99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2327 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  80.78 
 
 		 437 aa  751    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  72.77 
 
 		 437 aa  672    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  84.44 
 
 		 437 aa  794    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  81.46 
 
 		 437 aa  755    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  80.78 
 
 		 446 aa  763    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  80.32 
 
 		 437 aa  743    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  81.69 
 
 		 437 aa  757    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  80.55 
 
 		 437 aa  749    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 437 aa  906    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1965  phosphatidylserine synthase  79.63 
 
 		 437 aa  714    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  80.09 
 
 		 437 aa  745    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  72.54 
 
 		 446 aa  690    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  81.46 
 
 		 437 aa  755    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  81.46 
 
 		 437 aa  755    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  80.78 
 
 		 437 aa  749    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  70.48 
 
 		 437 aa  657    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  49.2 
 
 		 446 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  52.91 
 
 		 412 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  51.71 
 
 		 450 aa  442  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  48.29 
 
 		 446 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2876  phosphatidylserine synthase  49.55 
 
 		 477 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2677  phosphatidylserine synthase  45.72 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3244  phosphatidylserine synthase  47.61 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3463  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  48.06 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  47.05 
 
 		 450 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0926  phosphatidylserine synthase  46.28 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  46.9 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0300  phosphatidylserine synthase  45.37 
 
 		 455 aa  378  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3207  phosphatidylserine synthase  46.68 
 
 		 452 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3466  phosphatidylserine synthase  46.68 
 
 		 451 aa  372  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3344  phosphatidylserine synthase  46.68 
 
 		 451 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00469023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  47.02 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  46.92 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  47.16 
 
 		 451 aa  364  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  45.75 
 
 		 451 aa  362  6e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02479  phosphatidylserine synthase  45.11 
 
 		 451 aa  356  5e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2738  phosphatidylserine synthase  45.11 
 
 		 451 aa  356  5e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0459118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1092  phosphatidylserine synthase  45.11 
 
 		 451 aa  356  5e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0886852  normal  0.0107866 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02443  hypothetical protein  45.11 
 
 		 451 aa  356  5e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1083  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.11 
 
 		 451 aa  356  5e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2742  phosphatidylserine synthase  45.11 
 
 		 451 aa  356  5e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.933118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2872  phosphatidylserine synthase  45.11 
 
 		 451 aa  356  5e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554101  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  45.35 
 
 		 451 aa  355  5.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  45.58 
 
 		 451 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  45.58 
 
 		 451 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  45.58 
 
 		 451 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  45.58 
 
 		 451 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  45.58 
 
 		 451 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  44.87 
 
 		 451 aa  355  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3070  phosphatidylserine synthase  45.82 
 
 		 451 aa  355  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.917906  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0025  phosphatidylserine synthase  43.64 
 
 		 453 aa  348  9e-95  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3664  phosphatidylserine synthase  43.28 
 
 		 442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2065  phosphatidylserine synthase  43.51 
 
 		 437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.361576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2239  phosphatidylserine synthase  42.14 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2235  phosphatidylserine synthase  43.34 
 
 		 442 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.702334 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  23.31 
 
 		 534 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04600  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, putative  30.57 
 
 		 552 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1611  cardiolipin synthetase  23.35 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773793  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  22.4 
 
 		 543 aa  52.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1796  cardiolipin synthetase domain-containing protein  23.35 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1844  cardiolipin synthetase domain protein  23.35 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.222229 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  23.33 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1664  cardiolipin synthetase domain-containing protein  23.35 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0639115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1642  cardiolipin synthetase  23.35 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00018349  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.99 
 
 		 477 aa  50.8  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  21.04 
 
 		 476 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  22.87 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  22.87 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  22.87 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  22.87 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  22.87 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  21.18 
 
 		 484 aa  50.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  19.53 
 
 		 482 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  20.78 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  24.44 
 
 		 479 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1662  phospholipase D/transphosphatidylase  23.08 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  23.84 
 
 		 482 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.05 
 
 		 478 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  20.34 
 
 		 478 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  27.33 
 
 		 485 aa  47.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5144  phospholipase D/transphosphatidylase  22.11 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  26.49 
 
 		 481 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  23.7 
 
 		 479 aa  46.6  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.19 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  21.45 
 
 		 470 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3533  cardiolipin synthetase domain protein  22.25 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.05 
 
 		 478 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.28 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1869  cardiolipin synthetase domain-containing protein  22.25 
 
 		 403 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  23.56 
 
 		 477 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.75 
 
 		 487 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1918  cardiolipin synthetase domain protein  23.08 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  22.63 
 
 		 477 aa  43.9  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  19.78 
 
 		 478 aa  44.3  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2951  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.94 
 
 		 529 aa  43.9  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  21.39 
 
 		 471 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47576  predicted protein  23.81 
 
 		 574 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.124789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  22.74 
 
 		 478 aa  43.5  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.31 
 
 		 374 aa  43.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>