102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2031 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  90.39 
 
 
437 aa  833    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  76.2 
 
 
437 aa  699    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  91.53 
 
 
437 aa  842    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  91.76 
 
 
437 aa  842    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  75.06 
 
 
446 aa  697    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  91.53 
 
 
437 aa  842    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  74.14 
 
 
437 aa  677    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  91.76 
 
 
437 aa  833    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1965  phosphatidylserine synthase  77.8 
 
 
437 aa  695    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  100 
 
 
437 aa  904    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  91.76 
 
 
437 aa  833    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  78.49 
 
 
437 aa  729    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  77.8 
 
 
446 aa  729    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  91.76 
 
 
437 aa  833    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  80.32 
 
 
437 aa  743    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  91.76 
 
 
437 aa  833    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  50.8 
 
 
446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  51.25 
 
 
450 aa  445  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  50.8 
 
 
446 aa  443  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  52.67 
 
 
412 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2677  phosphatidylserine synthase  46.59 
 
 
445 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3244  phosphatidylserine synthase  46.7 
 
 
447 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115505  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2876  phosphatidylserine synthase  48.18 
 
 
477 aa  405  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3463  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  46.92 
 
 
447 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  47.51 
 
 
450 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0926  phosphatidylserine synthase  45.12 
 
 
442 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0300  phosphatidylserine synthase  45.37 
 
 
455 aa  380  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  49.13 
 
 
451 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  47.62 
 
 
451 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3207  phosphatidylserine synthase  48.89 
 
 
452 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3466  phosphatidylserine synthase  48.89 
 
 
451 aa  372  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880056  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3344  phosphatidylserine synthase  48.89 
 
 
451 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00469023  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02479  phosphatidylserine synthase  46.45 
 
 
451 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1083  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.45 
 
 
451 aa  361  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2742  phosphatidylserine synthase  46.45 
 
 
451 aa  361  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.933118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2872  phosphatidylserine synthase  46.45 
 
 
451 aa  361  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1092  phosphatidylserine synthase  46.45 
 
 
451 aa  361  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0886852  normal  0.0107866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2738  phosphatidylserine synthase  46.45 
 
 
451 aa  361  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0459118  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02443  hypothetical protein  46.45 
 
 
451 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  46.21 
 
 
451 aa  360  3e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  46.79 
 
 
451 aa  360  4e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0025  phosphatidylserine synthase  44.8 
 
 
453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3070  phosphatidylserine synthase  45.84 
 
 
451 aa  356  3.9999999999999996e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.917906  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  44.66 
 
 
451 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  44.66 
 
 
451 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  44.66 
 
 
451 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  44.66 
 
 
451 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  44.66 
 
 
451 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  45.48 
 
 
451 aa  353  5e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  46.21 
 
 
451 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  45.73 
 
 
451 aa  347  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3664  phosphatidylserine synthase  43.28 
 
 
442 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2065  phosphatidylserine synthase  43.51 
 
 
437 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.361576  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2239  phosphatidylserine synthase  41.72 
 
 
442 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2235  phosphatidylserine synthase  42.63 
 
 
442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.702334 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04600  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, putative  31.45 
 
 
552 aa  62  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  23.39 
 
 
534 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  21.95 
 
 
484 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.38 
 
 
477 aa  56.2  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  22.8 
 
 
477 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  24 
 
 
478 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.04 
 
 
487 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  20.13 
 
 
543 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  26.47 
 
 
479 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  21.86 
 
 
489 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.66 
 
 
487 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  24.65 
 
 
481 aa  50.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1562  phospholipase D/transphosphatidylase  22.87 
 
 
495 aa  50.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47576  predicted protein  25.15 
 
 
574 aa  50.1  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.124789  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  21.14 
 
 
484 aa  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  20.86 
 
 
482 aa  50.1  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  21.19 
 
 
480 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  26.47 
 
 
479 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  23.74 
 
 
486 aa  48.9  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  22.13 
 
 
487 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  23.74 
 
 
486 aa  47.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2054  cardiolipin synthetase domain-containing protein  22.4 
 
 
367 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1907  cardiolipin synthetase domain-containing protein  22.59 
 
 
378 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1371  phospholipase D/transphosphatidylase  21.21 
 
 
540 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0130503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  21.29 
 
 
478 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  22.85 
 
 
467 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2087  cardiolipin synthetase domain protein  22.59 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.53 
 
 
472 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1870  cardiolipin synthetase  22.4 
 
 
377 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0003289  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1156  phospholipase D/transphosphatidylase  22.28 
 
 
441 aa  45.1  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  23.64 
 
 
478 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  23.84 
 
 
482 aa  45.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2155  cardiolipin synthetase domain protein  22.38 
 
 
394 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000221314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2045  cardiolipin synthetase domain protein  23.01 
 
 
377 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  24.86 
 
 
486 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1424  phospholipase D/transphosphatidylase  21.55 
 
 
544 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1436  phospholipase D/transphosphatidylase  20.96 
 
 
540 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  22.37 
 
 
486 aa  43.9  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.17 
 
 
472 aa  43.9  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  22.07 
 
 
484 aa  43.5  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  18.82 
 
 
374 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5477  cardiolipin synthetase domain-containing protein  21.93 
 
 
397 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  22.15 
 
 
492 aa  43.5  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  23.17 
 
 
509 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5759  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.37 
 
 
519 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>