160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1779 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  77.8 
 
 		 437 aa  716    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  75.51 
 
 		 437 aa  699    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 437 aa  904    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  76.2 
 
 		 437 aa  704    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  75.97 
 
 		 437 aa  703    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  75.29 
 
 		 446 aa  695    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  75.97 
 
 		 437 aa  703    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  70.71 
 
 		 437 aa  644    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  77.8 
 
 		 437 aa  716    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1965  phosphatidylserine synthase  72.77 
 
 		 437 aa  652    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  76.2 
 
 		 437 aa  699    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  77.8 
 
 		 437 aa  716    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  72.77 
 
 		 437 aa  672    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  75.29 
 
 		 437 aa  694    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  73.68 
 
 		 446 aa  681    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  77.57 
 
 		 437 aa  714    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  49.2 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  49.66 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  51.56 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  50.73 
 
 		 412 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2677  phosphatidylserine synthase  45.91 
 
 		 445 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2876  phosphatidylserine synthase  48.64 
 
 		 477 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3244  phosphatidylserine synthase  46.24 
 
 		 447 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3463  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  46.47 
 
 		 447 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  44.55 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1092  phosphatidylserine synthase  45.11 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0886852  normal  0.0107866 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02479  phosphatidylserine synthase  45.11 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1083  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.11 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  45.35 
 
 		 451 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3344  phosphatidylserine synthase  47.14 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00469023  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  45.95 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02443  hypothetical protein  45.11 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2738  phosphatidylserine synthase  45.11 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0459118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3207  phosphatidylserine synthase  47.14 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2742  phosphatidylserine synthase  45.11 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.933118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2872  phosphatidylserine synthase  45.11 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3466  phosphatidylserine synthase  47.14 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  44.87 
 
 		 451 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0300  phosphatidylserine synthase  43.79 
 
 		 455 aa  366  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3070  phosphatidylserine synthase  45.82 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.917906  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  48.17 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0926  phosphatidylserine synthase  43.05 
 
 		 442 aa  364  2e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  44.87 
 
 		 451 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  44.87 
 
 		 451 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  44.87 
 
 		 451 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  44.87 
 
 		 451 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  44.87 
 
 		 451 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  46.43 
 
 		 451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0025  phosphatidylserine synthase  42.95 
 
 		 453 aa  353  5e-96  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  45 
 
 		 451 aa  340  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  44.76 
 
 		 451 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3664  phosphatidylserine synthase  41.69 
 
 		 442 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2239  phosphatidylserine synthase  40.77 
 
 		 442 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2065  phosphatidylserine synthase  41.46 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.361576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2235  phosphatidylserine synthase  42.14 
 
 		 442 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.702334 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  23.53 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  22.99 
 
 		 476 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1156  phospholipase D/transphosphatidylase  24.4 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  29.95 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  23.48 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04600  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, putative  27.56 
 
 		 552 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  22.1 
 
 		 477 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  19.73 
 
 		 543 aa  54.3  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1371  phospholipase D/transphosphatidylase  21.83 
 
 		 540 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130503 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  21.63 
 
 		 484 aa  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 482 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  23.7 
 
 		 477 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  19.56 
 
 		 494 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  19.56 
 
 		 494 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1387  cardiolipin synthetase 2  21.78 
 
 		 477 aa  50.8  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  21.23 
 
 		 484 aa  51.2  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1436  phospholipase D/transphosphatidylase  21.43 
 
 		 540 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0871  phospholipase D/transphosphatidylase  23.73 
 
 		 520 aa  50.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  22.47 
 
 		 477 aa  50.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  29.03 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  21.29 
 
 		 482 aa  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2333  phospholipase D/transphosphatidylase  23.12 
 
 		 514 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.271927 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5144  phospholipase D/transphosphatidylase  29.58 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5477  cardiolipin synthetase domain-containing protein  29.58 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  26 
 
 		 486 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  20.26 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0340  phospholipase D/transphosphatidylase  22.02 
 
 		 519 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22272  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  20.82 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.98 
 
 		 487 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000670  cardiolipin synthetase  24.68 
 
 		 505 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  26.83 
 
 		 483 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5524  cardiolipin synthetase domain protein  28.87 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5030  cardiolipin synthetase domain-containing protein  28.17 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5195  cardiolipin synthetase domain-containing protein  28.17 
 
 		 397 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5046  cardiolipin synthetase domain-containing protein  28.17 
 
 		 397 aa  47  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.560279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5439  cardiolipin synthetase domain protein  28.17 
 
 		 397 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.443747 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5591  cardiolipin synthetase domain-containing protein  28.17 
 
 		 397 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.45 
 
 		 485 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  23.68 
 
 		 486 aa  47  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  23.84 
 
 		 486 aa  47  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5759  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.37 
 
 		 519 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  21.39 
 
 		 487 aa  46.6  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  21.99 
 
 		 470 aa  46.6  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  25.5 
 
 		 486 aa  46.6  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  22.03 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>