More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002859 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03118  hypothetical protein  93.25 
 
 
904 aa  1779    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3155  zinc metallopeptidase  40.68 
 
 
936 aa  724    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3083  M16 family peptidase  46.1 
 
 
929 aa  889    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2592  peptidase M16 domain-containing protein  45.56 
 
 
929 aa  882    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2850  peptidase M16 domain-containing protein  45.86 
 
 
929 aa  886    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196347 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1660  peptidase insulinase family protein  72.25 
 
 
939 aa  1427    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002859  peptidase insulinase family  100 
 
 
925 aa  1933    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1533  peptidase M16-like protein  45.72 
 
 
929 aa  869    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1412  Insulysin  46.44 
 
 
929 aa  886    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528026  normal  0.896637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1477  peptidase M16 domain-containing protein  46.44 
 
 
929 aa  888    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.602507  normal  0.234952 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2671  peptidase M16 domain-containing protein  44.47 
 
 
929 aa  840    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2420  peptidase M16 domain-containing protein  46.45 
 
 
925 aa  879    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1465  peptidase M16 domain-containing protein  45.42 
 
 
929 aa  884    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1603  peptidase M16 domain protein  46.61 
 
 
929 aa  885    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1634  peptidase M16 domain-containing protein  44.86 
 
 
929 aa  864    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.554729  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2163  M16 family peptidase  47.81 
 
 
929 aa  905    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.744451  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2773  peptidase M16 domain-containing protein  45.86 
 
 
929 aa  886    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.368865  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2455  peptidase M16 domain-containing protein  45.32 
 
 
929 aa  874    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3021  peptidase M16 domain-containing protein  45.02 
 
 
929 aa  892    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2756  peptidase M16 domain-containing protein  45.86 
 
 
929 aa  886    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2134  zinc metallopeptidase  36.16 
 
 
968 aa  579  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02695  peptidase, M16 family protein  33.11 
 
 
915 aa  538  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0492613  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1666  peptidase M16-like  33.01 
 
 
945 aa  538  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3023  peptidase M16-like protein  33.81 
 
 
941 aa  520  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00252323  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2509  peptidase M16 domain-containing protein  34.92 
 
 
947 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2863  peptidase M16 domain-containing protein  31.62 
 
 
963 aa  451  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000086513 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08044  a-pheromone processing metallopeptidase Ste23 (AFU_orthologue; AFUA_5G02010)  30.23 
 
 
1100 aa  448  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.356116  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05710  insulin degrading enzyme, putative  30.29 
 
 
1162 aa  430  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56651  predicted protein  31.32 
 
 
1074 aa  421  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.798232  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3480  peptidase M16 domain-containing protein  28.4 
 
 
958 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.56201 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18335  predicted protein  29.16 
 
 
995 aa  388  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3079  Pitrilysin  29.05 
 
 
946 aa  389  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3390  peptidase M16 domain protein  27.66 
 
 
982 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3815  peptidase M16 domain-containing protein  28.13 
 
 
962 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0788727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3190  Pitrilysin  28.22 
 
 
967 aa  369  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434447  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0913  peptidase M16 domain protein  27.21 
 
 
986 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1042  peptidase M16 domain-containing protein  27.12 
 
 
962 aa  362  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.923143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0990  protease III  27.12 
 
 
962 aa  361  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3232  protease III precursor  27.12 
 
 
962 aa  361  3e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.730606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3141  protease 3  28.25 
 
 
962 aa  350  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3207  protease 3  28.14 
 
 
962 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3321  protease 3  28.14 
 
 
962 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.328834 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3008  Pitrilysin  27.8 
 
 
981 aa  346  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3158  protease 3  28.02 
 
 
962 aa  346  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.782979  normal  0.694921 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45399  predicted protein  26.7 
 
 
916 aa  345  2e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3264  peptidase M16 domain-containing protein  27.57 
 
 
960 aa  344  5e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  27.89 
 
 
962 aa  336  9e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  27.89 
 
 
962 aa  336  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  27.78 
 
 
962 aa  335  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.436713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  27.78 
 
 
962 aa  335  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  27.78 
 
 
962 aa  334  4e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  27.78 
 
 
962 aa  334  4e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  27.78 
 
 
962 aa  334  4e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02669  protease III  27.66 
 
 
962 aa  333  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  27.66 
 
 
962 aa  333  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50598  predicted protein  27.57 
 
 
1008 aa  332  2e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732398  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3221  protease 3  28.02 
 
 
962 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.405779 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_267  predicted protein  27.51 
 
 
952 aa  312  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0986316  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47929  predicted protein  32.66 
 
 
1272 aa  250  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  25.51 
 
 
939 aa  239  2e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28795  predicted protein  22.79 
 
 
1246 aa  175  3.9999999999999995e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.923761  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47985  predicted protein  27.78 
 
 
932 aa  137  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5156  pqqF protein. metallo peptidase. MEROPS family M16A  30.41 
 
 
808 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.326749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4669  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  29.33 
 
 
762 aa  127  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0409  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  33.67 
 
 
766 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0381  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  33.17 
 
 
766 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0405  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  33.67 
 
 
809 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458439  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39010  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  28.86 
 
 
775 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0514  coenzyme PQQ synthesis protein F  30.07 
 
 
779 aa  118  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4822  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  33.5 
 
 
760 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3322  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  28.37 
 
 
763 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149192  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41610  coenzyme PQQ biosynthesis protein F  32.24 
 
 
843 aa  111  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4342  peptidase M16-like  25.19 
 
 
431 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472968  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  32.74 
 
 
419 aa  96.3  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  27.59 
 
 
419 aa  95.9  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  27.27 
 
 
423 aa  94  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1937  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  27.92 
 
 
794 aa  94  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.979365 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3238  peptidase M16 domain-containing protein  27.64 
 
 
431 aa  93.6  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  31.74 
 
 
419 aa  92  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  26.27 
 
 
418 aa  91.3  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1986  processing protease  23.23 
 
 
440 aa  90.9  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  25.28 
 
 
513 aa  90.9  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4309  peptidase M16-like  23.87 
 
 
413 aa  89  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  24.57 
 
 
514 aa  89  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  24.72 
 
 
421 aa  88.6  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  24.38 
 
 
454 aa  88.2  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0496  processing peptidase  28.52 
 
 
903 aa  87.8  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000425054  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  28.57 
 
 
463 aa  87.8  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4314  peptidase M16 domain-containing protein  27.85 
 
 
421 aa  87  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518498  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0895  peptidase M16 domain protein  22.72 
 
 
427 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4022  peptidase M16 domain-containing protein  26.29 
 
 
424 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0571342 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0921  peptidase M16 domain protein  22.72 
 
 
427 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0782213  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0576  peptidase M16-like  24.81 
 
 
473 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0603  peptidase M16 domain protein  24.81 
 
 
473 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0611  peptidase M16 domain protein  24.81 
 
 
473 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0031  peptidase M16 domain-containing protein  31.1 
 
 
430 aa  85.5  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.652057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  27.36 
 
 
461 aa  85.1  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0767  peptidase M16 domain protein  25.71 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.276188  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2351  peptidase M16 domain-containing protein  26.37 
 
 
451 aa  85.1  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3360  M16 family peptidase  29.83 
 
 
439 aa  84.7  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>