More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1477 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3155  zinc metallopeptidase  39.22 
 
 
936 aa  699    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3083  M16 family peptidase  96.23 
 
 
929 aa  1870    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1634  peptidase M16 domain-containing protein  74.17 
 
 
929 aa  1454    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.554729  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2455  peptidase M16 domain-containing protein  92.47 
 
 
929 aa  1800    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2850  peptidase M16 domain-containing protein  92.25 
 
 
929 aa  1791    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196347 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1533  peptidase M16-like protein  72.26 
 
 
929 aa  1436    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002859  peptidase insulinase family  46.44 
 
 
925 aa  888    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1603  peptidase M16 domain protein  92.25 
 
 
929 aa  1789    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1412  Insulysin  98.92 
 
 
929 aa  1912    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528026  normal  0.896637 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1660  peptidase insulinase family protein  46.05 
 
 
939 aa  893    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1477  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
929 aa  1929    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.602507  normal  0.234952 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2420  peptidase M16 domain-containing protein  74.65 
 
 
925 aa  1459    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2671  peptidase M16 domain-containing protein  73.16 
 
 
929 aa  1452    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2756  peptidase M16 domain-containing protein  92.25 
 
 
929 aa  1793    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1465  peptidase M16 domain-containing protein  98.17 
 
 
929 aa  1897    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987023 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03118  hypothetical protein  46.81 
 
 
904 aa  865    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2773  peptidase M16 domain-containing protein  92.36 
 
 
929 aa  1795    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.368865  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2163  M16 family peptidase  75.13 
 
 
929 aa  1461    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.744451  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2592  peptidase M16 domain-containing protein  69.86 
 
 
929 aa  1396    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3021  peptidase M16 domain-containing protein  74.49 
 
 
929 aa  1486    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2134  zinc metallopeptidase  37.5 
 
 
968 aa  618  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1666  peptidase M16-like  34.68 
 
 
945 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02695  peptidase, M16 family protein  36.39 
 
 
915 aa  590  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0492613  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2509  peptidase M16 domain-containing protein  33.08 
 
 
947 aa  525  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244446  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3023  peptidase M16-like protein  32.37 
 
 
941 aa  502  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00252323  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2863  peptidase M16 domain-containing protein  31.2 
 
 
963 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000086513 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08044  a-pheromone processing metallopeptidase Ste23 (AFU_orthologue; AFUA_5G02010)  30.36 
 
 
1100 aa  421  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.356116  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56651  predicted protein  29.63 
 
 
1074 aa  401  9.999999999999999e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.798232  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0913  peptidase M16 domain protein  29.84 
 
 
986 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3390  peptidase M16 domain protein  29.98 
 
 
982 aa  399  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3480  peptidase M16 domain-containing protein  29.12 
 
 
958 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.56201 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18335  predicted protein  30 
 
 
995 aa  395  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05710  insulin degrading enzyme, putative  28.63 
 
 
1162 aa  385  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3815  peptidase M16 domain-containing protein  29.39 
 
 
962 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0788727 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3079  Pitrilysin  29.52 
 
 
946 aa  382  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1042  peptidase M16 domain-containing protein  29.06 
 
 
962 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.923143  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3232  protease III precursor  28.95 
 
 
962 aa  375  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.730606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0990  protease III  28.95 
 
 
962 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3190  Pitrilysin  27.99 
 
 
967 aa  364  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3008  Pitrilysin  27.98 
 
 
981 aa  361  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3141  protease 3  29.04 
 
 
962 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3207  protease 3  29.04 
 
 
962 aa  354  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50598  predicted protein  28.16 
 
 
1008 aa  353  5.9999999999999994e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732398  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3321  protease 3  29.04 
 
 
962 aa  353  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.328834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3158  protease 3  29.04 
 
 
962 aa  352  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.782979  normal  0.694921 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45399  predicted protein  27.25 
 
 
916 aa  348  2e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3221  protease 3  28.93 
 
 
962 aa  347  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.405779 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02669  protease III  28.81 
 
 
962 aa  346  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  28.62 
 
 
962 aa  346  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  28.81 
 
 
962 aa  346  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  28.62 
 
 
962 aa  346  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.436713 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  28.51 
 
 
962 aa  344  5e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  28.73 
 
 
962 aa  344  5e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  28.51 
 
 
962 aa  344  5e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  28.51 
 
 
962 aa  344  5e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  28.51 
 
 
962 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3264  peptidase M16 domain-containing protein  28.62 
 
 
960 aa  343  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_267  predicted protein  27.4 
 
 
952 aa  322  1.9999999999999998e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0986316  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47929  predicted protein  34.18 
 
 
1272 aa  243  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  24.03 
 
 
939 aa  206  1e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28795  predicted protein  22.79 
 
 
1246 aa  164  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.923761  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0514  coenzyme PQQ synthesis protein F  29.56 
 
 
779 aa  159  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4669  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  33.79 
 
 
762 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5156  pqqF protein. metallo peptidase. MEROPS family M16A  31.58 
 
 
808 aa  153  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.326749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39010  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  31.21 
 
 
775 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3322  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  31.27 
 
 
763 aa  135  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0381  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  29.97 
 
 
766 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0405  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  33.98 
 
 
809 aa  128  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458439  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0409  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  33.98 
 
 
766 aa  124  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4822  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  32.47 
 
 
760 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47985  predicted protein  27.42 
 
 
932 aa  112  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1937  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  30.96 
 
 
794 aa  105  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.979365 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4342  peptidase M16-like  26.45 
 
 
431 aa  105  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472968  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41610  coenzyme PQQ biosynthesis protein F  30.05 
 
 
843 aa  102  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  25.93 
 
 
419 aa  101  8e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  27.53 
 
 
453 aa  99  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  23.57 
 
 
419 aa  99.4  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4309  peptidase M16-like  25.06 
 
 
413 aa  98.6  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  24.58 
 
 
419 aa  95.5  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3614  peptidase M16 domain protein  24.92 
 
 
424 aa  95.5  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.600859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1986  processing protease  25 
 
 
440 aa  95.1  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4194  peptidase M16 domain protein  27.34 
 
 
424 aa  94.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4233  peptidase M16 domain protein  27.34 
 
 
424 aa  94.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00835158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  25.21 
 
 
431 aa  92.8  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  25.42 
 
 
413 aa  92.8  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1829  peptidase M16 domain protein  22.56 
 
 
984 aa  91.3  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.661414 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0921  peptidase M16 domain protein  26.35 
 
 
427 aa  88.6  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0782213  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0895  peptidase M16 domain protein  26.35 
 
 
427 aa  88.6  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  25.26 
 
 
423 aa  88.2  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  29.26 
 
 
453 aa  87.4  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0364  processing peptidase  25.34 
 
 
413 aa  87.4  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  26.91 
 
 
441 aa  86.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  26.91 
 
 
441 aa  86.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2243  peptidase M16 domain-containing protein  26.33 
 
 
476 aa  87  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193562  normal  0.100659 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  26.98 
 
 
461 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  25.6 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  25.82 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  25.17 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  24.64 
 
 
853 aa  84.7  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  26.17 
 
 
472 aa  84  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>