138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2714 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 446 aa  926    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  74.27 
 
 		 412 aa  651    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  72.87 
 
 		 446 aa  699    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2677  phosphatidylserine synthase  65.16 
 
 		 445 aa  630  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  61.73 
 
 		 450 aa  577  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2876  phosphatidylserine synthase  49.33 
 
 		 477 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3463  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  50.34 
 
 		 447 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  50.8 
 
 		 437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3244  phosphatidylserine synthase  49.21 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  51.03 
 
 		 437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  51.03 
 
 		 437 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  50.8 
 
 		 437 aa  451  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  51.81 
 
 		 437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  50.11 
 
 		 437 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  50.11 
 
 		 437 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  50.8 
 
 		 437 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  50.11 
 
 		 437 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3207  phosphatidylserine synthase  52.14 
 
 		 452 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  50.11 
 
 		 437 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3466  phosphatidylserine synthase  52.14 
 
 		 451 aa  444  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3344  phosphatidylserine synthase  52.14 
 
 		 451 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00469023  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  49.66 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  51.9 
 
 		 451 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  50.11 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  52.86 
 
 		 451 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  52.14 
 
 		 451 aa  434  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  51.19 
 
 		 451 aa  434  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  47.87 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02479  phosphatidylserine synthase  49.52 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1083  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.52 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  49.29 
 
 		 451 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02443  hypothetical protein  49.52 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  49.29 
 
 		 451 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  47.29 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  49.29 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  49.29 
 
 		 451 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  49.29 
 
 		 451 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2742  phosphatidylserine synthase  49.52 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.933118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2872  phosphatidylserine synthase  49.52 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  50.24 
 
 		 451 aa  425  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1092  phosphatidylserine synthase  49.52 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0886852  normal  0.0107866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2738  phosphatidylserine synthase  49.52 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0459118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  48.29 
 
 		 437 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  49.29 
 
 		 451 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  48.06 
 
 		 446 aa  425  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  49.05 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1965  phosphatidylserine synthase  48.06 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0300  phosphatidylserine synthase  45.31 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3070  phosphatidylserine synthase  48.81 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.917906  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0025  phosphatidylserine synthase  44.87 
 
 		 453 aa  398  1e-109  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3664  phosphatidylserine synthase  46.56 
 
 		 442 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0926  phosphatidylserine synthase  44.34 
 
 		 442 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2239  phosphatidylserine synthase  46.24 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2065  phosphatidylserine synthase  46.56 
 
 		 437 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.361576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2235  phosphatidylserine synthase  46.59 
 
 		 442 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.702334 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  23.21 
 
 		 543 aa  75.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  23.64 
 
 		 534 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  22.09 
 
 		 494 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  22.09 
 
 		 494 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  23.3 
 
 		 424 aa  57  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04600  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, putative  25.9 
 
 		 552 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  20.83 
 
 		 481 aa  55.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  23.76 
 
 		 482 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2750  phospholipase D/transphosphatidylase  23.36 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2111  phospholipase D/transphosphatidylase  23.38 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2723  phospholipase D/transphosphatidylase  23.38 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159332  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0383  phospholipase D/transphosphatidylase  23.24 
 
 		 426 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505376  normal  0.526786 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4284  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.97 
 
 		 564 aa  53.9  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.730338 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4172  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.97 
 
 		 564 aa  53.9  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  20.7 
 
 		 472 aa  53.5  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  24.21 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0576  phospholipase D/transphosphatidylase  23.08 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2155  cardiolipin synthetase domain protein  23.22 
 
 		 394 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000221314  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2641  phospholipase D/transphosphatidylase  23.06 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.153898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.02 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1860  cardiolipin synthetase  23.22 
 
 		 367 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.68141  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0847  cardiolipin synthase 2  21.6 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0907  cardiolipin synthase 2  21.6 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.352926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0960  cardiolipin synthase 2  21.6 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0939  cardiolipin synthase 2  21.6 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0875  cardiolipin synthase 2  21.6 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  23.84 
 
 		 480 aa  50.1  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  27.61 
 
 		 403 aa  49.7  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1156  phospholipase D/transphosphatidylase  22.42 
 
 		 441 aa  50.1  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  26.12 
 
 		 405 aa  50.1  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4980  phospholipase D/transphosphatidylase  25.71 
 
 		 538 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  27.96 
 
 		 478 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36690  cardiolipin synthase 2  20.94 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70058  normal  0.734179 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1146  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.51 
 
 		 520 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000126804  hitchhiker  4.1949e-17 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  21.03 
 
 		 483 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2054  cardiolipin synthetase domain-containing protein  22.43 
 
 		 367 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900063  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0025  cardiolipin synthase 2  25.14 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0012  cardiolipin synthase 2  21.9 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5588  putative phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 534 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2087  cardiolipin synthetase domain protein  22.43 
 
 		 394 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1907  cardiolipin synthetase domain-containing protein  22.43 
 
 		 378 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2123  cardiolipin synthetase domain-containing protein  22.69 
 
 		 394 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1870  cardiolipin synthetase  22.16 
 
 		 377 aa  47.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0003289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5524  cardiolipin synthetase domain protein  21.98 
 
 		 397 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0013  cardiolipin synthase 2  22.82 
 
 		 433 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.282981 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>