201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1747 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  74.83 
 
 		 437 aa  687    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  70.02 
 
 		 437 aa  652    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  70.71 
 
 		 437 aa  644    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  75.51 
 
 		 437 aa  685    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  74.83 
 
 		 437 aa  689    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  74.83 
 
 		 437 aa  689    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  69.57 
 
 		 446 aa  653    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  70.48 
 
 		 437 aa  657    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  74.6 
 
 		 437 aa  689    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 437 aa  902    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  75.29 
 
 		 437 aa  684    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  75.51 
 
 		 437 aa  685    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1965  phosphatidylserine synthase  71.62 
 
 		 437 aa  641    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  74.14 
 
 		 437 aa  677    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  75.51 
 
 		 437 aa  685    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  70.48 
 
 		 446 aa  656    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  52.05 
 
 		 446 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  52.62 
 
 		 450 aa  448  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  51.81 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2677  phosphatidylserine synthase  48.85 
 
 		 445 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  51.21 
 
 		 412 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3244  phosphatidylserine synthase  48.85 
 
 		 447 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3463  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  49.08 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2876  phosphatidylserine synthase  48.86 
 
 		 477 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  49.32 
 
 		 450 aa  411  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0926  phosphatidylserine synthase  44.8 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02479  phosphatidylserine synthase  47.14 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1083  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.14 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1092  phosphatidylserine synthase  47.14 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0886852  normal  0.0107866 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2872  phosphatidylserine synthase  47.14 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02443  hypothetical protein  47.14 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2742  phosphatidylserine synthase  47.14 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.933118  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2738  phosphatidylserine synthase  47.14 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0459118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3070  phosphatidylserine synthase  47.24 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.917906  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  47 
 
 		 451 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3466  phosphatidylserine synthase  48.77 
 
 		 451 aa  378  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  47 
 
 		 451 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  47 
 
 		 451 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  48.79 
 
 		 451 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  47 
 
 		 451 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  47 
 
 		 451 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  46.9 
 
 		 451 aa  378  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3344  phosphatidylserine synthase  48.77 
 
 		 451 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00469023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3207  phosphatidylserine synthase  48.77 
 
 		 452 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  46.67 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0025  phosphatidylserine synthase  45.66 
 
 		 453 aa  373  1e-102  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0300  phosphatidylserine synthase  44.49 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  48.28 
 
 		 451 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  47.37 
 
 		 451 aa  368  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  46.17 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  46.41 
 
 		 451 aa  362  6e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3664  phosphatidylserine synthase  43.05 
 
 		 442 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2239  phosphatidylserine synthase  42.82 
 
 		 442 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2065  phosphatidylserine synthase  42.82 
 
 		 437 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.361576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2235  phosphatidylserine synthase  43.28 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.702334 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  21.11 
 
 		 543 aa  67.8  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  23.4 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  23.88 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  23.4 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  23.4 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  23.74 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  24.2 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04600  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, putative  30.99 
 
 		 552 aa  63.5  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  24.8 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  23.36 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  26.34 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  23 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  22.87 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  22.87 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  22.87 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  22.87 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  22.87 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.11 
 
 		 487 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47576  predicted protein  25.41 
 
 		 574 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.124789  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  23.32 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  21.88 
 
 		 482 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.56 
 
 		 487 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  21.52 
 
 		 487 aa  55.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  23.89 
 
 		 482 aa  54.3  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  22.85 
 
 		 484 aa  53.9  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.87 
 
 		 474 aa  53.1  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1051  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.48 
 
 		 900 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  19.78 
 
 		 494 aa  53.1  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  19.78 
 
 		 494 aa  53.1  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  23.61 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0195  cardiolipin synthetase II  25.33 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0854  cardiolipin synthetase II  25.33 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2750  cardiolipin synthetase ybhO  25.33 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0693  cardiolipin synthetase ybhO  25.33 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  22.83 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  21.95 
 
 		 486 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1047  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.21 
 
 		 900 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170662  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0562  cardiolipin synthetase II  24.54 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.71 
 
 		 374 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  24.86 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2328  cardiolipin synthetase II  25.33 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  20.99 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0678  cardiolipin synthetase ybhO  25.33 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2408  cardiolipin synthetase ybhO  25.33 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1562  phospholipase D/transphosphatidylase  25.64 
 
 		 495 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.481198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>