aa  336  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_267  predicted protein  27.32 
 
 
952 aa  334  4e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0986316  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  28.44 
 
 
962 aa  334  5e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  28.44 
 
 
962 aa  334  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  28.44 
 
 
962 aa  334  5e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02669  protease III  28.33 
 
 
962 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  28.33 
 
 
962 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3321  protease 3  27.14 
 
 
962 aa  328  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.328834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3207  protease 3  27.03 
 
 
962 aa  327  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3158  protease 3  27.03 
 
 
962 aa  326  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.782979  normal  0.694921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3141  protease 3  26.91 
 
 
962 aa  326  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3221  protease 3  26.8 
 
 
962 aa  316  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.405779 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3264  peptidase M16 domain-containing protein  26.37 
 
 
960 aa  313  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47929  predicted protein  34.34 
 
 
1272 aa  248  4e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  23.42 
 
 
939 aa  222  3e-56  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5156  pqqF protein. metallo peptidase. MEROPS family M16A  29.73 
 
 
808 aa  153  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.326749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4669  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  32.32 
 
 
762 aa  150  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0514  coenzyme PQQ synthesis protein F  31.62 
 
 
779 aa  144  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3322  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  28.97 
 
 
763 aa  126  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39010  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  28.86 
 
 
775 aa  126  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28795  predicted protein  27.33 
 
 
1246 aa  124  8e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.923761  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0409  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  32.86 
 
 
766 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4822  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  31.28 
 
 
760 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0405  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  31.86 
 
 
809 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458439  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0381  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  32.18 
 
 
766 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47985  predicted protein  26.05 
 
 
932 aa  115  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1937  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  28.96 
 
 
794 aa  110  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.979365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41610  coenzyme PQQ biosynthesis protein F  28.64 
 
 
843 aa  102  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  23.79 
 
 
419 aa  99.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4342  peptidase M16-like  26.34 
 
 
431 aa  95.9  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472968  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  23.05 
 
 
419 aa  94.7  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  24.91 
 
 
423 aa  94  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  28.57 
 
 
453 aa  92.8  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  20.88 
 
 
419 aa  92  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  26.6 
 
 
448 aa  89  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  26.6 
 
 
448 aa  89  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  24.48 
 
 
472 aa  88.6  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  28 
 
 
441 aa  87.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  28 
 
 
441 aa  87.4  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  27.44 
 
 
493 aa  86.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  26.67 
 
 
440 aa  85.9  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  24.18 
 
 
530 aa  84.7  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  26.89 
 
 
489 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  28.38 
 
 
477 aa  83.2  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0364  processing peptidase  24.91 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  24.79 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0895  peptidase M16 domain protein  25.44 
 
 
427 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  25.93 
 
 
461 aa  82  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4238  peptidase M16 domain protein  23.2 
 
 
436 aa  82  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259515  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0921  peptidase M16 domain protein  25.44 
 
 
427 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0782213  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  25.66 
 
 
453 aa  82  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2952  peptidase M16 domain protein  25.63 
 
 
430 aa  81.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2073  peptidase M16 domain protein  28.27 
 
 
429 aa  81.3  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4309  peptidase M16-like  26.62 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  25.09 
 
 
952 aa  81.3  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>