104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2288 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  76.89 
 
 		 437 aa  720    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  75.29 
 
 		 437 aa  694    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  77.8 
 
 		 437 aa  728    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  78.03 
 
 		 437 aa  729    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  73.23 
 
 		 446 aa  684    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  77.8 
 
 		 437 aa  729    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  70.02 
 
 		 437 aa  652    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  79.41 
 
 		 437 aa  737    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1965  phosphatidylserine synthase  78.26 
 
 		 437 aa  713    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  78.49 
 
 		 437 aa  729    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  79.41 
 
 		 437 aa  737    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 437 aa  907    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  80.32 
 
 		 446 aa  756    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  79.18 
 
 		 437 aa  736    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  84.44 
 
 		 437 aa  794    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  79.41 
 
 		 437 aa  737    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  50.57 
 
 		 446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  52.91 
 
 		 412 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  50.68 
 
 		 450 aa  441  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  50.11 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2677  phosphatidylserine synthase  48.65 
 
 		 445 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2876  phosphatidylserine synthase  48.18 
 
 		 477 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3244  phosphatidylserine synthase  47.84 
 
 		 447 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3463  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  47.15 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  47.05 
 
 		 450 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0926  phosphatidylserine synthase  45.79 
 
 		 442 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  48.81 
 
 		 451 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  46.79 
 
 		 451 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0300  phosphatidylserine synthase  43.34 
 
 		 455 aa  375  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3207  phosphatidylserine synthase  46.56 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3466  phosphatidylserine synthase  46.56 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3344  phosphatidylserine synthase  46.56 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00469023  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  46.08 
 
 		 451 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  46.92 
 
 		 451 aa  363  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3070  phosphatidylserine synthase  45 
 
 		 451 aa  361  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.917906  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02479  phosphatidylserine synthase  44.29 
 
 		 451 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1083  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.29 
 
 		 451 aa  360  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2742  phosphatidylserine synthase  44.29 
 
 		 451 aa  360  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.933118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2872  phosphatidylserine synthase  44.29 
 
 		 451 aa  360  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1092  phosphatidylserine synthase  44.29 
 
 		 451 aa  360  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0886852  normal  0.0107866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2738  phosphatidylserine synthase  44.29 
 
 		 451 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0459118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02443  hypothetical protein  44.29 
 
 		 451 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  44.52 
 
 		 451 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  45.05 
 
 		 451 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  45.05 
 
 		 451 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  45.05 
 
 		 451 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  45.05 
 
 		 451 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  45.05 
 
 		 451 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  46.92 
 
 		 451 aa  359  4e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  44.05 
 
 		 451 aa  359  5e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0025  phosphatidylserine synthase  42.63 
 
 		 453 aa  345  8.999999999999999e-94  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3664  phosphatidylserine synthase  42.37 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2239  phosphatidylserine synthase  41.91 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2065  phosphatidylserine synthase  42.6 
 
 		 437 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.361576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2235  phosphatidylserine synthase  42.14 
 
 		 442 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.702334 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  22.54 
 
 		 534 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  21.64 
 
 		 543 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.29 
 
 		 477 aa  55.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  18.95 
 
 		 484 aa  50.8  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  22.52 
 
 		 478 aa  50.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000670  cardiolipin synthetase  21.07 
 
 		 505 aa  50.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.16 
 
 		 472 aa  50.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  22.64 
 
 		 477 aa  50.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  22.71 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  22.71 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  22.71 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  22.71 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  22.71 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  22.1 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  24.5 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  20.85 
 
 		 480 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1371  phospholipase D/transphosphatidylase  21.59 
 
 		 540 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  19.9 
 
 		 486 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  21.85 
 
 		 489 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  23.7 
 
 		 479 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2202  phopholipase D-family protein  20.87 
 
 		 508 aa  47.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1156  phospholipase D/transphosphatidylase  23.53 
 
 		 441 aa  46.6  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1436  phospholipase D/transphosphatidylase  21.59 
 
 		 540 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  22.22 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  21.76 
 
 		 490 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  27.22 
 
 		 485 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  19.95 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.84 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47576  predicted protein  24.4 
 
 		 574 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.124789  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.43 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  22.96 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  20.49 
 
 		 494 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  20.49 
 
 		 494 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  18.93 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2951  phospholipase D/Transphosphatidylase  21 
 
 		 529 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.75 
 
 		 487 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  22.07 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  22.07 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  20.65 
 
 		 532 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3346  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.78 
 
 		 395 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000729556  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  24.49 
 
 		 477 aa  44.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  22.07 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  21.51 
 
 		 478 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.34 
 
 		 478 aa  43.5  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  23.56 
 
 		 484 aa  43.5  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>