More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2671 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3155  zinc metallopeptidase  38.08 
 
 		 936 aa  684    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3083  M16 family peptidase  72.73 
 
 		 929 aa  1454    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2455  peptidase M16 domain-containing protein  73.7 
 
 		 929 aa  1460    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2850  peptidase M16 domain-containing protein  73.7 
 
 		 929 aa  1461    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2756  peptidase M16 domain-containing protein  73.59 
 
 		 929 aa  1459    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1634  peptidase M16 domain-containing protein  70.72 
 
 		 929 aa  1392    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.554729  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2420  peptidase M16 domain-containing protein  71.07 
 
 		 925 aa  1377    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1660  peptidase insulinase family protein  44.4 
 
 		 939 aa  859    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002859  peptidase insulinase family  44.47 
 
 		 925 aa  850    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03118  hypothetical protein  43.96 
 
 		 904 aa  823    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2592  peptidase M16 domain-containing protein  68.35 
 
 		 929 aa  1345    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1533  peptidase M16-like protein  72.86 
 
 		 929 aa  1450    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2773  peptidase M16 domain-containing protein  73.81 
 
 		 929 aa  1464    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.368865  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3021  peptidase M16 domain-containing protein  70.29 
 
 		 929 aa  1400    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1412  Insulysin  73.16 
 
 		 929 aa  1462    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528026  normal  0.896637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1477  peptidase M16 domain-containing protein  73.16 
 
 		 929 aa  1464    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.602507  normal  0.234952 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2671  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 929 aa  1943    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1465  peptidase M16 domain-containing protein  72.94 
 
 		 929 aa  1454    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1603  peptidase M16 domain protein  73.81 
 
 		 929 aa  1464    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2163  M16 family peptidase  69.5 
 
 		 929 aa  1366    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.744451  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1666  peptidase M16-like  33.85 
 
 		 945 aa  596  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2134  zinc metallopeptidase  36.78 
 
 		 968 aa  594  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02695  peptidase, M16 family protein  33.93 
 
 		 915 aa  551  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0492613  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3023  peptidase M16-like protein  32.14 
 
 		 941 aa  524  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00252323  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2509  peptidase M16 domain-containing protein  33.22 
 
 		 947 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2863  peptidase M16 domain-containing protein  31.91 
 
 		 963 aa  457  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000086513 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08044  a-pheromone processing metallopeptidase Ste23 (AFU_orthologue; AFUA_5G02010)  30 
 
 		 1100 aa  431  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.356116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18335  predicted protein  30.47 
 
 		 995 aa  414  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3480  peptidase M16 domain-containing protein  28.64 
 
 		 958 aa  405  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56201 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05710  insulin degrading enzyme, putative  28.51 
 
 		 1162 aa  385  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3390  peptidase M16 domain protein  29.29 
 
 		 982 aa  385  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3190  Pitrilysin  28.59 
 
 		 967 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434447  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0913  peptidase M16 domain protein  29.15 
 
 		 986 aa  379  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56651  predicted protein  28.1 
 
 		 1074 aa  375  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.798232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3079  Pitrilysin  28.36 
 
 		 946 aa  371  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3815  peptidase M16 domain-containing protein  28.02 
 
 		 962 aa  363  8e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0788727 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1042  peptidase M16 domain-containing protein  27.98 
 
 		 962 aa  359  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.923143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0990  protease III  27.87 
 
 		 962 aa  357  7.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3232  protease III precursor  27.87 
 
 		 962 aa  357  7.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.730606 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3008  Pitrilysin  27.71 
 
 		 981 aa  351  4e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3141  protease 3  27.52 
 
 		 962 aa  350  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3207  protease 3  27.52 
 
 		 962 aa  349  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50598  predicted protein  27.59 
 
 		 1008 aa  349  1e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732398  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3321  protease 3  27.52 
 
 		 962 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328834 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45399  predicted protein  27.3 
 
 		 916 aa  347  5e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3158  protease 3  27.52 
 
 		 962 aa  347  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.782979  normal  0.694921 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  27.55 
 
 		 962 aa  344  4e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.436713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  27.55 
 
 		 962 aa  344  5e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  27.44 
 
 		 962 aa  342  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  27.44 
 
 		 962 aa  342  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  27.44 
 
 		 962 aa  342  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  27.44 
 
 		 962 aa  342  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3221  protease 3  27.41 
 
 		 962 aa  342  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405779 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02669  protease III  27.44 
 
 		 962 aa  342  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  27.44 
 
 		 962 aa  342  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3264  peptidase M16 domain-containing protein  26.96 
 
 		 960 aa  341  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  27.32 
 
 		 962 aa  340  8e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_267  predicted protein  30.18 
 
 		 952 aa  277  8e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0986316  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47929  predicted protein  30.19 
 
 		 1272 aa  219  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  23.96 
 
 		 939 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5156  pqqF protein. metallo peptidase. MEROPS family M16A  31.99 
 
 		 808 aa  160  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326749 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28795  predicted protein  22 
 
 		 1246 aa  148  6e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.923761  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4669  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  29.83 
 
 		 762 aa  146  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0514  coenzyme PQQ synthesis protein F  29.9 
 
 		 779 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3322  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  27.34 
 
 		 763 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39010  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  27.3 
 
 		 775 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0405  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  32.02 
 
 		 809 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458439  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0381  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  31.68 
 
 		 766 aa  125  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47985  predicted protein  26.88 
 
 		 932 aa  123  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0409  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  31.03 
 
 		 766 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4822  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  31.68 
 
 		 760 aa  118  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1937  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  26.21 
 
 		 794 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.979365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41610  coenzyme PQQ biosynthesis protein F  27.18 
 
 		 843 aa  105  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  24.17 
 
 		 419 aa  105  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  24.83 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  23.51 
 
 		 419 aa  97.4  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  24.57 
 
 		 423 aa  90.5  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  24.63 
 
 		 489 aa  90.5  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  26.98 
 
 		 514 aa  89.4  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  26.82 
 
 		 469 aa  88.6  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  28 
 
 		 441 aa  88.2  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  28 
 
 		 441 aa  88.2  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  27.41 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  24.61 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  27.51 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  26.94 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  24.73 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2732  peptidase M16 domain protein  25.66 
 
 		 408 aa  84  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  24.29 
 
 		 461 aa  84  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0704  peptidase M16 domain protein  24.6 
 
 		 411 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0496  processing peptidase  24.51 
 
 		 903 aa  83.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000425054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4342  peptidase M16-like  26.28 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  26.16 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  22.5 
 
 		 945 aa  82.8  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  25.17 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  26.16 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  26.57 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  27.06 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  28.78 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  23.84 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>