More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3079 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3079  Pitrilysin  100 
 
 
946 aa  1912    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0913  peptidase M16 domain protein  35.57 
 
 
986 aa  572  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3008  Pitrilysin  36.02 
 
 
981 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3815  peptidase M16 domain-containing protein  35.83 
 
 
962 aa  564  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0788727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3190  Pitrilysin  36.18 
 
 
967 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434447  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3390  peptidase M16 domain protein  35.5 
 
 
982 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1042  peptidase M16 domain-containing protein  34.92 
 
 
962 aa  551  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.923143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0990  protease III  34.82 
 
 
962 aa  549  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3232  protease III precursor  34.82 
 
 
962 aa  549  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.730606 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3480  peptidase M16 domain-containing protein  34.6 
 
 
958 aa  532  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.56201 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3264  peptidase M16 domain-containing protein  34.26 
 
 
960 aa  526  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02669  protease III  33.51 
 
 
962 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  33.55 
 
 
962 aa  519  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.436713 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  33.51 
 
 
962 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  33.74 
 
 
962 aa  514  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  33.74 
 
 
962 aa  514  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  33.63 
 
 
962 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  33.74 
 
 
962 aa  514  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  33.52 
 
 
962 aa  513  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  33.85 
 
 
962 aa  516  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3141  protease 3  32.61 
 
 
962 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3158  protease 3  32.83 
 
 
962 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.782979  normal  0.694921 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3207  protease 3  32.83 
 
 
962 aa  509  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3321  protease 3  32.61 
 
 
962 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.328834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3221  protease 3  32.51 
 
 
962 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.405779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1660  peptidase insulinase family protein  29.72 
 
 
939 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3023  peptidase M16-like protein  32.69 
 
 
941 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00252323  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2756  peptidase M16 domain-containing protein  30.27 
 
 
929 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1603  peptidase M16 domain protein  30.16 
 
 
929 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2850  peptidase M16 domain-containing protein  30.16 
 
 
929 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2773  peptidase M16 domain-containing protein  30.27 
 
 
929 aa  403  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.368865  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002859  peptidase insulinase family  29.01 
 
 
925 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3083  M16 family peptidase  29.59 
 
 
929 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3021  peptidase M16 domain-containing protein  28.41 
 
 
929 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1412  Insulysin  29.37 
 
 
929 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528026  normal  0.896637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1477  peptidase M16 domain-containing protein  29.59 
 
 
929 aa  393  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.602507  normal  0.234952 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1465  peptidase M16 domain-containing protein  29.25 
 
 
929 aa  392  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1634  peptidase M16 domain-containing protein  29.58 
 
 
929 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.554729  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2420  peptidase M16 domain-containing protein  29.19 
 
 
925 aa  389  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2455  peptidase M16 domain-containing protein  29.95 
 
 
929 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1533  peptidase M16-like protein  28.95 
 
 
929 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2592  peptidase M16 domain-containing protein  28.56 
 
 
929 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03118  hypothetical protein  28.62 
 
 
904 aa  381  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2163  M16 family peptidase  29.47 
 
 
929 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.744451  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2671  peptidase M16 domain-containing protein  28.38 
 
 
929 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2509  peptidase M16 domain-containing protein  29.35 
 
 
947 aa  359  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2134  zinc metallopeptidase  27.2 
 
 
968 aa  347  5e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3155  zinc metallopeptidase  25.48 
 
 
936 aa  328  3e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2863  peptidase M16 domain-containing protein  26.31 
 
 
963 aa  306  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000086513 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02695  peptidase, M16 family protein  27.78 
 
 
915 aa  300  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0492613  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08044  a-pheromone processing metallopeptidase Ste23 (AFU_orthologue; AFUA_5G02010)  27.13 
 
 
1100 aa  273  8.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.356116  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18335  predicted protein  27.38 
 
 
995 aa  265  4e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1666  peptidase M16-like  26.22 
 
 
945 aa  261  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56651  predicted protein  25.77 
 
 
1074 aa  245  3e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.798232  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50598  predicted protein  27 
 
 
1008 aa  243  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732398  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_267  predicted protein  28.59 
 
 
952 aa  239  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0986316  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05710  insulin degrading enzyme, putative  25.59 
 
 
1162 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45399  predicted protein  24.22 
 
 
916 aa  214  7e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47929  predicted protein  32.16 
 
 
1272 aa  213  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  23.58 
 
 
939 aa  170  1e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0514  coenzyme PQQ synthesis protein F  38.86 
 
 
779 aa  144  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3322  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  32.95 
 
 
763 aa  142  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149192  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4669  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  32.76 
 
 
762 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39010  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  38.32 
 
 
775 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5156  pqqF protein. metallo peptidase. MEROPS family M16A  36.32 
 
 
808 aa  125  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.326749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0381  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  36.13 
 
 
766 aa  125  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0409  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  37.32 
 
 
766 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0405  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  36.45 
 
 
809 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458439  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4822  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  32.91 
 
 
760 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41610  coenzyme PQQ biosynthesis protein F  36.79 
 
 
843 aa  108  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28795  predicted protein  29.6 
 
 
1246 aa  107  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.923761  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1937  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  31.31 
 
 
794 aa  104  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.979365 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47985  predicted protein  25.32 
 
 
932 aa  95.5  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  26.09 
 
 
419 aa  94  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  31.41 
 
 
419 aa  93.2  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  26.76 
 
 
419 aa  92.8  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  26.12 
 
 
461 aa  90.1  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  24.42 
 
 
441 aa  88.6  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  25.68 
 
 
443 aa  87.8  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3616  peptidase M16 domain protein  32.47 
 
 
425 aa  87  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  28.37 
 
 
941 aa  87  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  28.53 
 
 
513 aa  86.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  25.77 
 
 
443 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  25.59 
 
 
504 aa  82.8  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  26.71 
 
 
470 aa  82.4  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  23.64 
 
 
442 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1986  processing protease  25.37 
 
 
440 aa  80.5  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  27.08 
 
 
514 aa  80.5  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  26.9 
 
 
461 aa  80.5  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  25.54 
 
 
439 aa  80.1  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0397  peptidase M16 domain-containing protein  22.71 
 
 
431 aa  80.1  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  26.37 
 
 
443 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  25.99 
 
 
467 aa  80.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3360  M16 family peptidase  32.57 
 
 
439 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  26.12 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  26.12 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  26.12 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  26.12 
 
 
479 aa  79  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  26.46 
 
 
443 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  26.46 
 
 
443 aa  78.6  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>