More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1585 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0290  threonyl-tRNA synthetase  65.07 
 
 		 545 aa  758    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1585  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 541 aa  1105    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000347084  normal  0.0207238 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 636 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 649 aa  436  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 640 aa  434  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 640 aa  432  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 640 aa  429  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 638 aa  429  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 643 aa  425  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 614 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1389  threonyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 640 aa  424  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.210838  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 659 aa  422  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 638 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 634 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 645 aa  415  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 635 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 636 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 639 aa  411  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 639 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 644 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 643 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 640 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 645 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 639 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 638 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 639 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 639 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 636 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 644 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 644 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 639 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 633 aa  408  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 635 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1764  threonyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 649 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0076873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 635 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 635 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 644 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 644 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 636 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 639 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 644 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2787  threonyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 649 aa  405  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3442  threonyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 699 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000446012  hitchhiker  0.0000744788 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 644 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 640 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 639 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0955  threonyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 650 aa  400  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.94017  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 634 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 640 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0744  threonyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 581 aa  400  9.999999999999999e-111  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0359075  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 588 aa  400  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 635 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 583 aa  400  9.999999999999999e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 640 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 662 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 648 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 636 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 646 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 638 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 646 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 635 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 584 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 635 aa  396  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1319  hypothetical protein  44.65 
 
 		 586 aa  397  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 635 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 644 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 635 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 684 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 640 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 643 aa  394  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 611 aa  395  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 657 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 640 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04450  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  42.6 
 
 		 586 aa  391  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0386598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 636 aa  391  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 611 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 637 aa  391  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 604 aa  391  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1870  threonyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 635 aa  392  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47552  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  45.39 
 
 		 684 aa  385  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 608 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 635 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 641 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 635 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 637 aa  389  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 635 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16370  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  44.16 
 
 		 586 aa  386  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.12349 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 635 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 635 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 635 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 635 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 635 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 635 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 635 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 640 aa  389  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 635 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 635 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 637 aa  388  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 635 aa  385  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 635 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>