More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1666 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02695  peptidase, M16 family protein  40.09 
 
 		 915 aa  713    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0492613  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1666  peptidase M16-like  100 
 
 		 945 aa  1962    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2592  peptidase M16 domain-containing protein  34.83 
 
 		 929 aa  630  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3083  M16 family peptidase  34.64 
 
 		 929 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2455  peptidase M16 domain-containing protein  34.54 
 
 		 929 aa  610  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1603  peptidase M16 domain protein  34.98 
 
 		 929 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2420  peptidase M16 domain-containing protein  34.94 
 
 		 925 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2773  peptidase M16 domain-containing protein  34.87 
 
 		 929 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.368865  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2756  peptidase M16 domain-containing protein  34.87 
 
 		 929 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2850  peptidase M16 domain-containing protein  34.87 
 
 		 929 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196347 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1477  peptidase M16 domain-containing protein  34.68 
 
 		 929 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.602507  normal  0.234952 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2163  M16 family peptidase  34.78 
 
 		 929 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.744451  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1412  Insulysin  34.25 
 
 		 929 aa  601  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528026  normal  0.896637 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1465  peptidase M16 domain-containing protein  34.35 
 
 		 929 aa  601  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3021  peptidase M16 domain-containing protein  33.22 
 
 		 929 aa  599  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2671  peptidase M16 domain-containing protein  33.85 
 
 		 929 aa  590  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1634  peptidase M16 domain-containing protein  34.27 
 
 		 929 aa  587  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.554729  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1533  peptidase M16-like protein  34.27 
 
 		 929 aa  581  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1660  peptidase insulinase family protein  34.75 
 
 		 939 aa  568  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002859  peptidase insulinase family  33.01 
 
 		 925 aa  538  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03118  hypothetical protein  32.56 
 
 		 904 aa  526  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3155  zinc metallopeptidase  32.62 
 
 		 936 aa  512  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2134  zinc metallopeptidase  28.04 
 
 		 968 aa  388  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2509  peptidase M16 domain-containing protein  27.43 
 
 		 947 aa  382  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244446  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3023  peptidase M16-like protein  26.68 
 
 		 941 aa  342  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00252323  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2863  peptidase M16 domain-containing protein  27.58 
 
 		 963 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000086513 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08044  a-pheromone processing metallopeptidase Ste23 (AFU_orthologue; AFUA_5G02010)  25.51 
 
 		 1100 aa  303  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.356116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3480  peptidase M16 domain-containing protein  25.72 
 
 		 958 aa  296  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56201 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18335  predicted protein  27.94 
 
 		 995 aa  295  3e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0913  peptidase M16 domain protein  26.61 
 
 		 986 aa  288  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56651  predicted protein  26.38 
 
 		 1074 aa  288  4e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.798232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3390  peptidase M16 domain protein  26.36 
 
 		 982 aa  288  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3815  peptidase M16 domain-containing protein  25.37 
 
 		 962 aa  277  8e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0788727 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  24.72 
 
 		 962 aa  275  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.436713 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  25.03 
 
 		 962 aa  274  6e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  25.03 
 
 		 962 aa  274  6e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  25.03 
 
 		 962 aa  274  6e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  25.03 
 
 		 962 aa  274  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02669  protease III  24.91 
 
 		 962 aa  273  9e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  24.91 
 
 		 962 aa  273  9e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  24.72 
 
 		 962 aa  273  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3158  protease 3  24.66 
 
 		 962 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.782979  normal  0.694921 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  25.03 
 
 		 962 aa  272  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3221  protease 3  24.55 
 
 		 962 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405779 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3207  protease 3  24.55 
 
 		 962 aa  270  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3141  protease 3  24.55 
 
 		 962 aa  270  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3321  protease 3  24.55 
 
 		 962 aa  270  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328834 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1042  peptidase M16 domain-containing protein  24.66 
 
 		 962 aa  267  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.923143  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05710  insulin degrading enzyme, putative  24.17 
 
 		 1162 aa  267  5.999999999999999e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3190  Pitrilysin  24.89 
 
 		 967 aa  266  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434447  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0990  protease III  24.55 
 
 		 962 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3232  protease III precursor  24.55 
 
 		 962 aa  265  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.730606 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3008  Pitrilysin  24.18 
 
 		 981 aa  263  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3264  peptidase M16 domain-containing protein  24.04 
 
 		 960 aa  259  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3079  Pitrilysin  26.22 
 
 		 946 aa  258  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50598  predicted protein  24.7 
 
 		 1008 aa  247  6.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732398  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_267  predicted protein  24.68 
 
 		 952 aa  226  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0986316  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45399  predicted protein  22.96 
 
 		 916 aa  216  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47929  predicted protein  29.21 
 
 		 1272 aa  186  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  22.54 
 
 		 939 aa  174  9e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28795  predicted protein  20.7 
 
 		 1246 aa  112  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.923761  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39010  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  26.9 
 
 		 775 aa  108  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  27.76 
 
 		 419 aa  107  9e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  26.76 
 
 		 419 aa  106  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  29.91 
 
 		 530 aa  103  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3322  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  25.3 
 
 		 763 aa  101  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149192  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  29.58 
 
 		 419 aa  100  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47985  predicted protein  25.78 
 
 		 932 aa  97.1  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5156  pqqF protein. metallo peptidase. MEROPS family M16A  25.6 
 
 		 808 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326749 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  27.68 
 
 		 459 aa  95.9  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  27.68 
 
 		 442 aa  95.1  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3233  peptidase M16 domain protein  26.27 
 
 		 426 aa  95.1  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  28.94 
 
 		 489 aa  94.4  9e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  26.06 
 
 		 441 aa  94  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  26.06 
 
 		 441 aa  94  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4233  peptidase M16 domain protein  25.46 
 
 		 424 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835158 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4194  peptidase M16 domain protein  25.46 
 
 		 424 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1986  processing protease  24.06 
 
 		 440 aa  92.8  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4669  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  26.43 
 
 		 762 aa  92.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  29.07 
 
 		 421 aa  91.7  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3577  processing peptidase  29.28 
 
 		 431 aa  91.3  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1589  processing peptidase  27.63 
 
 		 431 aa  91.3  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0398438 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  23.81 
 
 		 919 aa  90.9  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3253  processing peptidase  29.28 
 
 		 431 aa  91.3  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529384 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  26.07 
 
 		 918 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  28.21 
 
 		 493 aa  90.1  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3547  peptidase M16 domain protein  28.9 
 
 		 432 aa  89  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  28.12 
 
 		 423 aa  88.6  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  25.79 
 
 		 435 aa  88.2  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0496  processing peptidase  26.19 
 
 		 903 aa  87.8  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000425054  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  26.95 
 
 		 949 aa  87.8  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  25.44 
 
 		 912 aa  87.8  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1419  processing peptidase  25.12 
 
 		 424 aa  87.4  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3449  processing peptidase  28.5 
 
 		 431 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3614  peptidase M16 domain protein  25 
 
 		 424 aa  87.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.600859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  26.74 
 
 		 934 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0031  peptidase M16 domain-containing protein  27.91 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.652057  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  27.31 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0409  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  25.61 
 
 		 766 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  27.88 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>