121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2876 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2876  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 477 aa  974    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3463  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  67.34 
 
 		 447 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3244  phosphatidylserine synthase  66.89 
 
 		 447 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3664  phosphatidylserine synthase  56.59 
 
 		 442 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2239  phosphatidylserine synthase  58.18 
 
 		 442 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2065  phosphatidylserine synthase  56.95 
 
 		 437 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.361576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2677  phosphatidylserine synthase  52.71 
 
 		 445 aa  486  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  50.22 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  49.33 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2235  phosphatidylserine synthase  55.68 
 
 		 442 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.702334 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02479  phosphatidylserine synthase  52.34 
 
 		 451 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1083  phospholipase D/Transphosphatidylase  52.34 
 
 		 451 aa  450  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02443  hypothetical protein  52.34 
 
 		 451 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  50.23 
 
 		 450 aa  449  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  52.1 
 
 		 451 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3207  phosphatidylserine synthase  53.85 
 
 		 452 aa  448  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2742  phosphatidylserine synthase  52.34 
 
 		 451 aa  450  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.933118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2872  phosphatidylserine synthase  52.34 
 
 		 451 aa  450  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  53.04 
 
 		 451 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3466  phosphatidylserine synthase  53.85 
 
 		 451 aa  448  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3344  phosphatidylserine synthase  53.85 
 
 		 451 aa  448  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00469023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1092  phosphatidylserine synthase  52.34 
 
 		 451 aa  450  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0886852  normal  0.0107866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2738  phosphatidylserine synthase  52.34 
 
 		 451 aa  450  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0459118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  53.22 
 
 		 451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  51.4 
 
 		 451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3070  phosphatidylserine synthase  51.64 
 
 		 451 aa  445  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.917906  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  51.87 
 
 		 451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  52.57 
 
 		 451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  52.57 
 
 		 451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  52.57 
 
 		 451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  52.57 
 
 		 451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  52.57 
 
 		 451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  51.46 
 
 		 412 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  50.49 
 
 		 451 aa  425  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0300  phosphatidylserine synthase  47.4 
 
 		 455 aa  422  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  48.78 
 
 		 446 aa  420  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  48.31 
 
 		 446 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  48.86 
 
 		 437 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  45.79 
 
 		 450 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  48.18 
 
 		 437 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  49.55 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  48.6 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  48.64 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  48.41 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  48.41 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  48.18 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1965  phosphatidylserine synthase  48.86 
 
 		 437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  47.73 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  48.18 
 
 		 437 aa  405  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  47.5 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  47.5 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  47.5 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  47.5 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0025  phosphatidylserine synthase  45.45 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0926  phosphatidylserine synthase  43.06 
 
 		 442 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  23.87 
 
 		 534 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  24.26 
 
 		 543 aa  79.3  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  23.04 
 
 		 472 aa  55.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  22.76 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04600  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, putative  26.83 
 
 		 552 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3346  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.06 
 
 		 395 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000729556  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  21.1 
 
 		 491 aa  52.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  21.75 
 
 		 489 aa  50.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  24.85 
 
 		 479 aa  50.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.51 
 
 		 474 aa  50.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.66 
 
 		 474 aa  50.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  26.17 
 
 		 477 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0208  putative phospholipase D  25.81 
 
 		 550 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0978  phospholipase D, putative  25.81 
 
 		 595 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  22.93 
 
 		 477 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1383  putative phospholipase D  25.81 
 
 		 550 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1580  putative phospholipase D  25.81 
 
 		 550 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2702  phospholipase D family protein  25.81 
 
 		 550 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2558  phospholipase D family protein  25.81 
 
 		 550 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140702  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0239  putative phospholipase D  25.81 
 
 		 550 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  23.08 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  23.08 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  23.08 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.66 
 
 		 374 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  23.08 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  23.08 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 		 482 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1387  cardiolipin synthetase 2  23.78 
 
 		 477 aa  47.8  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0493  phospholipase D, putative  26.63 
 
 		 553 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  25.86 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  26.28 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  27.89 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1869  cardiolipin synthetase domain-containing protein  21.45 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4980  phospholipase D/transphosphatidylase  24.29 
 
 		 538 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  25.35 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  27.56 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  26.95 
 
 		 481 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  23.51 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  25 
 
 		 478 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2951  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.54 
 
 		 529 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5588  putative phospholipase D/transphosphatidylase  27.7 
 
 		 534 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  27.81 
 
 		 485 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0796  phospholipase D/transphosphatidylase  25.52 
 
 		 562 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829142  normal  0.0553202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  26.28 
 
 		 416 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.95 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>