More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1764 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2787  threonyl-tRNA synthetase  68.26 
 
 		 649 aa  919    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1764  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 649 aa  1313    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0076873 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0955  threonyl-tRNA synthetase  68.92 
 
 		 650 aa  923    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.94017  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1389  threonyl-tRNA synthetase  71.72 
 
 		 640 aa  887    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.210838  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 635 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 638 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 635 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 636 aa  565  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 639 aa  565  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 639 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 639 aa  567  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 645 aa  565  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 639 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 640 aa  566  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 637 aa  567  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 639 aa  565  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 636 aa  568  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 640 aa  567  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 		 636 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 639 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 636 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 639 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 635 aa  564  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 640 aa  560  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 640 aa  560  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 635 aa  560  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 639 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 640 aa  559  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 662 aa  560  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 644 aa  558  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 645 aa  558  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 637 aa  556  1e-157  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 633 aa  557  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 634 aa  553  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 636 aa  555  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 631 aa  553  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 644 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 636 aa  553  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 634 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 644 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 636 aa  551  1e-155  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 635 aa  551  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 640 aa  548  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 640 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 640 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 641 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 639 aa  546  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 643 aa  544  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 644 aa  545  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 642 aa  544  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 637 aa  542  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06531  threonyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 640 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 648 aa  540  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 635 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 649 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 648 aa  539  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 635 aa  538  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 643 aa  536  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 644 aa  537  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 641 aa  538  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 644 aa  538  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18621  threonyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 640 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2053  threonyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 642 aa  535  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.22159  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1760  threonyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 642 aa  534  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000746645  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 640 aa  533  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2417  threonyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 644 aa  535  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00010604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0942  threonyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 642 aa  533  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484442  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 638 aa  531  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2909  threonyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 636 aa  531  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003716  threonyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 642 aa  529  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000263633  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 648 aa  530  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 638 aa  529  1e-149  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 638 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10531  threonyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 638 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 669 aa  531  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 640 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 635 aa  529  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 649 aa  530  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 638 aa  530  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1870  threonyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 635 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47552  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02079  threonyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 642 aa  531  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01688  threonyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 642 aa  527  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1923  threonyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 642 aa  527  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000181503  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1712  threonyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 642 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000703633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 646 aa  525  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2098  threonyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 644 aa  526  1e-148  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000824061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1472  threonyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 642 aa  527  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000205456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1428  threonyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 642 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00369354  hitchhiker  0.00283181 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01677  hypothetical protein  41.43 
 
 		 642 aa  527  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0538316  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1840  threonyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 642 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1800  threonyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 642 aa  525  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000021107  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1820  threonyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 642 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000360561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1913  threonyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 642 aa  525  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.121147  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2625  threonyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 642 aa  528  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000821618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2437  threonyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 642 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00126815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 640 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 646 aa  528  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2499  threonyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 638 aa  526  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0219257  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1937  threonyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 642 aa  525  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227542  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 640 aa  528  1e-148  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>