More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2287 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2287  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 329 aa  671    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1984  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.33 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1510  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  36.1 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1758  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  36.1 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000695085 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1614  LacI family transcription regulator  36.1 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.702732  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3632  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  32.93 
 
 		 339 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 339 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1526  transcriptional regulator, LacI family  28.53 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.291045  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  31.99 
 
 		 344 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.5 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  29.18 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3761  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.25 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.27 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  29.71 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  33.02 
 
 		 336 aa  132  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  28.88 
 
 		 346 aa  132  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.89 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  25.4 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  25.08 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 333 aa  129  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 346 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  26.06 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.25 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  29.13 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  26.47 
 
 		 337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  27.69 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  27.69 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  27.69 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  27.69 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  27.69 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  27.67 
 
 		 343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  28.62 
 
 		 348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  24.76 
 
 		 340 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  28.8 
 
 		 340 aa  125  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3091  LacI family transcription regulator  27.46 
 
 		 328 aa  125  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  27.69 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  27.69 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  24.76 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  28.01 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  28.01 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  27.48 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  27.69 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  27.69 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  27.69 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  27.69 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  29.05 
 
 		 341 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  26.35 
 
 		 343 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1537  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.41 
 
 		 343 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  23.1 
 
 		 338 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  26.13 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.52 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4307  transcriptional regulator, LacI family  27.84 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.19442  normal  0.853045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1248  transcriptional regulator, LacI family  27.81 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0782052 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  26.48 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2238  transcriptional regulator, LacI family  26.35 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  27.97 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  28.85 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  31.99 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6362  transcriptional regulator, LacI family  30.6 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  25.59 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  28.85 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  27.17 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  28.85 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  27.57 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1598  LacI family transcription regulator  29.5 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0971431  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1464  transcriptional regulator, LacI family  28.12 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  28.48 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2581  LacI family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2601  transcriptional regulator, LacI family  26.73 
 
 		 388 aa  119  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  25.59 
 
 		 346 aa  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3453  LacI family transcription regulator  28.39 
 
 		 330 aa  119  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.364896  normal  0.286826 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  28.3 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  27.5 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2557  LacI family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000811694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1397  LacI family transcription regulator  27.65 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620296 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  29.94 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3380  transcriptional regulator PtxS  25.67 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  24.92 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  28.53 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  28.53 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1009  transcriptional regulator, LacI family  27.88 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285853 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  28.06 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  28.8 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  29.14 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  27.97 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  28.53 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  28.9 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1790  transcription regulator protein  25.71 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.678671  normal  0.041815 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  26.05 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2378  regulatory protein, LacI  25.67 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  27.67 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  22.98 
 
 		 338 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  24.27 
 
 		 339 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1266  transcriptional regulator, LacI family  29.32 
 
 		 336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210708  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1984  LacI family transcription regulator  28.37 
 
 		 360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1419  transcriptional regulator, LacI family  27.53 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.933801  normal  0.184887 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.25 
 
 		 342 aa  116  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  27.3 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>