122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2081 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  90.39 
 
 
437 aa  832    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  100 
 
 
437 aa  904    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  77.8 
 
 
437 aa  716    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  90.85 
 
 
437 aa  836    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  91.08 
 
 
437 aa  836    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  74.83 
 
 
446 aa  695    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  91.3 
 
 
437 aa  837    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  75.51 
 
 
437 aa  685    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  100 
 
 
437 aa  904    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1965  phosphatidylserine synthase  76.89 
 
 
437 aa  681    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  91.76 
 
 
437 aa  833    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  100 
 
 
437 aa  904    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  79.41 
 
 
437 aa  737    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  79.18 
 
 
446 aa  738    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  99.77 
 
 
437 aa  903    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  81.46 
 
 
437 aa  755    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  49.89 
 
 
446 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  50.11 
 
 
446 aa  442  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  51.48 
 
 
450 aa  444  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  51.83 
 
 
412 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2677  phosphatidylserine synthase  46.36 
 
 
445 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3244  phosphatidylserine synthase  48.06 
 
 
447 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115505  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3463  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  48.52 
 
 
447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  47.5 
 
 
450 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2876  phosphatidylserine synthase  47.5 
 
 
477 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0926  phosphatidylserine synthase  43.96 
 
 
442 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3207  phosphatidylserine synthase  49.63 
 
 
452 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3466  phosphatidylserine synthase  49.63 
 
 
451 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880056  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3344  phosphatidylserine synthase  49.63 
 
 
451 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00469023  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  47.14 
 
 
451 aa  372  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02479  phosphatidylserine synthase  47.14 
 
 
451 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1083  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.14 
 
 
451 aa  368  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0300  phosphatidylserine synthase  44.2 
 
 
455 aa  365  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3070  phosphatidylserine synthase  46.9 
 
 
451 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.917906  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02443  hypothetical protein  47.14 
 
 
451 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2742  phosphatidylserine synthase  47.14 
 
 
451 aa  368  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.933118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2872  phosphatidylserine synthase  47.14 
 
 
451 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  48.14 
 
 
451 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1092  phosphatidylserine synthase  47.14 
 
 
451 aa  368  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0886852  normal  0.0107866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2738  phosphatidylserine synthase  47.14 
 
 
451 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0459118  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  47.38 
 
 
451 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  46.9 
 
 
451 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0025  phosphatidylserine synthase  44.22 
 
 
453 aa  358  9.999999999999999e-98  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  45.71 
 
 
451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  45.71 
 
 
451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  45.71 
 
 
451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  45.71 
 
 
451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  45.71 
 
 
451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  46.91 
 
 
451 aa  354  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  46.92 
 
 
451 aa  349  6e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  46.45 
 
 
451 aa  345  7e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3664  phosphatidylserine synthase  43.28 
 
 
442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2239  phosphatidylserine synthase  42.14 
 
 
442 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2065  phosphatidylserine synthase  42.82 
 
 
437 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.361576  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2235  phosphatidylserine synthase  42.82 
 
 
442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.702334 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  21.44 
 
 
543 aa  63.5  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  23.35 
 
 
534 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.3 
 
 
477 aa  57.4  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  21.23 
 
 
484 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.21 
 
 
487 aa  53.5  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04600  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, putative  29.94 
 
 
552 aa  52.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  26.47 
 
 
479 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  24 
 
 
478 aa  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  23.37 
 
 
486 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  24.26 
 
 
485 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  24.05 
 
 
482 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.89 
 
 
487 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  25.74 
 
 
479 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47576  predicted protein  25.15 
 
 
574 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.124789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5144  phospholipase D/transphosphatidylase  23.2 
 
 
397 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  23.9 
 
 
477 aa  50.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  22.99 
 
 
489 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  21.59 
 
 
483 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5477  cardiolipin synthetase domain-containing protein  23.63 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1371  phospholipase D/transphosphatidylase  21.97 
 
 
540 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0130503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1579  cardiolipin synthetase  25.39 
 
 
484 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643479  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1424  phospholipase D/transphosphatidylase  22.61 
 
 
544 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.105 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5524  cardiolipin synthetase domain protein  24.58 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  21.45 
 
 
482 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5030  cardiolipin synthetase domain-containing protein  23.63 
 
 
397 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  22.6 
 
 
480 aa  47.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5439  cardiolipin synthetase domain protein  23.82 
 
 
397 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.443747 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1907  cardiolipin synthetase domain-containing protein  22.56 
 
 
378 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1870  cardiolipin synthetase  22.28 
 
 
377 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0003289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2054  cardiolipin synthetase domain-containing protein  22.56 
 
 
367 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900063  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2087  cardiolipin synthetase domain protein  22.56 
 
 
394 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5046  cardiolipin synthetase domain-containing protein  23.82 
 
 
397 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.560279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5195  cardiolipin synthetase domain-containing protein  23.55 
 
 
397 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5591  cardiolipin synthetase domain-containing protein  23.55 
 
 
397 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1436  phospholipase D/transphosphatidylase  22 
 
 
540 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  21.41 
 
 
401 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  26 
 
 
481 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5759  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.82 
 
 
519 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.47 
 
 
472 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.11 
 
 
374 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  22.96 
 
 
486 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  22.96 
 
 
486 aa  44.3  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  21.5 
 
 
478 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  20.94 
 
 
413 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  20.94 
 
 
413 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>