152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00243 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  88.83 
 
 		 412 aa  776    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  72.87 
 
 		 446 aa  699    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2677  phosphatidylserine synthase  66.52 
 
 		 445 aa  641    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 446 aa  922    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  61.4 
 
 		 450 aa  590  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2876  phosphatidylserine synthase  50.22 
 
 		 477 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  52.05 
 
 		 437 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3463  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  49.55 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  50.8 
 
 		 437 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  51.03 
 
 		 437 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  50.8 
 
 		 437 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  50.34 
 
 		 437 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3244  phosphatidylserine synthase  48.19 
 
 		 447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  49.89 
 
 		 437 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  50.8 
 
 		 437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  49.89 
 
 		 437 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  50.57 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  50 
 
 		 446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  49.89 
 
 		 437 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  49.89 
 
 		 437 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  49.2 
 
 		 437 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  49.2 
 
 		 437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  48.52 
 
 		 446 aa  435  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1965  phosphatidylserine synthase  48.97 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3207  phosphatidylserine synthase  50.96 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3466  phosphatidylserine synthase  50.96 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3344  phosphatidylserine synthase  50.96 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00469023  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  50.96 
 
 		 451 aa  433  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  47.74 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  50.72 
 
 		 451 aa  428  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  48.33 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02479  phosphatidylserine synthase  48.56 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1083  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.56 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  49.05 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  48.33 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0300  phosphatidylserine synthase  46.31 
 
 		 455 aa  423  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  48.33 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  48.33 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02443  hypothetical protein  48.56 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2742  phosphatidylserine synthase  48.56 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.933118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  48.33 
 
 		 451 aa  421  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2872  phosphatidylserine synthase  48.56 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554101  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  48.33 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1092  phosphatidylserine synthase  48.56 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0886852  normal  0.0107866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2738  phosphatidylserine synthase  48.56 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0459118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  48.09 
 
 		 451 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  48.81 
 
 		 451 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3070  phosphatidylserine synthase  49.04 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.917906  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  48.81 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3664  phosphatidylserine synthase  47.25 
 
 		 442 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0025  phosphatidylserine synthase  44.65 
 
 		 453 aa  398  1e-109  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0926  phosphatidylserine synthase  45.37 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2239  phosphatidylserine synthase  46.79 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2065  phosphatidylserine synthase  47.48 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.361576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2235  phosphatidylserine synthase  47.83 
 
 		 442 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.702334 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  22.7 
 
 		 543 aa  82.8  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  23.67 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04600  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, putative  28.4 
 
 		 552 aa  65.1  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  22.81 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  22.81 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.91 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.75 
 
 		 478 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  22.96 
 
 		 426 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4172  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.08 
 
 		 564 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4284  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.08 
 
 		 564 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.730338 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5439  cardiolipin synthetase domain protein  21.07 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.443747 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1280  cardiolipin synthase 2  22.07 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  23.27 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5046  cardiolipin synthetase domain-containing protein  21.07 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.560279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  23.45 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5030  cardiolipin synthetase domain-containing protein  20.51 
 
 		 397 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  22.7 
 
 		 477 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  28.06 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5524  cardiolipin synthetase domain protein  21.07 
 
 		 397 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5195  cardiolipin synthetase domain-containing protein  20 
 
 		 397 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5591  cardiolipin synthetase domain-containing protein  20 
 
 		 397 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.82 
 
 		 472 aa  50.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  23.16 
 
 		 484 aa  50.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4980  phospholipase D/transphosphatidylase  29.58 
 
 		 538 aa  50.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  27.52 
 
 		 482 aa  50.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  24.83 
 
 		 485 aa  49.7  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  20.38 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  20.38 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  23.08 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  23.08 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  20.38 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  20.38 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  20.38 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0557  phospholipase D family protein  23.45 
 
 		 474 aa  48.5  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.362522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  23.2 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2154  phospholipase D/transphosphatidylase  22.7 
 
 		 518 aa  48.5  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0310472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2155  cardiolipin synthetase domain protein  22.02 
 
 		 394 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000221314  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  22.89 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  20.83 
 
 		 481 aa  47.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  20.33 
 
 		 472 aa  47.8  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3346  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.84 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000729556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  20.39 
 
 		 494 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  20.39 
 
 		 494 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  21.46 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5144  phospholipase D/transphosphatidylase  21.23 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>