75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2951 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2872  phosphatidylserine synthase  99.33 
 
 		 451 aa  922    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3466  phosphatidylserine synthase  72.39 
 
 		 451 aa  658    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3344  phosphatidylserine synthase  72.39 
 
 		 451 aa  658    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00469023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1092  phosphatidylserine synthase  99.33 
 
 		 451 aa  922    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0886852  normal  0.0107866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2738  phosphatidylserine synthase  99.33 
 
 		 451 aa  922    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0459118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 451 aa  927    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  92.81 
 
 		 451 aa  842    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  92.81 
 
 		 451 aa  842    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  71.46 
 
 		 451 aa  661    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  92.81 
 
 		 451 aa  842    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  92.81 
 
 		 451 aa  842    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  92.81 
 
 		 451 aa  842    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  99.11 
 
 		 451 aa  920    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2742  phosphatidylserine synthase  99.33 
 
 		 451 aa  922    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.933118  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3070  phosphatidylserine synthase  89.1 
 
 		 451 aa  810    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.917906  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3207  phosphatidylserine synthase  72.39 
 
 		 452 aa  659    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02443  hypothetical protein  99.33 
 
 		 451 aa  922    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  71.3 
 
 		 451 aa  637    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1083  phospholipase D/Transphosphatidylase  99.33 
 
 		 451 aa  922    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02479  phosphatidylserine synthase  99.33 
 
 		 451 aa  922    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  69.44 
 
 		 451 aa  633  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  70.14 
 
 		 451 aa  630  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  70.37 
 
 		 451 aa  629  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0025  phosphatidylserine synthase  56.73 
 
 		 453 aa  535  1e-151  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0300  phosphatidylserine synthase  51.1 
 
 		 455 aa  467  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2876  phosphatidylserine synthase  52.16 
 
 		 477 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  48.64 
 
 		 446 aa  443  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  47.95 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3463  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  50.44 
 
 		 447 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3244  phosphatidylserine synthase  50 
 
 		 447 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  47.4 
 
 		 450 aa  430  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2677  phosphatidylserine synthase  46.59 
 
 		 445 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  47.5 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  47.94 
 
 		 412 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  46.59 
 
 		 437 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  45.33 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  47.27 
 
 		 437 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  47.27 
 
 		 437 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  47.27 
 
 		 437 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  47.62 
 
 		 437 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  45.33 
 
 		 446 aa  385  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  45.91 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  45.79 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  45.68 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  45.68 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  44.77 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1965  phosphatidylserine synthase  46.82 
 
 		 437 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  46.71 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  44.37 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  45.56 
 
 		 437 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3664  phosphatidylserine synthase  44.06 
 
 		 442 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2065  phosphatidylserine synthase  43.84 
 
 		 437 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.361576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2239  phosphatidylserine synthase  44.9 
 
 		 442 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0926  phosphatidylserine synthase  40.55 
 
 		 442 aa  348  8e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2235  phosphatidylserine synthase  43.76 
 
 		 442 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.702334 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  24.62 
 
 		 543 aa  76.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  23.56 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04600  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, putative  28.26 
 
 		 552 aa  56.6  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  23.1 
 
 		 534 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.75 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.45 
 
 		 474 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  21.64 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  25.14 
 
 		 478 aa  46.6  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  24.27 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  20.45 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.94 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  22.01 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47576  predicted protein  25.58 
 
 		 574 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.124789  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  21.3 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  21.62 
 
 		 424 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0845  phospholipase D/transphosphatidylase  25.68 
 
 		 517 aa  44.3  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.17 
 
 		 478 aa  43.9  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.16 
 
 		 483 aa  43.5  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  25.17 
 
 		 478 aa  43.1  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  21.34 
 
 		 472 aa  43.1  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>