More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1937 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1937  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  100 
 
 		 794 aa  1517    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.979365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5156  pqqF protein. metallo peptidase. MEROPS family M16A  35.35 
 
 		 808 aa  347  5e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39010  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  38.86 
 
 		 775 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4822  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  35.2 
 
 		 760 aa  301  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0381  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  35.39 
 
 		 766 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0514  coenzyme PQQ synthesis protein F  33 
 
 		 779 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0409  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  34.89 
 
 		 766 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0405  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  36.38 
 
 		 809 aa  276  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3322  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  46.87 
 
 		 763 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149192  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4669  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  40.17 
 
 		 762 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41610  coenzyme PQQ biosynthesis protein F  43.89 
 
 		 843 aa  138  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2863  peptidase M16 domain-containing protein  23.36 
 
 		 963 aa  124  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000086513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2671  peptidase M16 domain-containing protein  26.21 
 
 		 929 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3023  peptidase M16-like protein  31.56 
 
 		 941 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00252323  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2592  peptidase M16 domain-containing protein  28.12 
 
 		 929 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3021  peptidase M16 domain-containing protein  28.96 
 
 		 929 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3480  peptidase M16 domain-containing protein  32.11 
 
 		 958 aa  107  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56201 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2455  peptidase M16 domain-containing protein  27.12 
 
 		 929 aa  107  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1634  peptidase M16 domain-containing protein  27.16 
 
 		 929 aa  107  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.554729  normal  0.391625 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02669  protease III  31.8 
 
 		 962 aa  107  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  31.8 
 
 		 962 aa  106  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  31.8 
 
 		 962 aa  107  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.436713 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  31.8 
 
 		 962 aa  107  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  31.8 
 
 		 962 aa  107  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  31.8 
 
 		 962 aa  106  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  31.8 
 
 		 962 aa  106  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  31.8 
 
 		 962 aa  107  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2420  peptidase M16 domain-containing protein  28.94 
 
 		 925 aa  107  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  31.8 
 
 		 962 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2509  peptidase M16 domain-containing protein  26.97 
 
 		 947 aa  106  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244446  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3190  Pitrilysin  34.31 
 
 		 967 aa  105  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434447  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1533  peptidase M16-like protein  26.16 
 
 		 929 aa  104  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1477  peptidase M16 domain-containing protein  30.96 
 
 		 929 aa  104  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.602507  normal  0.234952 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1465  peptidase M16 domain-containing protein  30.96 
 
 		 929 aa  104  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987023 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1660  peptidase insulinase family protein  27.15 
 
 		 939 aa  104  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3815  peptidase M16 domain-containing protein  30.6 
 
 		 962 aa  103  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0788727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2163  M16 family peptidase  29.9 
 
 		 929 aa  103  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.744451  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1412  Insulysin  30.46 
 
 		 929 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528026  normal  0.896637 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3390  peptidase M16 domain protein  31.22 
 
 		 982 aa  101  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3083  M16 family peptidase  30.46 
 
 		 929 aa  101  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3079  Pitrilysin  31.31 
 
 		 946 aa  101  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3207  protease 3  30.99 
 
 		 962 aa  99.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3141  protease 3  30.99 
 
 		 962 aa  99  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3221  protease 3  30.99 
 
 		 962 aa  99  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405779 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0913  peptidase M16 domain protein  30.88 
 
 		 986 aa  98.6  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3158  protease 3  30.99 
 
 		 962 aa  98.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.782979  normal  0.694921 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18335  predicted protein  28.22 
 
 		 995 aa  98.6  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3155  zinc metallopeptidase  31.43 
 
 		 936 aa  98.6  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1603  peptidase M16 domain protein  29.95 
 
 		 929 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2756  peptidase M16 domain-containing protein  29.95 
 
 		 929 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2773  peptidase M16 domain-containing protein  29.95 
 
 		 929 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.368865  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2850  peptidase M16 domain-containing protein  29.95 
 
 		 929 aa  97.8  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196347 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3321  protease 3  30.52 
 
 		 962 aa  97.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328834 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2134  zinc metallopeptidase  26.25 
 
 		 968 aa  96.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002859  peptidase insulinase family  27.92 
 
 		 925 aa  94  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05710  insulin degrading enzyme, putative  27.31 
 
 		 1162 aa  93.6  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02695  peptidase, M16 family protein  24.86 
 
 		 915 aa  94  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0492613  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3264  peptidase M16 domain-containing protein  30.66 
 
 		 960 aa  94  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03118  hypothetical protein  29.83 
 
 		 904 aa  92.8  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3008  Pitrilysin  29.49 
 
 		 981 aa  91.7  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47929  predicted protein  31.6 
 
 		 1272 aa  90.5  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3232  protease III precursor  28.02 
 
 		 962 aa  90.1  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.730606 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1042  peptidase M16 domain-containing protein  28.02 
 
 		 962 aa  90.1  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.923143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0990  protease III  28.02 
 
 		 962 aa  90.1  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28795  predicted protein  27.97 
 
 		 1246 aa  90.1  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.923761  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56651  predicted protein  28.14 
 
 		 1074 aa  88.6  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.798232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  27.61 
 
 		 868 aa  88.2  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  27.6 
 
 		 422 aa  87.8  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  30.2 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  28.72 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  29.26 
 
 		 419 aa  84  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  33.63 
 
 		 937 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  24.44 
 
 		 939 aa  82  0.00000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  25 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1666  peptidase M16-like  22.84 
 
 		 945 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0619  peptidase M16 domain-containing protein  31.14 
 
 		 474 aa  81.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0576  peptidase M16-like  32.83 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0611  peptidase M16 domain protein  32.32 
 
 		 473 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50598  predicted protein  31.71 
 
 		 1008 aa  79.3  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732398  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_267  predicted protein  30.58 
 
 		 952 aa  79.3  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0986316  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  27.66 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  25.91 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29535  predicted protein  29.25 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00887655 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0603  peptidase M16 domain protein  32.32 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  27.7 
 
 		 420 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45399  predicted protein  31.29 
 
 		 916 aa  76.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  27.66 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4194  peptidase M16 domain protein  30.1 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4233  peptidase M16 domain protein  30.1 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835158 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3824  peptidase M16 domain-containing protein  30.81 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000529085 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0177  peptidase M16 domain protein  28.79 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  27.62 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  28.11 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10171  Zn-dependent peptidase  26.87 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.109713 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  27.5 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1414  processing peptidase  32.16 
 
 		 410 aa  73.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.186097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1419  processing peptidase  23.38 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  25.5 
 
 		 461 aa  73.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  26.9 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0397  peptidase M16 domain-containing protein  27.31 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>