More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1634 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1603  peptidase M16 domain protein  74.17 
 
 		 929 aa  1472    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1634  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 929 aa  1931    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.554729  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3155  zinc metallopeptidase  38.24 
 
 		 936 aa  701    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3083  M16 family peptidase  74.6 
 
 		 929 aa  1477    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002859  peptidase insulinase family  44.86 
 
 		 925 aa  877    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03118  hypothetical protein  44.9 
 
 		 904 aa  860    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2592  peptidase M16 domain-containing protein  74.81 
 
 		 929 aa  1490    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2756  peptidase M16 domain-containing protein  74.27 
 
 		 929 aa  1474    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1660  peptidase insulinase family protein  44.94 
 
 		 939 aa  871    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2850  peptidase M16 domain-containing protein  74.27 
 
 		 929 aa  1474    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196347 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1533  peptidase M16-like protein  70.31 
 
 		 929 aa  1389    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2420  peptidase M16 domain-containing protein  79.78 
 
 		 925 aa  1545    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2773  peptidase M16 domain-containing protein  74.27 
 
 		 929 aa  1476    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.368865  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1412  Insulysin  74.49 
 
 		 929 aa  1476    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528026  normal  0.896637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1477  peptidase M16 domain-containing protein  74.17 
 
 		 929 aa  1475    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.602507  normal  0.234952 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2671  peptidase M16 domain-containing protein  70.72 
 
 		 929 aa  1394    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1465  peptidase M16 domain-containing protein  74.38 
 
 		 929 aa  1473    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3021  peptidase M16 domain-containing protein  84.39 
 
 		 929 aa  1667    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2163  M16 family peptidase  72.92 
 
 		 929 aa  1428    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.744451  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2455  peptidase M16 domain-containing protein  73.74 
 
 		 929 aa  1458    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02695  peptidase, M16 family protein  36.18 
 
 		 915 aa  599  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0492613  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2134  zinc metallopeptidase  36.74 
 
 		 968 aa  596  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1666  peptidase M16-like  34.27 
 
 		 945 aa  590  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2509  peptidase M16 domain-containing protein  33.11 
 
 		 947 aa  536  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244446  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3023  peptidase M16-like protein  32.2 
 
 		 941 aa  513  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00252323  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2863  peptidase M16 domain-containing protein  32.42 
 
 		 963 aa  473  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000086513 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08044  a-pheromone processing metallopeptidase Ste23 (AFU_orthologue; AFUA_5G02010)  29.93 
 
 		 1100 aa  421  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.356116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18335  predicted protein  29.65 
 
 		 995 aa  420  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3480  peptidase M16 domain-containing protein  29.38 
 
 		 958 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56201 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0913  peptidase M16 domain protein  29.86 
 
 		 986 aa  392  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3079  Pitrilysin  29.7 
 
 		 946 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3390  peptidase M16 domain protein  29.75 
 
 		 982 aa  392  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3815  peptidase M16 domain-containing protein  28.88 
 
 		 962 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0788727 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1042  peptidase M16 domain-containing protein  29.33 
 
 		 962 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.923143  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05710  insulin degrading enzyme, putative  28.62 
 
 		 1162 aa  381  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3232  protease III precursor  28.87 
 
 		 962 aa  381  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.730606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0990  protease III  28.87 
 
 		 962 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3190  Pitrilysin  29.08 
 
 		 967 aa  382  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434447  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56651  predicted protein  28.51 
 
 		 1074 aa  369  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.798232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3008  Pitrilysin  28.79 
 
 		 981 aa  363  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3321  protease 3  28.01 
 
 		 962 aa  350  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328834 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45399  predicted protein  27.42 
 
 		 916 aa  350  1e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3207  protease 3  27.9 
 
 		 962 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3141  protease 3  27.9 
 
 		 962 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3158  protease 3  27.9 
 
 		 962 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.782979  normal  0.694921 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  27.55 
 
 		 962 aa  344  4e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.436713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  27.55 
 
 		 962 aa  344  5e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02669  protease III  27.55 
 
 		 962 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  27.55 
 
 		 962 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  27.55 
 
 		 962 aa  343  9e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  27.44 
 
 		 962 aa  342  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  27.44 
 
 		 962 aa  342  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  27.44 
 
 		 962 aa  342  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50598  predicted protein  27.5 
 
 		 1008 aa  342  2e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732398  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  27.44 
 
 		 962 aa  342  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3221  protease 3  27.55 
 
 		 962 aa  341  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405779 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_267  predicted protein  27.73 
 
 		 952 aa  335  3e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0986316  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3264  peptidase M16 domain-containing protein  26.67 
 
 		 960 aa  333  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47929  predicted protein  32.95 
 
 		 1272 aa  236  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  23.75 
 
 		 939 aa  227  1e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28795  predicted protein  23.82 
 
 		 1246 aa  164  8.000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.923761  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0514  coenzyme PQQ synthesis protein F  33.89 
 
 		 779 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4669  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  37.38 
 
 		 762 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5156  pqqF protein. metallo peptidase. MEROPS family M16A  28.82 
 
 		 808 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0409  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  33.98 
 
 		 766 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39010  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  29.53 
 
 		 775 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3322  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  28.03 
 
 		 763 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0381  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  33.33 
 
 		 766 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0405  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  33.01 
 
 		 809 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4822  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  33.5 
 
 		 760 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47985  predicted protein  27.81 
 
 		 932 aa  122  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1937  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  25.91 
 
 		 794 aa  111  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.979365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41610  coenzyme PQQ biosynthesis protein F  29.35 
 
 		 843 aa  104  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  23.59 
 
 		 419 aa  97.8  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  22.56 
 
 		 419 aa  95.1  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  30.16 
 
 		 419 aa  94  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  25.79 
 
 		 442 aa  93.6  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  22.56 
 
 		 472 aa  92.4  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  27.73 
 
 		 453 aa  91.7  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  26.59 
 
 		 489 aa  90.9  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  24.63 
 
 		 431 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  26.32 
 
 		 448 aa  89  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  27.91 
 
 		 461 aa  88.2  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  28.52 
 
 		 451 aa  88.2  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  26.96 
 
 		 448 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1986  processing protease  23.42 
 
 		 440 aa  87  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  26.96 
 
 		 448 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0364  processing peptidase  25.99 
 
 		 413 aa  87.4  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  26.16 
 
 		 463 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  25.49 
 
 		 423 aa  86.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0704  peptidase M16 domain protein  24 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  27.84 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  29.2 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  29.2 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  25.09 
 
 		 952 aa  85.5  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  28.7 
 
 		 962 aa  85.5  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  28.25 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  28.7 
 
 		 960 aa  85.5  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  26 
 
 		 504 aa  85.1  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4238  peptidase M16 domain protein  22.2 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>