More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4669 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0514  coenzyme PQQ synthesis protein F  70.62 
 
 		 779 aa  1082    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4669  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  100 
 
 		 762 aa  1540    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5156  pqqF protein. metallo peptidase. MEROPS family M16A  47.65 
 
 		 808 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0409  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  42.58 
 
 		 766 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4822  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  41.47 
 
 		 760 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0381  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  42.63 
 
 		 766 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0405  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  41.51 
 
 		 809 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39010  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  35.28 
 
 		 775 aa  334  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3322  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  34.63 
 
 		 763 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149192  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1937  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  40.17 
 
 		 794 aa  213  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.979365 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1477  peptidase M16 domain-containing protein  33.79 
 
 		 929 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.602507  normal  0.234952 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2455  peptidase M16 domain-containing protein  32.66 
 
 		 929 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2420  peptidase M16 domain-containing protein  33.12 
 
 		 925 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1533  peptidase M16-like protein  32.76 
 
 		 929 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1465  peptidase M16 domain-containing protein  32.44 
 
 		 929 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987023 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2850  peptidase M16 domain-containing protein  32.11 
 
 		 929 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2756  peptidase M16 domain-containing protein  32.11 
 
 		 929 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1412  Insulysin  33.45 
 
 		 929 aa  154  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528026  normal  0.896637 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1603  peptidase M16 domain protein  32.11 
 
 		 929 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2773  peptidase M16 domain-containing protein  32.11 
 
 		 929 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.368865  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3021  peptidase M16 domain-containing protein  32.32 
 
 		 929 aa  150  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3083  M16 family peptidase  33.11 
 
 		 929 aa  150  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1660  peptidase insulinase family protein  31.19 
 
 		 939 aa  146  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2671  peptidase M16 domain-containing protein  29.83 
 
 		 929 aa  146  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41610  coenzyme PQQ biosynthesis protein F  33.14 
 
 		 843 aa  145  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3023  peptidase M16-like protein  30.67 
 
 		 941 aa  145  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00252323  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2592  peptidase M16 domain-containing protein  31.76 
 
 		 929 aa  144  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2863  peptidase M16 domain-containing protein  29.13 
 
 		 963 aa  142  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000086513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3155  zinc metallopeptidase  37.98 
 
 		 936 aa  140  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3480  peptidase M16 domain-containing protein  30.36 
 
 		 958 aa  140  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56201 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1634  peptidase M16 domain-containing protein  37.38 
 
 		 929 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.554729  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3079  Pitrilysin  32.76 
 
 		 946 aa  135  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2163  M16 family peptidase  32.66 
 
 		 929 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.744451  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2509  peptidase M16 domain-containing protein  29.07 
 
 		 947 aa  132  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244446  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  35.24 
 
 		 962 aa  130  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.436713 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02669  protease III  35.24 
 
 		 962 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  35.24 
 
 		 962 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  35.24 
 
 		 962 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  35.24 
 
 		 962 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  35.24 
 
 		 962 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  35.24 
 
 		 962 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  35.24 
 
 		 962 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  35.24 
 
 		 962 aa  130  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3390  peptidase M16 domain protein  30.77 
 
 		 982 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002859  peptidase insulinase family  29.33 
 
 		 925 aa  127  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0913  peptidase M16 domain protein  30.43 
 
 		 986 aa  127  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3190  Pitrilysin  33.74 
 
 		 967 aa  126  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434447  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3221  protease 3  30.36 
 
 		 962 aa  124  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405779 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3141  protease 3  30.36 
 
 		 962 aa  124  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3008  Pitrilysin  30.83 
 
 		 981 aa  124  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3207  protease 3  30.36 
 
 		 962 aa  124  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3158  protease 3  30.36 
 
 		 962 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.782979  normal  0.694921 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3815  peptidase M16 domain-containing protein  34.62 
 
 		 962 aa  122  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0788727 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3321  protease 3  30.03 
 
 		 962 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328834 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3264  peptidase M16 domain-containing protein  32.66 
 
 		 960 aa  119  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03118  hypothetical protein  29.05 
 
 		 904 aa  117  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18335  predicted protein  32.08 
 
 		 995 aa  116  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02695  peptidase, M16 family protein  28.24 
 
 		 915 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0492613  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3232  protease III precursor  32.86 
 
 		 962 aa  114  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.730606 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1042  peptidase M16 domain-containing protein  32.86 
 
 		 962 aa  114  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.923143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0990  protease III  32.86 
 
 		 962 aa  114  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2134  zinc metallopeptidase  31.19 
 
 		 968 aa  114  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56651  predicted protein  26.55 
 
 		 1074 aa  108  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.798232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28795  predicted protein  31.43 
 
 		 1246 aa  100  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.923761  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47929  predicted protein  32.45 
 
 		 1272 aa  100  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05710  insulin degrading enzyme, putative  25.07 
 
 		 1162 aa  99  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50598  predicted protein  31.8 
 
 		 1008 aa  95.1  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1666  peptidase M16-like  26.43 
 
 		 945 aa  92.4  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  29.81 
 
 		 939 aa  90.5  1e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  29.55 
 
 		 853 aa  87.8  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0619  peptidase M16 domain-containing protein  27.57 
 
 		 474 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_267  predicted protein  29.46 
 
 		 952 aa  84.3  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0986316  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  25.85 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0576  peptidase M16-like  27.45 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0611  peptidase M16 domain protein  27.45 
 
 		 473 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  25.62 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0603  peptidase M16 domain protein  27.17 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45399  predicted protein  24.65 
 
 		 916 aa  81.6  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  25.62 
 
 		 419 aa  80.1  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  25.5 
 
 		 466 aa  80.1  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  31.07 
 
 		 463 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4309  peptidase M16-like  25.13 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  29.58 
 
 		 461 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  30.35 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  28.32 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  23.05 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  29.58 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08044  a-pheromone processing metallopeptidase Ste23 (AFU_orthologue; AFUA_5G02010)  25.62 
 
 		 1100 aa  77  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.356116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  29.44 
 
 		 868 aa  77  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  25.52 
 
 		 422 aa  76.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  31.41 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1147  peptidase M16 domain protein  25.74 
 
 		 420 aa  76.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3238  peptidase M16 domain-containing protein  28.5 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3360  M16 family peptidase  34.18 
 
 		 439 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1699  M16 family peptidase  30.23 
 
 		 872 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  30.26 
 
 		 464 aa  73.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  23.92 
 
 		 438 aa  73.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  29.28 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0767  peptidase M16 domain protein  23.65 
 
 		 415 aa  73.2  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.276188  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  31.28 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>