92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1975 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 450 aa  917    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  47.74 
 
 		 446 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  51.19 
 
 		 451 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3466  phosphatidylserine synthase  50.71 
 
 		 451 aa  430  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3344  phosphatidylserine synthase  50.71 
 
 		 451 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00469023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3207  phosphatidylserine synthase  50.71 
 
 		 452 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2677  phosphatidylserine synthase  47.98 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  47.29 
 
 		 446 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  47.73 
 
 		 450 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0926  phosphatidylserine synthase  47.18 
 
 		 442 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2876  phosphatidylserine synthase  45.79 
 
 		 477 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  48.33 
 
 		 451 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  47.31 
 
 		 446 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  48.33 
 
 		 451 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  48.33 
 
 		 451 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  48.33 
 
 		 451 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  48.33 
 
 		 451 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  51.07 
 
 		 451 aa  415  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  49.32 
 
 		 437 aa  411  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0103936 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02479  phosphatidylserine synthase  47.62 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2742  phosphatidylserine synthase  47.62 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.933118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2872  phosphatidylserine synthase  47.62 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1092  phosphatidylserine synthase  47.62 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0886852  normal  0.0107866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2738  phosphatidylserine synthase  47.62 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0459118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  47.86 
 
 		 451 aa  408  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  47.38 
 
 		 451 aa  408  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02443  hypothetical protein  47.62 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1083  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.62 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  47.46 
 
 		 412 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  47.05 
 
 		 437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0300  phosphatidylserine synthase  45.68 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  47.5 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  48.42 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3070  phosphatidylserine synthase  46.19 
 
 		 451 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.917906  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  47.5 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  48.42 
 
 		 437 aa  405  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  47.05 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  47.96 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  47.5 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  49.41 
 
 		 451 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  47.95 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  48.19 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3244  phosphatidylserine synthase  46.82 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0025  phosphatidylserine synthase  47.19 
 
 		 453 aa  401  9.999999999999999e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  47.51 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3463  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  46.36 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  47.73 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1965  phosphatidylserine synthase  47.51 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  48.46 
 
 		 451 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  44.55 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  48.93 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3664  phosphatidylserine synthase  42.05 
 
 		 442 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2239  phosphatidylserine synthase  43.18 
 
 		 442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2065  phosphatidylserine synthase  41.36 
 
 		 437 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.361576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2235  phosphatidylserine synthase  41.82 
 
 		 442 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.702334 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  25 
 
 		 543 aa  85.1  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04600  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, putative  31.21 
 
 		 552 aa  77  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  30.64 
 
 		 534 aa  60.5  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2951  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.71 
 
 		 529 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  20.54 
 
 		 477 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  20.3 
 
 		 480 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0493  phospholipase D, putative  25.81 
 
 		 553 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000670  cardiolipin synthetase  23.03 
 
 		 505 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6079  phospholipase D/transphosphatidylase  27.14 
 
 		 541 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  20.65 
 
 		 484 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2558  phospholipase D family protein  26.85 
 
 		 550 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0978  phospholipase D, putative  26.17 
 
 		 595 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0208  putative phospholipase D  26.17 
 
 		 550 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0547  phospholipase D/transphosphatidylase  27.14 
 
 		 549 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1383  putative phospholipase D  26.17 
 
 		 550 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1580  putative phospholipase D  26.17 
 
 		 550 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2702  phospholipase D family protein  26.17 
 
 		 550 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0239  putative phospholipase D  26.17 
 
 		 550 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2202  phopholipase D-family protein  27.21 
 
 		 508 aa  47  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  21.21 
 
 		 492 aa  46.6  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  20.39 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3283  phospholipase D/transphosphatidylase  21.99 
 
 		 505 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5588  putative phospholipase D/transphosphatidylase  23.97 
 
 		 534 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2752  phospholipase D/transphosphatidylase  25.18 
 
 		 540 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47576  predicted protein  26.37 
 
 		 574 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.124789  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2139  phospholipase D/transphosphatidylase  25.18 
 
 		 540 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2777  phospholipase D/transphosphatidylase  25.18 
 
 		 540 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.15 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  20.71 
 
 		 484 aa  45.1  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2203  phospholipase D/transphosphatidylase  22.45 
 
 		 516 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3791  phospholipase D/transphosphatidylase  24.32 
 
 		 516 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  21.67 
 
 		 491 aa  44.3  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2801  phospholipase D/transphosphatidylase  25.18 
 
 		 540 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  25.5 
 
 		 482 aa  43.5  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3887  phospholipase D/transphosphatidylase  22.15 
 
 		 560 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40611  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4284  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.6 
 
 		 564 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.730338 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4172  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.6 
 
 		 564 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>