More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0290 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0290  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 545 aa  1115    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1585  threonyl-tRNA synthetase  65.07 
 
 		 541 aa  758    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000347084  normal  0.0207238 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 643 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 636 aa  432  1e-120  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 640 aa  429  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 614 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 645 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 640 aa  427  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 636 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 636 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 636 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 638 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 669 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 645 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 644 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 638 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 638 aa  415  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 643 aa  418  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  47.6 
 
 		 684 aa  418  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 649 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 635 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 634 aa  415  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 633 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 648 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 640 aa  412  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 636 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 641 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 637 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 644 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 639 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 644 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 644 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 635 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 635 aa  411  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 662 aa  411  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 644 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 639 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 639 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 637 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 635 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 611 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 638 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 639 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 639 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 639 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 646 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 646 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 		 644 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 640 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 639 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 640 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 611 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 635 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 639 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 635 aa  405  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 640 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 644 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0955  threonyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 650 aa  402  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.94017  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 640 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 637 aa  401  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 635 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2787  threonyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 649 aa  399  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 641 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 644 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1389  threonyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 640 aa  397  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.210838  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1764  threonyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 649 aa  398  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0076873 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 635 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 637 aa  398  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0744  threonyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 581 aa  396  1e-109  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0359075  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1870  threonyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 635 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2089  threonyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 682 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3442  threonyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 699 aa  395  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000446012  hitchhiker  0.0000744788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 659 aa  395  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 645 aa  395  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 635 aa  396  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 657 aa  396  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 640 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 640 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  40.5 
 
 		 638 aa  395  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 640 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 643 aa  394  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2368  threonyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 644 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.642893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0448  threonyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 677 aa  390  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.145335  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 635 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 635 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 635 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 634 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 635 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 635 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 635 aa  392  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 636 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 640 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 640 aa  391  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 635 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 584 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 604 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 635 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 648 aa  386  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 637 aa  386  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 588 aa  388  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>