78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1092 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2872  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 451 aa  926    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3344  phosphatidylserine synthase  73.09 
 
 		 451 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00469023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1092  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 451 aa  926    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0886852  normal  0.0107866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2738  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 451 aa  926    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0459118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  99.33 
 
 		 451 aa  922    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3466  phosphatidylserine synthase  73.09 
 
 		 451 aa  665    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  93.5 
 
 		 451 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  72.16 
 
 		 451 aa  667    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  93.5 
 
 		 451 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  93.5 
 
 		 451 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  93.5 
 
 		 451 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  93.5 
 
 		 451 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2742  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 451 aa  926    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.933118  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3207  phosphatidylserine synthase  73.09 
 
 		 452 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  99.78 
 
 		 451 aa  926    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3070  phosphatidylserine synthase  89.79 
 
 		 451 aa  816    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.917906  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02443  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  926    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  69.91 
 
 		 451 aa  635    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  71.99 
 
 		 451 aa  643    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  71.06 
 
 		 451 aa  634    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1083  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 451 aa  926    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02479  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 451 aa  926    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  70.6 
 
 		 451 aa  632  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0025  phosphatidylserine synthase  57.17 
 
 		 453 aa  540  9.999999999999999e-153  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2876  phosphatidylserine synthase  52.62 
 
 		 477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0300  phosphatidylserine synthase  51.32 
 
 		 455 aa  468  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  49.09 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  48.4 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3244  phosphatidylserine synthase  50.44 
 
 		 447 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3463  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  50.88 
 
 		 447 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  47.63 
 
 		 450 aa  431  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2677  phosphatidylserine synthase  46.82 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  47.27 
 
 		 450 aa  428  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  48.43 
 
 		 412 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  47.05 
 
 		 437 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  47.05 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  45.1 
 
 		 437 aa  388  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  47.05 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  47.39 
 
 		 437 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1965  phosphatidylserine synthase  47.06 
 
 		 437 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  47.05 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  45.1 
 
 		 446 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  45.68 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  45.56 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  45.45 
 
 		 437 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  46.38 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  44.55 
 
 		 437 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  44.17 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  45.45 
 
 		 437 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3664  phosphatidylserine synthase  44.52 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  45.33 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2065  phosphatidylserine synthase  44.29 
 
 		 437 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.361576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2239  phosphatidylserine synthase  45.35 
 
 		 442 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0926  phosphatidylserine synthase  40.78 
 
 		 442 aa  355  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2235  phosphatidylserine synthase  44.22 
 
 		 442 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.702334 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  24.62 
 
 		 543 aa  77  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  23.75 
 
 		 534 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  23.56 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.06 
 
 		 374 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04600  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, putative  28.34 
 
 		 552 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.45 
 
 		 474 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  24.76 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  21.58 
 
 		 480 aa  47.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  20.45 
 
 		 396 aa  47  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  24.02 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  22.06 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0547  phospholipase D/transphosphatidylase  26.24 
 
 		 549 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954131  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  23.76 
 
 		 396 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  23.27 
 
 		 518 aa  44.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0658  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.94 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.17 
 
 		 478 aa  44.3  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  21.84 
 
 		 416 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6050  phospholipase D/transphosphatidylase  22.01 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47576  predicted protein  25.71 
 
 		 574 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.124789  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2774  phospholipase D/transphosphatidylase  21.62 
 
 		 424 aa  43.9  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  21.23 
 
 		 481 aa  43.5  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  20.66 
 
 		 486 aa  43.5  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  25.17 
 
 		 478 aa  43.1  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>