More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1446 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0624  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  49.95 
 
 		 977 aa  988    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1446  DNA mismatch repair protein MutS-like  100 
 
 		 1002 aa  2041    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.345088  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  26.84 
 
 		 867 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  25.24 
 
 		 901 aa  228  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  25.69 
 
 		 817 aa  223  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  25.35 
 
 		 888 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  26.67 
 
 		 852 aa  219  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  25.35 
 
 		 888 aa  219  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  24.92 
 
 		 862 aa  217  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  25.2 
 
 		 857 aa  216  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  26.33 
 
 		 828 aa  213  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  25.68 
 
 		 840 aa  213  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  25.75 
 
 		 854 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  24.72 
 
 		 896 aa  213  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  25.06 
 
 		 882 aa  212  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  25.75 
 
 		 887 aa  211  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  24.47 
 
 		 872 aa  211  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  24.47 
 
 		 872 aa  211  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  25.14 
 
 		 903 aa  211  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18351  DNA mismatch repair protein MutS  25.25 
 
 		 914 aa  210  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  25.3 
 
 		 880 aa  210  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  25.03 
 
 		 873 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  25.78 
 
 		 870 aa  209  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  25.25 
 
 		 863 aa  208  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  25.72 
 
 		 858 aa  207  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18351  DNA mismatch repair protein MutS  25.25 
 
 		 913 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  24.62 
 
 		 823 aa  207  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1737  DNA mismatch repair protein MutS  25.14 
 
 		 913 aa  206  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0169322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  25.83 
 
 		 885 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  24.97 
 
 		 907 aa  204  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  26.19 
 
 		 859 aa  203  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18541  DNA mismatch repair protein MutS  25.37 
 
 		 913 aa  203  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  26.03 
 
 		 853 aa  202  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  25.33 
 
 		 860 aa  203  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  25.36 
 
 		 859 aa  203  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  25.76 
 
 		 891 aa  202  3e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  25.72 
 
 		 793 aa  202  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1243  DNA mismatch repair protein MutS  23.87 
 
 		 926 aa  201  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.32952  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  25.14 
 
 		 881 aa  202  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  24.03 
 
 		 872 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  24.37 
 
 		 873 aa  201  6e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  26.07 
 
 		 871 aa  201  6e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  24.75 
 
 		 881 aa  201  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  24.86 
 
 		 932 aa  200  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  25.68 
 
 		 886 aa  200  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  24.57 
 
 		 868 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  24.38 
 
 		 853 aa  199  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  24.53 
 
 		 858 aa  198  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  23.86 
 
 		 918 aa  199  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  24.34 
 
 		 875 aa  198  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  25.29 
 
 		 869 aa  198  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  24.94 
 
 		 870 aa  197  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  25.37 
 
 		 793 aa  197  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  26.02 
 
 		 895 aa  196  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21131  DNA mismatch repair protein MutS  23.55 
 
 		 926 aa  196  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0652427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  25.95 
 
 		 892 aa  196  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  24.04 
 
 		 870 aa  196  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  24.35 
 
 		 871 aa  194  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  24.47 
 
 		 857 aa  194  5e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  24.03 
 
 		 872 aa  194  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  24.45 
 
 		 893 aa  194  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  24.94 
 
 		 871 aa  194  8e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  25.73 
 
 		 890 aa  194  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  24.41 
 
 		 850 aa  194  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  23.91 
 
 		 854 aa  193  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  25.73 
 
 		 890 aa  194  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  25.08 
 
 		 882 aa  193  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  25.23 
 
 		 868 aa  192  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  24.94 
 
 		 815 aa  192  2e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  23.24 
 
 		 819 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  25.73 
 
 		 894 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  23.58 
 
 		 855 aa  192  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  25.84 
 
 		 892 aa  192  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1832  DNA mismatch repair protein MutS  25.3 
 
 		 882 aa  192  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  25.37 
 
 		 854 aa  192  4e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  25.84 
 
 		 892 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  25.73 
 
 		 890 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  25.84 
 
 		 892 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  25.84 
 
 		 892 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  25.84 
 
 		 892 aa  191  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2603  DNA mismatch repair protein MutS  23.48 
 
 		 891 aa  191  8e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  24.63 
 
 		 868 aa  190  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  24.16 
 
 		 854 aa  190  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  25.48 
 
 		 804 aa  190  1e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  25.86 
 
 		 900 aa  190  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  25 
 
 		 862 aa  189  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  24.08 
 
 		 851 aa  189  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  24.25 
 
 		 872 aa  189  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  24.31 
 
 		 858 aa  190  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  25.13 
 
 		 910 aa  189  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  23.75 
 
 		 891 aa  188  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  25.52 
 
 		 910 aa  188  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  24.34 
 
 		 869 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  24.07 
 
 		 905 aa  187  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  25.2 
 
 		 855 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  23.66 
 
 		 872 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  24.56 
 
 		 869 aa  187  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  24.58 
 
 		 856 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  24.4 
 
 		 893 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  25.57 
 
 		 804 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>