More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0405 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0381  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  96.34 
 
 		 766 aa  1462    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4822  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  70.7 
 
 		 760 aa  1030    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0405  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  100 
 
 		 809 aa  1603    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0409  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  81.98 
 
 		 766 aa  1204    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5156  pqqF protein. metallo peptidase. MEROPS family M16A  40.57 
 
 		 808 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0514  coenzyme PQQ synthesis protein F  42.21 
 
 		 779 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4669  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  42.04 
 
 		 762 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39010  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  37.05 
 
 		 775 aa  292  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3322  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  35.01 
 
 		 763 aa  267  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149192  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1937  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  43.9 
 
 		 794 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.979365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41610  coenzyme PQQ biosynthesis protein F  40.85 
 
 		 843 aa  152  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1660  peptidase insulinase family protein  29.01 
 
 		 939 aa  136  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3023  peptidase M16-like protein  32.08 
 
 		 941 aa  134  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00252323  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1412  Insulysin  29.63 
 
 		 929 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528026  normal  0.896637 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1465  peptidase M16 domain-containing protein  29.63 
 
 		 929 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1477  peptidase M16 domain-containing protein  29.63 
 
 		 929 aa  132  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.602507  normal  0.234952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3155  zinc metallopeptidase  33.33 
 
 		 936 aa  130  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2455  peptidase M16 domain-containing protein  30.3 
 
 		 929 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3083  M16 family peptidase  29.63 
 
 		 929 aa  128  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2850  peptidase M16 domain-containing protein  29.97 
 
 		 929 aa  129  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2773  peptidase M16 domain-containing protein  29.97 
 
 		 929 aa  128  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.368865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1603  peptidase M16 domain protein  29.97 
 
 		 929 aa  128  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2756  peptidase M16 domain-containing protein  29.97 
 
 		 929 aa  128  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2671  peptidase M16 domain-containing protein  32.02 
 
 		 929 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2509  peptidase M16 domain-containing protein  29.19 
 
 		 947 aa  126  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2134  zinc metallopeptidase  31.6 
 
 		 968 aa  120  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002859  peptidase insulinase family  33.17 
 
 		 925 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  29.63 
 
 		 962 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.436713 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02669  protease III  30 
 
 		 962 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  30 
 
 		 962 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  29.63 
 
 		 962 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  29.63 
 
 		 962 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  29.63 
 
 		 962 aa  118  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  29.63 
 
 		 962 aa  118  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  29.63 
 
 		 962 aa  118  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2592  peptidase M16 domain-containing protein  31.07 
 
 		 929 aa  118  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2863  peptidase M16 domain-containing protein  30.73 
 
 		 963 aa  118  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000086513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  29.63 
 
 		 962 aa  118  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2420  peptidase M16 domain-containing protein  33.8 
 
 		 925 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1634  peptidase M16 domain-containing protein  33.01 
 
 		 929 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.554729  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3079  Pitrilysin  35.29 
 
 		 946 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1533  peptidase M16-like protein  32.04 
 
 		 929 aa  115  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3021  peptidase M16 domain-containing protein  31.86 
 
 		 929 aa  115  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2163  M16 family peptidase  28.33 
 
 		 929 aa  112  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.744451  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3190  Pitrilysin  35.1 
 
 		 967 aa  111  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434447  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05710  insulin degrading enzyme, putative  26.87 
 
 		 1162 aa  110  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3158  protease 3  28.57 
 
 		 962 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.782979  normal  0.694921 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03118  hypothetical protein  32.8 
 
 		 904 aa  108  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3207  protease 3  28.23 
 
 		 962 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3321  protease 3  28.23 
 
 		 962 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3221  protease 3  28.23 
 
 		 962 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405779 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3141  protease 3  28.23 
 
 		 962 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3390  peptidase M16 domain protein  32.54 
 
 		 982 aa  106  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3480  peptidase M16 domain-containing protein  27.41 
 
 		 958 aa  107  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56201 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3815  peptidase M16 domain-containing protein  31.42 
 
 		 962 aa  105  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0788727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0913  peptidase M16 domain protein  30.77 
 
 		 986 aa  103  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18335  predicted protein  29.86 
 
 		 995 aa  101  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08044  a-pheromone processing metallopeptidase Ste23 (AFU_orthologue; AFUA_5G02010)  24.51 
 
 		 1100 aa  100  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.356116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3264  peptidase M16 domain-containing protein  32.37 
 
 		 960 aa  100  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0990  protease III  32.02 
 
 		 962 aa  98.2  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3232  protease III precursor  32.02 
 
 		 962 aa  98.2  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.730606 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1042  peptidase M16 domain-containing protein  32.02 
 
 		 962 aa  98.2  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.923143  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56651  predicted protein  26.85 
 
 		 1074 aa  97.8  7e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.798232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02695  peptidase, M16 family protein  26.92 
 
 		 915 aa  96.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0492613  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3008  Pitrilysin  30.53 
 
 		 981 aa  95.5  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_267  predicted protein  30.99 
 
 		 952 aa  94  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0986316  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0619  peptidase M16 domain-containing protein  31.74 
 
 		 474 aa  92.8  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45399  predicted protein  29.41 
 
 		 916 aa  87.4  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  27.93 
 
 		 939 aa  86.7  0.000000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47929  predicted protein  30 
 
 		 1272 aa  85.5  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  27.83 
 
 		 466 aa  85.5  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1444  processing peptidase  27.43 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1613  peptidase M16 domain-containing protein  25.85 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  28.04 
 
 		 419 aa  83.2  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  27.71 
 
 		 422 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  28.1 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  27.51 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50598  predicted protein  28.57 
 
 		 1008 aa  81.3  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1666  peptidase M16-like  25.69 
 
 		 945 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  26.89 
 
 		 462 aa  80.1  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  28.1 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  28.1 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  28.1 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  28.1 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  28.1 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2676  peptidase M16 domain protein  23.16 
 
 		 457 aa  79.7  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal  0.552132 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  28.1 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0576  peptidase M16-like  30.33 
 
 		 473 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0611  peptidase M16 domain protein  30.33 
 
 		 473 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  28.1 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  28.1 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  26.94 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  29.17 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  28.1 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0603  peptidase M16 domain protein  30.66 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  27.27 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28795  predicted protein  27.9 
 
 		 1246 aa  79  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.923761  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  26.83 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  25.93 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3238  peptidase M16 domain-containing protein  31.46 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>