More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0514 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0514  coenzyme PQQ synthesis protein F  100 
 
 		 779 aa  1575    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4669  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  70.62 
 
 		 762 aa  1095    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5156  pqqF protein. metallo peptidase. MEROPS family M16A  47.25 
 
 		 808 aa  661    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0409  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  42.93 
 
 		 766 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4822  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  42.93 
 
 		 760 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0381  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  41.91 
 
 		 766 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0405  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  42.21 
 
 		 809 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39010  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  34.8 
 
 		 775 aa  327  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3322  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  33.66 
 
 		 763 aa  297  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149192  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1937  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  38.89 
 
 		 794 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.979365 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2850  peptidase M16 domain-containing protein  30.23 
 
 		 929 aa  161  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2773  peptidase M16 domain-containing protein  30.23 
 
 		 929 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.368865  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2756  peptidase M16 domain-containing protein  30.23 
 
 		 929 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1603  peptidase M16 domain protein  34.24 
 
 		 929 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1465  peptidase M16 domain-containing protein  29.29 
 
 		 929 aa  159  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1477  peptidase M16 domain-containing protein  29.56 
 
 		 929 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.602507  normal  0.234952 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3083  M16 family peptidase  29.55 
 
 		 929 aa  158  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2455  peptidase M16 domain-containing protein  33.56 
 
 		 929 aa  157  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1412  Insulysin  29.31 
 
 		 929 aa  157  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528026  normal  0.896637 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3155  zinc metallopeptidase  37.64 
 
 		 936 aa  153  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2592  peptidase M16 domain-containing protein  34.01 
 
 		 929 aa  152  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41610  coenzyme PQQ biosynthesis protein F  37.15 
 
 		 843 aa  151  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1634  peptidase M16 domain-containing protein  33.89 
 
 		 929 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.554729  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1533  peptidase M16-like protein  32.31 
 
 		 929 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1660  peptidase insulinase family protein  31.76 
 
 		 939 aa  144  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3021  peptidase M16 domain-containing protein  31.62 
 
 		 929 aa  144  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2671  peptidase M16 domain-containing protein  29.9 
 
 		 929 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3023  peptidase M16-like protein  27.13 
 
 		 941 aa  140  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00252323  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2420  peptidase M16 domain-containing protein  27.89 
 
 		 925 aa  138  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3079  Pitrilysin  38.86 
 
 		 946 aa  138  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3480  peptidase M16 domain-containing protein  28.38 
 
 		 958 aa  133  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56201 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2509  peptidase M16 domain-containing protein  31.78 
 
 		 947 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244446  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3190  Pitrilysin  33.99 
 
 		 967 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434447  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2863  peptidase M16 domain-containing protein  28.3 
 
 		 963 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000086513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3815  peptidase M16 domain-containing protein  36.41 
 
 		 962 aa  126  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0788727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2163  M16 family peptidase  32.2 
 
 		 929 aa  125  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.744451  normal  0.763441 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02669  protease III  29.26 
 
 		 962 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  29.26 
 
 		 962 aa  124  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  29.26 
 
 		 962 aa  124  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  29.26 
 
 		 962 aa  124  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  29.26 
 
 		 962 aa  124  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  29.26 
 
 		 962 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  29.26 
 
 		 962 aa  124  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  29.26 
 
 		 962 aa  124  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  29.26 
 
 		 962 aa  124  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.436713 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3232  protease III precursor  35.24 
 
 		 962 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.730606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0990  protease III  35.24 
 
 		 962 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1042  peptidase M16 domain-containing protein  35.24 
 
 		 962 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.923143  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3390  peptidase M16 domain protein  33.9 
 
 		 982 aa  120  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0913  peptidase M16 domain protein  29.28 
 
 		 986 aa  118  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3008  Pitrilysin  31.64 
 
 		 981 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002859  peptidase insulinase family  30.07 
 
 		 925 aa  118  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18335  predicted protein  31.17 
 
 		 995 aa  118  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3321  protease 3  28.71 
 
 		 962 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3221  protease 3  28.71 
 
 		 962 aa  117  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405779 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3141  protease 3  28.71 
 
 		 962 aa  117  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3207  protease 3  28.71 
 
 		 962 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03118  hypothetical protein  29.43 
 
 		 904 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3158  protease 3  29.68 
 
 		 962 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.782979  normal  0.694921 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2134  zinc metallopeptidase  28.76 
 
 		 968 aa  114  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3264  peptidase M16 domain-containing protein  29.26 
 
 		 960 aa  110  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47929  predicted protein  34.04 
 
 		 1272 aa  108  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02695  peptidase, M16 family protein  33.01 
 
 		 915 aa  108  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0492613  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56651  predicted protein  25.67 
 
 		 1074 aa  103  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.798232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28795  predicted protein  33.92 
 
 		 1246 aa  100  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.923761  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50598  predicted protein  30.77 
 
 		 1008 aa  98.6  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732398  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_267  predicted protein  29.31 
 
 		 952 aa  95.5  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0986316  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05710  insulin degrading enzyme, putative  27.85 
 
 		 1162 aa  91.7  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  29.44 
 
 		 939 aa  91.3  7e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45399  predicted protein  29.41 
 
 		 916 aa  85.5  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1666  peptidase M16-like  27.92 
 
 		 945 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08044  a-pheromone processing metallopeptidase Ste23 (AFU_orthologue; AFUA_5G02010)  26.83 
 
 		 1100 aa  82.4  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.356116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  27.04 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  28.85 
 
 		 853 aa  82.8  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  29.59 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0619  peptidase M16 domain-containing protein  28.09 
 
 		 474 aa  81.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  30.23 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  31.6 
 
 		 489 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  27.92 
 
 		 476 aa  78.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  33.85 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1444  processing peptidase  27.17 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1147  peptidase M16 domain protein  26.01 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  26.23 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  29.63 
 
 		 461 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  29.39 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  28.94 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14700  predicted Zn-dependent peptidase  28.12 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.2427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  30.48 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  30.43 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  31.96 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0767  peptidase M16 domain protein  25.32 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.276188  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  26.98 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  26.98 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  32.14 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  24.92 
 
 		 438 aa  73.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3238  peptidase M16 domain-containing protein  29.9 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47985  predicted protein  27.44 
 
 		 932 aa  72  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  22.44 
 
 		 422 aa  72  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  24.04 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  33.03 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>