186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2612 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2612  ferroxidase  100 
 
 
373 aa  772    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0006372  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2394  ferroxidase  49.84 
 
 
345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3554  multicopper oxidase type 2  32.01 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  28.29 
 
 
505 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  28.15 
 
 
358 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  28.52 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  27.35 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  40.43 
 
 
508 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  27.67 
 
 
459 aa  63.9  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  26.74 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  24.4 
 
 
527 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  23.86 
 
 
554 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  23.86 
 
 
554 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  24.9 
 
 
452 aa  60.1  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  26.07 
 
 
360 aa  59.7  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  25.67 
 
 
431 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21170  predicted multicopper oxidase  26.47 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.365675 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  25.29 
 
 
431 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  25.29 
 
 
431 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21180  predicted multicopper oxidase  26.09 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.689075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  25.29 
 
 
431 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  28.35 
 
 
565 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  25.29 
 
 
431 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  39.42 
 
 
521 aa  58.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  25.29 
 
 
431 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  39.42 
 
 
521 aa  58.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  27.34 
 
 
368 aa  58.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  33.64 
 
 
489 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  33.33 
 
 
518 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  27.32 
 
 
546 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  26.09 
 
 
462 aa  56.6  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  32.03 
 
 
518 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  25.78 
 
 
452 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  23.22 
 
 
544 aa  56.6  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  26.09 
 
 
459 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  26.92 
 
 
398 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  25.9 
 
 
293 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  32.03 
 
 
521 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  23.95 
 
 
455 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  32.73 
 
 
457 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  32.73 
 
 
457 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  23.97 
 
 
330 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2456  multicopper oxidase type 3  24.79 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  23.94 
 
 
446 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  25.76 
 
 
359 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  25.19 
 
 
431 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  36.08 
 
 
498 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  24.31 
 
 
431 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  25.58 
 
 
431 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  25 
 
 
432 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  25 
 
 
432 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  34.65 
 
 
478 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  25 
 
 
460 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  24.43 
 
 
546 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3235  multicopper oxidase type 2  27.5 
 
 
502 aa  53.5  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  26.07 
 
 
460 aa  53.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  24.52 
 
 
473 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  24.52 
 
 
431 aa  53.1  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  24.23 
 
 
433 aa  53.1  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4279  multicopper oxidase type 3  26.36 
 
 
545 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  28.38 
 
 
460 aa  53.1  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  23.33 
 
 
549 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  23.11 
 
 
551 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  23.11 
 
 
551 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  32.73 
 
 
460 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  25.78 
 
 
484 aa  52.8  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  29.09 
 
 
576 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  34.74 
 
 
536 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  32.73 
 
 
468 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  26.24 
 
 
969 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  32.71 
 
 
456 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  27.57 
 
 
494 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  32.73 
 
 
460 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  32.73 
 
 
459 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  32.73 
 
 
461 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  27.45 
 
 
551 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  26.17 
 
 
455 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  26.17 
 
 
455 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  37.04 
 
 
513 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  33.01 
 
 
506 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  25.87 
 
 
462 aa  50.8  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  38.14 
 
 
551 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  25.87 
 
 
462 aa  50.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  29.57 
 
 
680 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  29.73 
 
 
630 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4268  twin-arginine translocation pathway signal  25.98 
 
 
459 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.177081 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  25.84 
 
 
470 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  23.85 
 
 
477 aa  49.7  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  30.84 
 
 
456 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  24.71 
 
 
364 aa  49.7  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  29.59 
 
 
803 aa  50.1  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  23.53 
 
 
381 aa  49.7  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  33.75 
 
 
466 aa  49.7  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  30.19 
 
 
463 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3408  multicopper oxidase type 2  30.17 
 
 
516 aa  49.7  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01240  laccase precursor, putative  31.29 
 
 
624 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1692  multicopper oxidase type 2  23.2 
 
 
221 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  31.78 
 
 
463 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  23.08 
 
 
433 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  26.67 
 
 
437 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>