More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3041 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02669  protease III  99.27 
 
 		 962 aa  1973    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  99.48 
 
 		 962 aa  1977    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0913  peptidase M16 domain protein  64.04 
 
 		 986 aa  1288    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3158  protease 3  88.77 
 
 		 962 aa  1801    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.782979  normal  0.694921 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  99.48 
 
 		 962 aa  1977    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1042  peptidase M16 domain-containing protein  62.97 
 
 		 962 aa  1255    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.923143  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3264  peptidase M16 domain-containing protein  83.25 
 
 		 960 aa  1697    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  99.48 
 
 		 962 aa  1977    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3232  protease III precursor  62.87 
 
 		 962 aa  1251    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.730606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3190  Pitrilysin  60.67 
 
 		 967 aa  1224    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434447  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3390  peptidase M16 domain protein  63.3 
 
 		 982 aa  1275    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3008  Pitrilysin  59.79 
 
 		 981 aa  1218    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  99.27 
 
 		 962 aa  1973    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  99.17 
 
 		 962 aa  1971    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.436713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  99.48 
 
 		 962 aa  1976    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3321  protease 3  88.88 
 
 		 962 aa  1801    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328834 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  100 
 
 		 962 aa  1986    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0990  protease III  62.87 
 
 		 962 aa  1251    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3221  protease 3  88.98 
 
 		 962 aa  1787    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405779 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3207  protease 3  88.98 
 
 		 962 aa  1804    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3815  peptidase M16 domain-containing protein  67.16 
 
 		 962 aa  1348    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0788727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  99.79 
 
 		 962 aa  1982    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3141  protease 3  89.09 
 
 		 962 aa  1807    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3079  Pitrilysin  33.55 
 
 		 946 aa  505  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3480  peptidase M16 domain-containing protein  29.12 
 
 		 958 aa  411  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56201 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2509  peptidase M16 domain-containing protein  29.87 
 
 		 947 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244446  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2420  peptidase M16 domain-containing protein  29.28 
 
 		 925 aa  356  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2455  peptidase M16 domain-containing protein  28.7 
 
 		 929 aa  347  5e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1477  peptidase M16 domain-containing protein  28.73 
 
 		 929 aa  344  5e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.602507  normal  0.234952 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1603  peptidase M16 domain protein  28.72 
 
 		 929 aa  343  8e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2773  peptidase M16 domain-containing protein  28.6 
 
 		 929 aa  343  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.368865  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2134  zinc metallopeptidase  27.17 
 
 		 968 aa  342  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1412  Insulysin  28.51 
 
 		 929 aa  342  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528026  normal  0.896637 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2850  peptidase M16 domain-containing protein  28.6 
 
 		 929 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2756  peptidase M16 domain-containing protein  28.49 
 
 		 929 aa  341  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3023  peptidase M16-like protein  28.11 
 
 		 941 aa  339  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00252323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3083  M16 family peptidase  28.12 
 
 		 929 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2163  M16 family peptidase  28.24 
 
 		 929 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.744451  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1465  peptidase M16 domain-containing protein  28.17 
 
 		 929 aa  337  7e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987023 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1533  peptidase M16-like protein  26.87 
 
 		 929 aa  337  9e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002859  peptidase insulinase family  27.89 
 
 		 925 aa  336  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3021  peptidase M16 domain-containing protein  28.45 
 
 		 929 aa  335  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1634  peptidase M16 domain-containing protein  27.44 
 
 		 929 aa  335  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.554729  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2671  peptidase M16 domain-containing protein  27.32 
 
 		 929 aa  331  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1660  peptidase insulinase family protein  26.63 
 
 		 939 aa  327  5e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2592  peptidase M16 domain-containing protein  26.28 
 
 		 929 aa  325  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03118  hypothetical protein  27.1 
 
 		 904 aa  314  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2863  peptidase M16 domain-containing protein  27.06 
 
 		 963 aa  312  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000086513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3155  zinc metallopeptidase  25.58 
 
 		 936 aa  309  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56651  predicted protein  26.6 
 
 		 1074 aa  306  1.0000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.798232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02695  peptidase, M16 family protein  25.81 
 
 		 915 aa  302  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0492613  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08044  a-pheromone processing metallopeptidase Ste23 (AFU_orthologue; AFUA_5G02010)  25.35 
 
 		 1100 aa  290  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.356116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1666  peptidase M16-like  25.03 
 
 		 945 aa  273  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05710  insulin degrading enzyme, putative  26.19 
 
 		 1162 aa  271  4e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50598  predicted protein  24.95 
 
 		 1008 aa  258  3e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732398  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18335  predicted protein  24.95 
 
 		 995 aa  242  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45399  predicted protein  23.5 
 
 		 916 aa  214  7.999999999999999e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_267  predicted protein  26.14 
 
 		 952 aa  207  8e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0986316  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  22.63 
 
 		 939 aa  189  2e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47929  predicted protein  28.81 
 
 		 1272 aa  186  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39010  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  29.85 
 
 		 775 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4669  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  35.24 
 
 		 762 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3322  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  29.01 
 
 		 763 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149192  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0409  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  27.86 
 
 		 766 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0514  coenzyme PQQ synthesis protein F  29.26 
 
 		 779 aa  124  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4822  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  26.41 
 
 		 760 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5156  pqqF protein. metallo peptidase. MEROPS family M16A  28.62 
 
 		 808 aa  121  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0381  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  29.97 
 
 		 766 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0405  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  33.99 
 
 		 809 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1937  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  31.8 
 
 		 794 aa  107  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.979365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41610  coenzyme PQQ biosynthesis protein F  36.27 
 
 		 843 aa  105  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47985  predicted protein  25.06 
 
 		 932 aa  100  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28795  predicted protein  25.49 
 
 		 1246 aa  99.8  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.923761  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1986  processing protease  26.65 
 
 		 440 aa  88.2  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  28.27 
 
 		 419 aa  84  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  27.32 
 
 		 419 aa  83.2  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4342  peptidase M16-like  25.79 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  28.12 
 
 		 419 aa  80.1  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  24.93 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  25.45 
 
 		 937 aa  78.2  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0177  peptidase M16 domain protein  27.85 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14700  predicted Zn-dependent peptidase  27.62 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.2427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4309  peptidase M16-like  23.93 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  28.67 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  27.32 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0849  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  27.03 
 
 		 438 aa  73.9  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.745956  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  27.11 
 
 		 422 aa  73.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  27.23 
 
 		 460 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  24.51 
 
 		 424 aa  73.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0678  peptidase M16 domain-containing protein  27.23 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.614007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  26.27 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  26.7 
 
 		 450 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  27.01 
 
 		 450 aa  72  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  26.16 
 
 		 955 aa  71.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00747  Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  27.66 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0838506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  23.03 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  26.16 
 
 		 460 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  27.12 
 
 		 443 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  26.16 
 
 		 460 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  27.6 
 
 		 421 aa  70.1  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>