75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2465 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2465  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  272  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.645895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  45.1 
 
 		 412 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  45.83 
 
 		 403 aa  70.5  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  36.96 
 
 		 384 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  36.19 
 
 		 400 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  37.62 
 
 		 390 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  33.33 
 
 		 411 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  37.61 
 
 		 401 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  38.74 
 
 		 411 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  31.93 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  35.24 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  34.29 
 
 		 407 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  34.29 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  36.19 
 
 		 459 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  31.73 
 
 		 411 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3051  hypothetical protein  71.05 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.766207  hitchhiker  0.0038997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  43.1 
 
 		 397 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  33.63 
 
 		 438 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  31.13 
 
 		 387 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  32.76 
 
 		 399 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.84 
 
 		 415 aa  50.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  32.71 
 
 		 401 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  35.51 
 
 		 403 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  32.56 
 
 		 403 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  33.33 
 
 		 429 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  30.1 
 
 		 410 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3582  integrase  35.16 
 
 		 397 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010448 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1309  integrase family protein  35.16 
 
 		 385 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00894189  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  31.11 
 
 		 390 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  33.33 
 
 		 429 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  31.73 
 
 		 279 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  31.07 
 
 		 404 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  31.13 
 
 		 397 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  31.87 
 
 		 395 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  37.93 
 
 		 405 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0350  phage integrase family protein  31.53 
 
 		 427 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  31.48 
 
 		 406 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  53.66 
 
 		 391 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  25.86 
 
 		 402 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  43.1 
 
 		 420 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  43.1 
 
 		 420 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  34.44 
 
 		 404 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  29.73 
 
 		 421 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  30.93 
 
 		 432 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  32.8 
 
 		 436 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  31 
 
 		 406 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  35.48 
 
 		 398 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0858  integrase family protein  35 
 
 		 419 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  36 
 
 		 419 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  33.33 
 
 		 408 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  32.41 
 
 		 438 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  31.33 
 
 		 432 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 413 aa  42.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  32.56 
 
 		 391 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  32.56 
 
 		 387 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  28.81 
 
 		 417 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  31.11 
 
 		 419 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  29.07 
 
 		 443 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  30.56 
 
 		 449 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  28.3 
 
 		 404 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  28.57 
 
 		 395 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  28.3 
 
 		 404 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4951  putative prophage integrase  34.02 
 
 		 408 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  32.56 
 
 		 402 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  35 
 
 		 419 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  28.24 
 
 		 433 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  33 
 
 		 424 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  31.46 
 
 		 412 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  28.44 
 
 		 429 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 434 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4275.1  prophage Sf6-like integrase  28.04 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  29.31 
 
 		 421 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  33 
 
 		 419 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  28.16 
 
 		 410 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  33.96 
 
 		 410 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>