238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21180 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21180  predicted multicopper oxidase  100 
 
 		 334 aa  684    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.689075 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21170  predicted multicopper oxidase  81.97 
 
 		 318 aa  514  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.365675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3554  multicopper oxidase type 2  37.5 
 
 		 407 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2394  ferroxidase  29.89 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  26.89 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  25.57 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  23.6 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  24.82 
 
 		 527 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  26.72 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  25.17 
 
 		 317 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 462 aa  66.2  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  24.8 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  26 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  26 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  27.06 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  25.61 
 
 		 630 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  26.33 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  28.84 
 
 		 598 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  24.91 
 
 		 544 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  30.3 
 
 		 642 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  27.73 
 
 		 640 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  29.11 
 
 		 657 aa  60.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  29.02 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  28.86 
 
 		 672 aa  60.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  27.73 
 
 		 604 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  25.19 
 
 		 551 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  25.19 
 
 		 551 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  25.28 
 
 		 549 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  24.91 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  24.45 
 
 		 546 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  23.88 
 
 		 609 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  27.57 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  29.32 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  25.57 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  25.51 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  26.34 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  27.69 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  27.01 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  24.91 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  32.87 
 
 		 664 aa  57.4  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  36.51 
 
 		 564 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4279  multicopper oxidase type 3  26.77 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  33.81 
 
 		 535 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  30.14 
 
 		 633 aa  57  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4268  twin-arginine translocation pathway signal  25.76 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.177081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  26.92 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  23.72 
 
 		 546 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  33.81 
 
 		 535 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  33.81 
 
 		 535 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  26.92 
 
 		 462 aa  57  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  26.61 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  37.59 
 
 		 621 aa  56.6  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  30.14 
 
 		 630 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  26.98 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  27.04 
 
 		 467 aa  56.2  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  27.62 
 
 		 470 aa  56.2  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2612  ferroxidase  25 
 
 		 373 aa  55.8  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0006372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.09 
 
 		 579 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  27.13 
 
 		 470 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  30.58 
 
 		 511 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  26.95 
 
 		 470 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  35.34 
 
 		 522 aa  55.5  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  33.09 
 
 		 535 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.35 
 
 		 586 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.35 
 
 		 591 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  25.27 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  32.35 
 
 		 536 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  24.34 
 
 		 640 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  23.36 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  27.91 
 
 		 631 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  23.85 
 
 		 432 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  33.33 
 
 		 565 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.35 
 
 		 536 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  32.35 
 
 		 536 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.35 
 
 		 536 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  23.85 
 
 		 432 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.35 
 
 		 536 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  27.91 
 
 		 631 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  36.28 
 
 		 513 aa  53.9  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  33.09 
 
 		 532 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  33.09 
 
 		 531 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  25.25 
 
 		 494 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  27.42 
 
 		 488 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1252  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1652 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109377  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  24.09 
 
 		 551 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  26.83 
 
 		 515 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  26.97 
 
 		 444 aa  53.5  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  33.05 
 
 		 508 aa  53.5  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  25.21 
 
 		 468 aa  53.5  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  28.87 
 
 		 499 aa  53.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  30.9 
 
 		 599 aa  53.1  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  28.57 
 
 		 605 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  25.81 
 
 		 431 aa  53.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  36.28 
 
 		 513 aa  53.1  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  33.08 
 
 		 606 aa  52.8  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  23.88 
 
 		 330 aa  52.8  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  29.58 
 
 		 514 aa  52.8  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  28.64 
 
 		 580 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  33.08 
 
 		 606 aa  52.8  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>