81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3749 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3207  phosphatidylserine synthase  82.6 
 
 		 452 aa  755    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3466  phosphatidylserine synthase  82.6 
 
 		 451 aa  755    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3344  phosphatidylserine synthase  82.6 
 
 		 451 aa  755    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00469023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1092  phosphatidylserine synthase  72.16 
 
 		 451 aa  667    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0886852  normal  0.0107866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2738  phosphatidylserine synthase  72.16 
 
 		 451 aa  667    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0459118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  71.46 
 
 		 451 aa  661    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  72.62 
 
 		 451 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 451 aa  927    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2872  phosphatidylserine synthase  72.16 
 
 		 451 aa  667    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554101  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  72.62 
 
 		 451 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  72.62 
 
 		 451 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2742  phosphatidylserine synthase  72.16 
 
 		 451 aa  667    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.933118  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  72.62 
 
 		 451 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  72.62 
 
 		 451 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3070  phosphatidylserine synthase  71.69 
 
 		 451 aa  650    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.917906  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  71.93 
 
 		 451 aa  666    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02443  hypothetical protein  72.16 
 
 		 451 aa  667    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  72.69 
 
 		 451 aa  655    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  72.45 
 
 		 451 aa  648    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1083  phospholipase D/Transphosphatidylase  72.16 
 
 		 451 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02479  phosphatidylserine synthase  72.16 
 
 		 451 aa  667    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  72.45 
 
 		 451 aa  647    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  70.83 
 
 		 451 aa  634  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0025  phosphatidylserine synthase  60.26 
 
 		 453 aa  555  1e-157  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0300  phosphatidylserine synthase  52.19 
 
 		 455 aa  476  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2876  phosphatidylserine synthase  52.68 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  50.68 
 
 		 450 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2677  phosphatidylserine synthase  48.64 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  49.77 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  48.64 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  48.08 
 
 		 450 aa  437  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3244  phosphatidylserine synthase  50.66 
 
 		 447 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  49.64 
 
 		 412 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3463  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  49.34 
 
 		 447 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  49.3 
 
 		 446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  48.86 
 
 		 437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  49.53 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  49.53 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  49.29 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  48.94 
 
 		 437 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  48.94 
 
 		 437 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  47.15 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  44.71 
 
 		 446 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  48.12 
 
 		 437 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  48.02 
 
 		 437 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  47.99 
 
 		 437 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  47.99 
 
 		 437 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  47.99 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1965  phosphatidylserine synthase  48.13 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0926  phosphatidylserine synthase  44.5 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  47.99 
 
 		 437 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3664  phosphatidylserine synthase  45.43 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2239  phosphatidylserine synthase  46.49 
 
 		 442 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2065  phosphatidylserine synthase  45.21 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.361576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2235  phosphatidylserine synthase  45.58 
 
 		 442 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.702334 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  25.21 
 
 		 543 aa  72.8  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  21.74 
 
 		 534 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47576  predicted protein  28.76 
 
 		 574 aa  57  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.124789  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.76 
 
 		 477 aa  54.3  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04600  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, putative  26.25 
 
 		 552 aa  51.2  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  22.08 
 
 		 486 aa  50.1  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  21.14 
 
 		 486 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  21.84 
 
 		 486 aa  49.3  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  22.14 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  21.28 
 
 		 480 aa  47.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.57 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.08 
 
 		 487 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  21.09 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.37 
 
 		 374 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.37 
 
 		 474 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2951  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.85 
 
 		 529 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  24.31 
 
 		 502 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01050  hypothetical protein  22.81 
 
 		 473 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.795141  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01043  predicted hydrolase  22.81 
 
 		 473 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.951902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2085  phopholipase D  22.81 
 
 		 473 aa  43.9  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.374109 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1426  phopholipase D  22.81 
 
 		 473 aa  43.5  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.33637  normal  0.352917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3283  phospholipase D/transphosphatidylase  23.7 
 
 		 505 aa  43.5  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1166  phopholipase D  22.81 
 
 		 476 aa  43.5  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.130412  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2599  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.81 
 
 		 493 aa  43.9  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0536182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2553  phospholipase D/transphosphatidylase  22.81 
 
 		 476 aa  43.5  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.424547  normal  0.39142 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  22.95 
 
 		 401 aa  43.5  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>