136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1935 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  96.34 
 
 		 437 aa  879    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  76.2 
 
 		 437 aa  704    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 437 aa  903    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  99.54 
 
 		 437 aa  901    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  74.37 
 
 		 446 aa  696    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  99.54 
 
 		 437 aa  902    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  74.83 
 
 		 437 aa  689    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  90.85 
 
 		 437 aa  836    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1965  phosphatidylserine synthase  76.2 
 
 		 437 aa  685    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  91.53 
 
 		 437 aa  842    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  90.85 
 
 		 437 aa  836    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  77.8 
 
 		 437 aa  728    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  76.89 
 
 		 446 aa  721    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  90.85 
 
 		 437 aa  835    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  90.85 
 
 		 437 aa  836    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  80.55 
 
 		 437 aa  749    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  50.8 
 
 		 446 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  51.03 
 
 		 446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  50.34 
 
 		 450 aa  440  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  52.18 
 
 		 412 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2677  phosphatidylserine synthase  47.27 
 
 		 445 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3244  phosphatidylserine synthase  48.06 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3463  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  48.75 
 
 		 447 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2876  phosphatidylserine synthase  48.41 
 
 		 477 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  48.42 
 
 		 450 aa  405  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0926  phosphatidylserine synthase  44.87 
 
 		 442 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  49.75 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  47.74 
 
 		 451 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0300  phosphatidylserine synthase  44.24 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3207  phosphatidylserine synthase  48.4 
 
 		 452 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3466  phosphatidylserine synthase  48.4 
 
 		 451 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3344  phosphatidylserine synthase  48.4 
 
 		 451 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00469023  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02479  phosphatidylserine synthase  45.48 
 
 		 451 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1083  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.48 
 
 		 451 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02443  hypothetical protein  45.48 
 
 		 451 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2742  phosphatidylserine synthase  45.48 
 
 		 451 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.933118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2872  phosphatidylserine synthase  45.48 
 
 		 451 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1092  phosphatidylserine synthase  45.48 
 
 		 451 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0886852  normal  0.0107866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2738  phosphatidylserine synthase  45.48 
 
 		 451 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0459118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  45.71 
 
 		 451 aa  362  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  45.24 
 
 		 451 aa  361  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3070  phosphatidylserine synthase  45.48 
 
 		 451 aa  358  8e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.917906  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0025  phosphatidylserine synthase  44.22 
 
 		 453 aa  358  9.999999999999999e-98  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  44.29 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  44.29 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  44.29 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  44.29 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  46.67 
 
 		 451 aa  353  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  44.29 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3664  phosphatidylserine synthase  44.42 
 
 		 442 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  46.21 
 
 		 451 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  47.29 
 
 		 451 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2065  phosphatidylserine synthase  44.65 
 
 		 437 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.361576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2239  phosphatidylserine synthase  43.28 
 
 		 442 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2235  phosphatidylserine synthase  43.74 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.702334 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  31.29 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04600  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, putative  30.19 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  20.88 
 
 		 543 aa  55.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  21.39 
 
 		 482 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1562  phospholipase D/transphosphatidylase  21.17 
 
 		 495 aa  54.3  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  24.67 
 
 		 479 aa  53.9  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47576  predicted protein  25.75 
 
 		 574 aa  53.5  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.124789  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1907  cardiolipin synthetase domain-containing protein  23.48 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2054  cardiolipin synthetase domain-containing protein  23.48 
 
 		 367 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900063  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  23.11 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  24.82 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2087  cardiolipin synthetase domain protein  23.2 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1870  cardiolipin synthetase  23.2 
 
 		 377 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0003289  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  24 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  20.89 
 
 		 484 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.08 
 
 		 487 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2155  cardiolipin synthetase domain protein  23.71 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000221314  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.96 
 
 		 477 aa  50.8  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  22.69 
 
 		 487 aa  50.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  22.03 
 
 		 480 aa  50.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  25.17 
 
 		 481 aa  50.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.68 
 
 		 487 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  20.91 
 
 		 486 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1860  cardiolipin synthetase  23.98 
 
 		 367 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.68141  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  20.73 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  22.37 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  20.63 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2123  cardiolipin synthetase domain-containing protein  22.5 
 
 		 394 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  22.53 
 
 		 477 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  24.22 
 
 		 478 aa  47.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  23.18 
 
 		 482 aa  47.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  19.21 
 
 		 374 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1424  phospholipase D/transphosphatidylase  21.55 
 
 		 544 aa  47  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2285  phopholipase D  25 
 
 		 476 aa  47  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01043  predicted hydrolase  25 
 
 		 473 aa  47  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.951902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2599  phospholipase D/Transphosphatidylase  25 
 
 		 493 aa  47  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0536182  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1371  phospholipase D/transphosphatidylase  21.91 
 
 		 540 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130503 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01050  hypothetical protein  25 
 
 		 473 aa  47  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.795141  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1426  phopholipase D  25 
 
 		 473 aa  47  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.33637  normal  0.352917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3283  phospholipase D/transphosphatidylase  22.95 
 
 		 505 aa  47  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1167  phopholipase D  25 
 
 		 476 aa  47  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.383725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1166  phopholipase D  25 
 
 		 476 aa  47  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.130412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2553  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 476 aa  47  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.424547  normal  0.39142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2085  phopholipase D  25 
 
 		 473 aa  47  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.374109 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  20.95 
 
 		 532 aa  46.6  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>