256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2235 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3664  phosphatidylserine synthase  91.86 
 
 		 442 aa  805    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2239  phosphatidylserine synthase  89.82 
 
 		 442 aa  773    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2065  phosphatidylserine synthase  92.45 
 
 		 437 aa  775    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.361576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2235  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 442 aa  889    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.702334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3463  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  59.09 
 
 		 447 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3244  phosphatidylserine synthase  58.41 
 
 		 447 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2876  phosphatidylserine synthase  55.68 
 
 		 477 aa  501  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2677  phosphatidylserine synthase  48.07 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  47.83 
 
 		 446 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  46.59 
 
 		 446 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  43.67 
 
 		 450 aa  391  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  46.68 
 
 		 451 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  46.97 
 
 		 412 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  45.37 
 
 		 451 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3466  phosphatidylserine synthase  45.13 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3207  phosphatidylserine synthase  45.13 
 
 		 452 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3070  phosphatidylserine synthase  43.71 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.917906  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3344  phosphatidylserine synthase  45.13 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00469023  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  44.66 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02479  phosphatidylserine synthase  43.47 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1083  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.47 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  42.99 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  43.94 
 
 		 451 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1092  phosphatidylserine synthase  43.47 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0886852  normal  0.0107866 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02443  hypothetical protein  43.47 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2738  phosphatidylserine synthase  43.47 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0459118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  43.94 
 
 		 451 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  43.94 
 
 		 451 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2742  phosphatidylserine synthase  43.47 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.933118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  43.28 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  41.82 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2872  phosphatidylserine synthase  43.47 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554101  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  43.94 
 
 		 451 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  43.94 
 
 		 451 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  43.23 
 
 		 451 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  44.89 
 
 		 451 aa  364  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0300  phosphatidylserine synthase  42.44 
 
 		 455 aa  362  7.0000000000000005e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0025  phosphatidylserine synthase  42.99 
 
 		 453 aa  361  1e-98  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  43.74 
 
 		 437 aa  359  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  43.94 
 
 		 451 aa  358  7e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  43.51 
 
 		 437 aa  358  8e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  43.74 
 
 		 437 aa  358  9e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  41.82 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  43.34 
 
 		 437 aa  355  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  42.6 
 
 		 437 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  41.48 
 
 		 446 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  42.14 
 
 		 437 aa  352  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  42.63 
 
 		 437 aa  350  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  42.82 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  42.82 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  42.82 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  42.82 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  42.14 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1965  phosphatidylserine synthase  42.99 
 
 		 437 aa  336  5e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0926  phosphatidylserine synthase  39.68 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  25.06 
 
 		 534 aa  73.2  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04600  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, putative  22.59 
 
 		 552 aa  70.9  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  21.74 
 
 		 543 aa  67.8  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2155  cardiolipin synthetase domain protein  24.2 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000221314  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2123  cardiolipin synthetase domain-containing protein  24.54 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  24.68 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1860  cardiolipin synthetase  24.27 
 
 		 367 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.68141  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  23.42 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1870  cardiolipin synthetase  23.87 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0003289  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1907  cardiolipin synthetase domain-containing protein  23.87 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2054  cardiolipin synthetase domain-containing protein  23.87 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900063  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2087  cardiolipin synthetase domain protein  23.81 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  33.33 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  33.57 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  22.37 
 
 		 484 aa  59.7  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  23.2 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  23.2 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1869  cardiolipin synthetase domain-containing protein  21.18 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  31.06 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  25.87 
 
 		 485 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  23.76 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  22.83 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  24.23 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.84 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  30.32 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  22.83 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3264  cardiolipin synthetase domain protein  21.82 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.415257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  30.32 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  23.42 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  27.15 
 
 		 484 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  23.42 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2045  cardiolipin synthetase domain protein  21.56 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  23.42 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  23.42 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  23.42 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  27.48 
 
 		 486 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  27.48 
 
 		 486 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6327  cardiolipin synthase 2  23.34 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139699  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.32 
 
 		 489 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.75 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  28.47 
 
 		 477 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  27.48 
 
 		 486 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  28.03 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  25.74 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  25.74 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>