64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0851 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02479  phosphatidylserine synthase  69.91 
 
 
451 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3207  phosphatidylserine synthase  71.3 
 
 
452 aa  652    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2742  phosphatidylserine synthase  69.91 
 
 
451 aa  635    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.933118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2872  phosphatidylserine synthase  69.91 
 
 
451 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  72.69 
 
 
451 aa  655    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3466  phosphatidylserine synthase  71.3 
 
 
451 aa  652    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880056  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3344  phosphatidylserine synthase  71.3 
 
 
451 aa  652    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00469023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1092  phosphatidylserine synthase  69.91 
 
 
451 aa  635    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0886852  normal  0.0107866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2738  phosphatidylserine synthase  69.91 
 
 
451 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0459118  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1083  phospholipase D/Transphosphatidylase  69.91 
 
 
451 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  77.96 
 
 
451 aa  711    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  77.49 
 
 
451 aa  709    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  100 
 
 
451 aa  922    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02443  hypothetical protein  69.91 
 
 
451 aa  635    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  81.67 
 
 
451 aa  731    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  69.68 
 
 
451 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  69.68 
 
 
451 aa  634  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  69.44 
 
 
451 aa  634  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  69.68 
 
 
451 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  69.68 
 
 
451 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  69.68 
 
 
451 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  69.68 
 
 
451 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3070  phosphatidylserine synthase  70.14 
 
 
451 aa  629  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.917906  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0025  phosphatidylserine synthase  58.2 
 
 
453 aa  524  1e-147  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2876  phosphatidylserine synthase  52.85 
 
 
477 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  52.27 
 
 
446 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0300  phosphatidylserine synthase  50.22 
 
 
455 aa  456  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  48.86 
 
 
446 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2677  phosphatidylserine synthase  47.95 
 
 
445 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3463  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  50 
 
 
447 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3244  phosphatidylserine synthase  50 
 
 
447 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115505  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  50.57 
 
 
450 aa  433  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  46.29 
 
 
450 aa  424  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  48.79 
 
 
412 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  48.61 
 
 
437 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  46.26 
 
 
437 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  47.05 
 
 
446 aa  388  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  45.25 
 
 
446 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  46.07 
 
 
437 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1965  phosphatidylserine synthase  47.4 
 
 
437 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3664  phosphatidylserine synthase  45.89 
 
 
442 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  46.36 
 
 
437 aa  375  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  45.58 
 
 
437 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  45.8 
 
 
437 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  45.8 
 
 
437 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  46.59 
 
 
437 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  45.45 
 
 
437 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  45.35 
 
 
437 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  45.8 
 
 
437 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  45.8 
 
 
437 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2065  phosphatidylserine synthase  45.66 
 
 
437 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.361576  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  46.03 
 
 
437 aa  372  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2239  phosphatidylserine synthase  46.26 
 
 
442 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0926  phosphatidylserine synthase  41.31 
 
 
442 aa  363  4e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2235  phosphatidylserine synthase  46.03 
 
 
442 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.702334 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  23.77 
 
 
543 aa  81.3  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  24.13 
 
 
534 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04600  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, putative  26.25 
 
 
552 aa  57.4  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47576  predicted protein  27.27 
 
 
574 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.124789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.56 
 
 
374 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  31.52 
 
 
502 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3416  phospholipase D/transphosphatidylase  21.9 
 
 
486 aa  43.5  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  24.31 
 
 
486 aa  43.5  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  22.46 
 
 
478 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>