36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47576 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47576  predicted protein  100 
 
 		 574 aa  1188    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.124789  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  23.41 
 
 		 543 aa  70.1  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04600  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, putative  28.48 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  28.76 
 
 		 451 aa  57  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  25.41 
 
 		 437 aa  56.2  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  25.75 
 
 		 437 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  44.44 
 
 		 534 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  25.75 
 
 		 437 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  25.75 
 
 		 437 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  27.36 
 
 		 451 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  26.35 
 
 		 437 aa  51.2  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  25.15 
 
 		 437 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  26.86 
 
 		 451 aa  50.8  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  25.15 
 
 		 437 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  25.15 
 
 		 437 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  25.15 
 
 		 437 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  25.15 
 
 		 437 aa  50.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  26.56 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  28.65 
 
 		 451 aa  48.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  26.84 
 
 		 451 aa  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  22.75 
 
 		 446 aa  47.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  24.42 
 
 		 446 aa  47.4  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1965  phosphatidylserine synthase  25 
 
 		 437 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  26.37 
 
 		 450 aa  45.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  24.4 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  23.95 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  27.72 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  25.58 
 
 		 451 aa  44.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  25.68 
 
 		 451 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  25.68 
 
 		 451 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  25.68 
 
 		 451 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  25.68 
 
 		 451 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  25.68 
 
 		 451 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  25.71 
 
 		 451 aa  43.5  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  23.81 
 
 		 437 aa  43.5  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  35.92 
 
 		 446 aa  43.5  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>