205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2394 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2394  ferroxidase  100 
 
 
345 aa  720    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2612  ferroxidase  48.38 
 
 
373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0006372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3554  multicopper oxidase type 2  32.58 
 
 
407 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21180  predicted multicopper oxidase  29.89 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.689075 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21170  predicted multicopper oxidase  29.1 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.365675 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  27.67 
 
 
452 aa  79.7  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  23.9 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  23.9 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  24.3 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  24.3 
 
 
431 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  24.51 
 
 
460 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  24.9 
 
 
431 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  25.79 
 
 
459 aa  73.2  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  25.3 
 
 
431 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  25.3 
 
 
431 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  23.9 
 
 
431 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  23.13 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  24.7 
 
 
431 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  25.3 
 
 
431 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  25.3 
 
 
431 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  25.3 
 
 
431 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  25.4 
 
 
446 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  23.9 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  24.51 
 
 
431 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  23.9 
 
 
433 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  23.9 
 
 
433 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  24.49 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  24.9 
 
 
630 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  24.51 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  24.51 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  24.9 
 
 
470 aa  70.5  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4903  multicopper oxidase type 3  24.3 
 
 
465 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7874  multicopper oxidase type 3  24.7 
 
 
464 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.994377  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  23.51 
 
 
467 aa  69.7  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  23.51 
 
 
467 aa  69.3  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  22.88 
 
 
527 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  23.69 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  25.1 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  25.1 
 
 
462 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  25.1 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  23.51 
 
 
455 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  24.41 
 
 
452 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  24.3 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  24.21 
 
 
473 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  24.9 
 
 
505 aa  66.2  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  24.7 
 
 
488 aa  66.2  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  24.7 
 
 
484 aa  66.2  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  24.11 
 
 
358 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  25.59 
 
 
468 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  25.69 
 
 
467 aa  64.7  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  25.7 
 
 
609 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  23.16 
 
 
330 aa  63.2  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  24.7 
 
 
449 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  24.7 
 
 
477 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  24.3 
 
 
448 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  26.09 
 
 
463 aa  62.8  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  26.19 
 
 
462 aa  62.8  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  33.83 
 
 
508 aa  62.4  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  26.19 
 
 
462 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  23.51 
 
 
470 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  23.17 
 
 
640 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  25.1 
 
 
470 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
471 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  25 
 
 
470 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  23.51 
 
 
470 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  25.9 
 
 
470 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  25.1 
 
 
460 aa  60.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  23.72 
 
 
443 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4268  twin-arginine translocation pathway signal  22.71 
 
 
459 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.177081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  28.11 
 
 
360 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  22.4 
 
 
474 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  24.71 
 
 
398 aa  57  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9850  multicopper oxidase  23.9 
 
 
449 aa  56.6  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  25.62 
 
 
293 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  24.7 
 
 
364 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  23.87 
 
 
472 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  28.24 
 
 
599 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  22.4 
 
 
467 aa  54.3  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  33.01 
 
 
576 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  36.36 
 
 
508 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  25.68 
 
 
368 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  37.36 
 
 
521 aa  53.5  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  37.36 
 
 
521 aa  53.5  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  25.28 
 
 
515 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  28.57 
 
 
680 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  23.11 
 
 
554 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  23.11 
 
 
554 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  31.01 
 
 
535 aa  52.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  30.19 
 
 
463 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  30.19 
 
 
463 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  26.35 
 
 
601 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2456  multicopper oxidase type 3  22.82 
 
 
360 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  25.32 
 
 
375 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  34.95 
 
 
544 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  24.77 
 
 
605 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  30.84 
 
 
494 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  24.19 
 
 
546 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  31.48 
 
 
496 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  26.92 
 
 
601 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  29.46 
 
 
546 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>