58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_63914 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  100 
 
 
543 aa  1123    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  49.8 
 
 
534 aa  442  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04600  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, putative  29.77 
 
 
552 aa  229  7e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  25 
 
 
451 aa  85.1  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  25 
 
 
450 aa  85.1  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  25.11 
 
 
451 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  22.7 
 
 
446 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  23.77 
 
 
451 aa  81.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3070  phosphatidylserine synthase  24.67 
 
 
451 aa  80.9  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.917906  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3344  phosphatidylserine synthase  24.24 
 
 
451 aa  80.5  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00469023  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3466  phosphatidylserine synthase  24.24 
 
 
451 aa  80.5  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880056  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3207  phosphatidylserine synthase  24.24 
 
 
452 aa  80.5  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2876  phosphatidylserine synthase  24.26 
 
 
477 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0025  phosphatidylserine synthase  24.84 
 
 
453 aa  79  0.0000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3244  phosphatidylserine synthase  23.14 
 
 
447 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115505  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1092  phosphatidylserine synthase  24.62 
 
 
451 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0886852  normal  0.0107866 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2872  phosphatidylserine synthase  24.62 
 
 
451 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2742  phosphatidylserine synthase  24.62 
 
 
451 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.933118  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2738  phosphatidylserine synthase  24.62 
 
 
451 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0459118  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02443  hypothetical protein  24.62 
 
 
451 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02479  phosphatidylserine synthase  24.62 
 
 
451 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1083  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.62 
 
 
451 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3463  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  22.39 
 
 
447 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  25.05 
 
 
451 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  23.21 
 
 
446 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  25.05 
 
 
451 aa  76.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2677  phosphatidylserine synthase  22.57 
 
 
445 aa  73.9  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  25.21 
 
 
451 aa  73.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  24.66 
 
 
450 aa  72  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  24.57 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  24.57 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  24.57 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  24.57 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  24.57 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0926  phosphatidylserine synthase  22.35 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  21.11 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47576  predicted protein  29.84 
 
 
574 aa  67  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.124789  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0300  phosphatidylserine synthase  22.4 
 
 
455 aa  66.6  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2239  phosphatidylserine synthase  22.71 
 
 
442 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3664  phosphatidylserine synthase  22.15 
 
 
442 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  21.44 
 
 
437 aa  63.5  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  21.44 
 
 
437 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  21.44 
 
 
437 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  21.44 
 
 
437 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  22.45 
 
 
451 aa  62.4  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2065  phosphatidylserine synthase  22.85 
 
 
437 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.361576  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  20.88 
 
 
437 aa  58.2  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2235  phosphatidylserine synthase  22.39 
 
 
442 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.702334 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  21.38 
 
 
412 aa  57  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  21.1 
 
 
437 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  20.88 
 
 
437 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  20.88 
 
 
437 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  21.64 
 
 
437 aa  55.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  19.73 
 
 
437 aa  54.3  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  19.91 
 
 
446 aa  53.9  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  22.4 
 
 
437 aa  52.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  20.13 
 
 
437 aa  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  22.37 
 
 
446 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>