67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2864 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  92.81 
 
 
451 aa  842    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3070  phosphatidylserine synthase  88.4 
 
 
451 aa  808    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.917906  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3207  phosphatidylserine synthase  72.85 
 
 
452 aa  667    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2742  phosphatidylserine synthase  93.5 
 
 
451 aa  848    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.933118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2872  phosphatidylserine synthase  93.5 
 
 
451 aa  848    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  72.62 
 
 
451 aa  669    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3466  phosphatidylserine synthase  72.85 
 
 
451 aa  667    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880056  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3344  phosphatidylserine synthase  72.85 
 
 
451 aa  667    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00469023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1092  phosphatidylserine synthase  93.5 
 
 
451 aa  848    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0886852  normal  0.0107866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2738  phosphatidylserine synthase  93.5 
 
 
451 aa  848    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0459118  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02479  phosphatidylserine synthase  93.5 
 
 
451 aa  848    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  100 
 
 
451 aa  928    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  100 
 
 
451 aa  928    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  100 
 
 
451 aa  928    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  100 
 
 
451 aa  928    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  100 
 
 
451 aa  928    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  93.27 
 
 
451 aa  847    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02443  hypothetical protein  93.5 
 
 
451 aa  848    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  72.22 
 
 
451 aa  644    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  71.06 
 
 
451 aa  636    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1083  phospholipase D/Transphosphatidylase  93.5 
 
 
451 aa  848    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  69.68 
 
 
451 aa  633  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  70.37 
 
 
451 aa  628  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0025  phosphatidylserine synthase  57.62 
 
 
453 aa  538  1e-151  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2876  phosphatidylserine synthase  52.23 
 
 
477 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0300  phosphatidylserine synthase  51.32 
 
 
455 aa  459  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  48.86 
 
 
446 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  48.17 
 
 
446 aa  442  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  47.95 
 
 
450 aa  432  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3463  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  50.66 
 
 
447 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3244  phosphatidylserine synthase  50.44 
 
 
447 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115505  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2677  phosphatidylserine synthase  47.27 
 
 
445 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  47.63 
 
 
450 aa  425  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  48.92 
 
 
412 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  46.91 
 
 
437 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  44.17 
 
 
446 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  45.27 
 
 
437 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  45 
 
 
446 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  44.87 
 
 
437 aa  382  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1965  phosphatidylserine synthase  45.8 
 
 
437 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3664  phosphatidylserine synthase  44.98 
 
 
442 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  45.68 
 
 
437 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  45.68 
 
 
437 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  45.68 
 
 
437 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  45.68 
 
 
437 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  45.79 
 
 
437 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  44.67 
 
 
437 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  44.55 
 
 
437 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  44.42 
 
 
437 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  44.32 
 
 
437 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  44.32 
 
 
437 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2065  phosphatidylserine synthase  44.75 
 
 
437 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.361576  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2239  phosphatidylserine synthase  45.8 
 
 
442 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0926  phosphatidylserine synthase  41.24 
 
 
442 aa  356  5.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2235  phosphatidylserine synthase  44.9 
 
 
442 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.702334 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  24.57 
 
 
543 aa  71.6  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  22.72 
 
 
534 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04600  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, putative  28.26 
 
 
552 aa  56.6  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  24.11 
 
 
477 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.37 
 
 
374 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.37 
 
 
474 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  21.69 
 
 
481 aa  46.2  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.71 
 
 
419 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  21.8 
 
 
486 aa  44.7  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  22.28 
 
 
480 aa  43.9  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47576  predicted protein  26.74 
 
 
574 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.124789  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  21.8 
 
 
486 aa  43.5  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>