192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4275.1 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4275.1  prophage Sf6-like integrase  100 
 
 		 144 aa  300  6.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  80.53 
 
 		 403 aa  197  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  56.03 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  49.09 
 
 		 415 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  46.49 
 
 		 404 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0350  phage integrase family protein  41.28 
 
 		 427 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  43.52 
 
 		 413 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  41.82 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3582  integrase  38.05 
 
 		 397 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010448 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1309  integrase family protein  39.22 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00894189  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  43.42 
 
 		 399 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  37.14 
 
 		 419 aa  62  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  35.24 
 
 		 412 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  38.1 
 
 		 411 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4258  phage integrase family site specific recombinase  40.59 
 
 		 293 aa  60.5  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  38.2 
 
 		 403 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  37 
 
 		 411 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5642  Phage integrase  35.05 
 
 		 403 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  36.19 
 
 		 421 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  44.57 
 
 		 404 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  36.19 
 
 		 411 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  31.93 
 
 		 394 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  31.93 
 
 		 394 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  38.82 
 
 		 401 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  34.07 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  37.78 
 
 		 411 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  32.58 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  34.07 
 
 		 420 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  33.61 
 
 		 417 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  35.87 
 
 		 387 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  36.49 
 
 		 415 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  35.06 
 
 		 411 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  34.48 
 
 		 390 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  29.63 
 
 		 402 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  33.68 
 
 		 409 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  32.71 
 
 		 396 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.71 
 
 		 394 aa  52  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  29.09 
 
 		 421 aa  52  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.46 
 
 		 402 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.71 
 
 		 394 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  32.1 
 
 		 402 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  29.46 
 
 		 394 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  33.04 
 
 		 449 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  34.78 
 
 		 429 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  34.78 
 
 		 429 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  31.78 
 
 		 403 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  31.71 
 
 		 404 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  37.8 
 
 		 401 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  36.26 
 
 		 397 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  32.08 
 
 		 396 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  35.92 
 
 		 414 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  30.61 
 
 		 367 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  35.14 
 
 		 279 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  34.18 
 
 		 429 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  33.75 
 
 		 407 aa  50.4  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4839  hypothetical protein  37.08 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115788  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04136  predicted integrase  33.73 
 
 		 396 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3727  integrase family protein  33.73 
 
 		 396 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  32.11 
 
 		 421 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  31.4 
 
 		 412 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3701  phage integrase  34.02 
 
 		 276 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  30.28 
 
 		 419 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04100  hypothetical protein  33.73 
 
 		 396 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  39.44 
 
 		 408 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  31.13 
 
 		 423 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3064  Phage integrase  28.57 
 
 		 438 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  31.65 
 
 		 412 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4935  integrase family protein  30.39 
 
 		 439 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.020057  hitchhiker  0.000000122122 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  32.95 
 
 		 410 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.33 
 
 		 422 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.87 
 
 		 420 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  30.61 
 
 		 391 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5797  prophage P4 integrase  30.25 
 
 		 275 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.264973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.52 
 
 		 421 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  31.52 
 
 		 420 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  29.13 
 
 		 404 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4662  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.52 
 
 		 334 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  31.52 
 
 		 421 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  29.73 
 
 		 404 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  30.34 
 
 		 408 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1011  integrase  32.58 
 
 		 223 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  29.25 
 
 		 395 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  31.73 
 
 		 429 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  29.13 
 
 		 404 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  27.74 
 
 		 419 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  33.33 
 
 		 404 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  44.78 
 
 		 407 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  34.21 
 
 		 404 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  34.21 
 
 		 404 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  32.95 
 
 		 389 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  32.38 
 
 		 425 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  30.61 
 
 		 445 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  37.08 
 
 		 433 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  27.74 
 
 		 419 aa  47.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  27.91 
 
 		 421 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  32.18 
 
 		 403 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  27.93 
 
 		 411 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  35.71 
 
 		 400 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  33.94 
 
 		 396 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  36.62 
 
 		 401 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>