More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2163 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3021  peptidase M16 domain-containing protein  71.23 
 
 		 929 aa  1423    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3155  zinc metallopeptidase  39.55 
 
 		 936 aa  724    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3083  M16 family peptidase  74.49 
 
 		 929 aa  1471    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2773  peptidase M16 domain-containing protein  75.35 
 
 		 929 aa  1477    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.368865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1603  peptidase M16 domain protein  75.35 
 
 		 929 aa  1474    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2455  peptidase M16 domain-containing protein  75.67 
 
 		 929 aa  1475    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1634  peptidase M16 domain-containing protein  72.92 
 
 		 929 aa  1428    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.554729  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03118  hypothetical protein  47.62 
 
 		 904 aa  896    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2592  peptidase M16 domain-containing protein  68.99 
 
 		 929 aa  1361    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1533  peptidase M16-like protein  70.26 
 
 		 929 aa  1373    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1660  peptidase insulinase family protein  46.57 
 
 		 939 aa  897    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2420  peptidase M16 domain-containing protein  72.82 
 
 		 925 aa  1431    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1412  Insulysin  74.7 
 
 		 929 aa  1472    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528026  normal  0.896637 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002859  peptidase insulinase family  47.81 
 
 		 925 aa  919    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2756  peptidase M16 domain-containing protein  75.24 
 
 		 929 aa  1473    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1477  peptidase M16 domain-containing protein  75.13 
 
 		 929 aa  1480    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.602507  normal  0.234952 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2671  peptidase M16 domain-containing protein  69.5 
 
 		 929 aa  1373    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1465  peptidase M16 domain-containing protein  74.7 
 
 		 929 aa  1468    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987023 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2850  peptidase M16 domain-containing protein  75.35 
 
 		 929 aa  1476    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196347 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2163  M16 family peptidase  100 
 
 		 929 aa  1937    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.744451  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2134  zinc metallopeptidase  36.71 
 
 		 968 aa  617  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02695  peptidase, M16 family protein  36.34 
 
 		 915 aa  618  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0492613  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1666  peptidase M16-like  34.78 
 
 		 945 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2509  peptidase M16 domain-containing protein  35.08 
 
 		 947 aa  549  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244446  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3023  peptidase M16-like protein  34.69 
 
 		 941 aa  541  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00252323  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2863  peptidase M16 domain-containing protein  31.94 
 
 		 963 aa  475  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000086513 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08044  a-pheromone processing metallopeptidase Ste23 (AFU_orthologue; AFUA_5G02010)  30.5 
 
 		 1100 aa  432  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.356116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3480  peptidase M16 domain-containing protein  29.19 
 
 		 958 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56201 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18335  predicted protein  29.99 
 
 		 995 aa  415  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56651  predicted protein  30.56 
 
 		 1074 aa  406  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.798232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0913  peptidase M16 domain protein  29.71 
 
 		 986 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3390  peptidase M16 domain protein  30.3 
 
 		 982 aa  399  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05710  insulin degrading enzyme, putative  28.09 
 
 		 1162 aa  395  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3079  Pitrilysin  29.47 
 
 		 946 aa  379  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3815  peptidase M16 domain-containing protein  29.49 
 
 		 962 aa  378  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0788727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3190  Pitrilysin  28.9 
 
 		 967 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3008  Pitrilysin  30.08 
 
 		 981 aa  379  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1042  peptidase M16 domain-containing protein  29.11 
 
 		 962 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.923143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0990  protease III  29 
 
 		 962 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3232  protease III precursor  29 
 
 		 962 aa  372  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.730606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3321  protease 3  28.79 
 
 		 962 aa  359  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3141  protease 3  28.79 
 
 		 962 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3207  protease 3  28.68 
 
 		 962 aa  357  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3158  protease 3  28.67 
 
 		 962 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.782979  normal  0.694921 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50598  predicted protein  27.56 
 
 		 1008 aa  353  8.999999999999999e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732398  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45399  predicted protein  26.82 
 
 		 916 aa  350  6e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3221  protease 3  28.57 
 
 		 962 aa  349  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405779 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3264  peptidase M16 domain-containing protein  27.88 
 
 		 960 aa  347  5e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  28.35 
 
 		 962 aa  347  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  28.35 
 
 		 962 aa  347  7e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.436713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  28.35 
 
 		 962 aa  347  8e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  28.24 
 
 		 962 aa  345  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  28.24 
 
 		 962 aa  345  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  28.24 
 
 		 962 aa  345  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  28.24 
 
 		 962 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02669  protease III  28.24 
 
 		 962 aa  344  4e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  28.24 
 
 		 962 aa  344  4e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_267  predicted protein  27.84 
 
 		 952 aa  327  7e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0986316  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  25.73 
 
 		 939 aa  243  1e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47929  predicted protein  33.64 
 
 		 1272 aa  238  5.0000000000000005e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5156  pqqF protein. metallo peptidase. MEROPS family M16A  24.8 
 
 		 808 aa  160  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326749 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28795  predicted protein  21.94 
 
 		 1246 aa  156  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.923761  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4669  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  32.66 
 
 		 762 aa  141  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0514  coenzyme PQQ synthesis protein F  32.2 
 
 		 779 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3322  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  30.04 
 
 		 763 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39010  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  30.14 
 
 		 775 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0409  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  27.42 
 
 		 766 aa  124  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0381  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  28 
 
 		 766 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0405  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  31.46 
 
 		 809 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4822  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  31.25 
 
 		 760 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47985  predicted protein  25.95 
 
 		 932 aa  109  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1937  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  29.9 
 
 		 794 aa  107  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.979365 
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  26.48 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41610  coenzyme PQQ biosynthesis protein F  29.61 
 
 		 843 aa  103  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  24.45 
 
 		 419 aa  99  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  24.39 
 
 		 419 aa  99  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  25.78 
 
 		 448 aa  91.3  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  25.78 
 
 		 448 aa  91.3  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  27.42 
 
 		 443 aa  90.1  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  28.32 
 
 		 453 aa  89.7  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  24.85 
 
 		 418 aa  89.7  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  27.09 
 
 		 443 aa  89.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  27.09 
 
 		 443 aa  89.4  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  28.57 
 
 		 423 aa  89.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  29.44 
 
 		 461 aa  89  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  27.09 
 
 		 443 aa  89  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  26.54 
 
 		 443 aa  87.8  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  27.31 
 
 		 441 aa  87.8  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  27.31 
 
 		 441 aa  87.8  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  29.05 
 
 		 440 aa  87.8  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4309  peptidase M16-like  24.13 
 
 		 413 aa  87.4  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  25.96 
 
 		 853 aa  87  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  28.17 
 
 		 441 aa  87  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  26.99 
 
 		 442 aa  87  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  25 
 
 		 413 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  26.76 
 
 		 443 aa  87  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  28.17 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  27.23 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  24.84 
 
 		 448 aa  85.9  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  27.4 
 
 		 493 aa  85.5  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>