138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23180 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23180  conserved hypothetical protein YmdA/YtgF  100 
 
 		 488 aa  917    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.476125  normal  0.212245 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1547  metal dependent phosphohydrolase  58.07 
 
 		 512 aa  451  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1120  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  44.65 
 
 		 537 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520277  normal  0.168608 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1043  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  49.48 
 
 		 488 aa  371  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620631  normal  0.862003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3291  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.5 
 
 		 523 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0260994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1625  phosphodiesterase  40.24 
 
 		 508 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00284901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1475  metal dependent phosphohydrolase  42.99 
 
 		 487 aa  353  5e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000182866  normal  0.981892 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0988  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.55 
 
 		 521 aa  350  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.549745  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1926  phosphodiesterase  42.37 
 
 		 511 aa  350  4e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1644  phosphodiesterase  42.41 
 
 		 511 aa  347  3e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2218  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  43.71 
 
 		 502 aa  346  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3371  phosphodiesterase  45.48 
 
 		 519 aa  343  4e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1583  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  43.92 
 
 		 560 aa  343  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0567  metal dependent phosphohydrolase  39.96 
 
 		 509 aa  342  5.999999999999999e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1262  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  44.6 
 
 		 509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2350  phosphodiesterase  42.03 
 
 		 520 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201473  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1617  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.95 
 
 		 510 aa  340  2.9999999999999998e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000205751  hitchhiker  0.00000000000531756 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1091  metal dependent phosphohydrolase  46.26 
 
 		 524 aa  340  4e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000612767  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1391  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  49.05 
 
 		 588 aa  340  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0559611 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1490  metal dependent phosphohydrolase  46.62 
 
 		 491 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.355219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1427  metal dependent phophohydrolase  49.59 
 
 		 588 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0953  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  39.91 
 
 		 518 aa  339  7e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0978  phosphodiesterase  41.16 
 
 		 527 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0108049  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0605  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.54 
 
 		 522 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2578  metal dependent phosphohydrolase  40.55 
 
 		 520 aa  337  3.9999999999999995e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.102064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1919  phosphodiesterase  41.96 
 
 		 512 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0169953  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2207  phosphodiesterase  41.67 
 
 		 518 aa  335  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1425  metal dependent phosphohydrolase  46.34 
 
 		 514 aa  334  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.340697  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3992  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  49.2 
 
 		 610 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.748921  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3312  phosphodiesterase  40.25 
 
 		 521 aa  332  7.000000000000001e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.924608  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10740  metal dependent phosphohydrolase  41.15 
 
 		 513 aa  331  1e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.462426  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3500  phosphodiesterase  44.5 
 
 		 521 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000584399  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0585  phosphodiesterase  40.51 
 
 		 519 aa  331  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0083  phosphodiesterase  38.77 
 
 		 517 aa  330  2e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.479038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2694  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.69 
 
 		 527 aa  330  3e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0283  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  43.82 
 
 		 523 aa  330  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333798  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07460  metal dependent phosphohydrolase  41.16 
 
 		 525 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00487641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1608  phosphodiesterase  40.09 
 
 		 527 aa  329  7e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.92092  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1061  phosphodiesterase  44.36 
 
 		 513 aa  328  9e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000060823  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1354  phosphodiesterase  39.65 
 
 		 527 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1184  phosphodiesterase  39.92 
 
 		 519 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.105071 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0237  hypothetical protein  44.96 
 
 		 509 aa  328  2.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0777  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.2 
 
 		 517 aa  328  2.0000000000000001e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000796077  normal  0.068248 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1254  HDIG/KH domain-containing protein  40.46 
 
 		 515 aa  327  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0168178  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0805  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  47.83 
 
 		 501 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0330  phosphodiesterase  46.19 
 
 		 535 aa  327  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000340911  decreased coverage  0.00581399 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1490  metal dependent phophohydrolase  39.43 
 
 		 527 aa  326  5e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0936  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.94 
 
 		 530 aa  326  5e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1693  phosphodiesterase  40.17 
 
 		 519 aa  326  6e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00893236  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1475  metal dependent phosphohydrolase  45.14 
 
 		 512 aa  325  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331031  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3711  phosphodiesterase  43.04 
 
 		 510 aa  324  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000469244  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1475  metal dependent phosphohydrolase  43.38 
 
 		 515 aa  323  4e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0039808  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0856  phosphodiesterase  46.38 
 
 		 535 aa  323  6e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000301712  normal  0.0173757 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0798  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.11 
 
 		 487 aa  322  7e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.164487  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0968  phosphodiesterase  41.28 
 
 		 533 aa  319  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00053282  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3293  phosphodiesterase  41.28 
 
 		 533 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1100  phosphodiesterase  40.89 
 
 		 521 aa  317  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000238727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3101  phosphodiesterase  39.11 
 
 		 511 aa  316  6e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0679097  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1180  phosphodiesterase  41.14 
 
 		 520 aa  315  9e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00430196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3248  metal dependent phosphohydrolase  43.4 
 
 		 480 aa  315  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1137  phosphodiesterase  39.75 
 
 		 520 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2598  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.41 
 
 		 516 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000056493  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11870  metal dependent phosphohydrolase  38.26 
 
 		 514 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000537836  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0615  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  43.7 
 
 		 558 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22485  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0524  metal dependent phosphohydrolase  38.92 
 
 		 513 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00240284  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2017  YmdA/YtgF protein  39.72 
 
 		 546 aa  313  5.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.855551  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0608  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  37.97 
 
 		 520 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000412066  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3523  metal dependent phosphohydrolase  48.67 
 
 		 646 aa  312  6.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.555023  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1337  phosphodiesterase  39.7 
 
 		 540 aa  313  6.999999999999999e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0515  phosphodiesterase  36.42 
 
 		 510 aa  311  2e-83  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0744  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  44.76 
 
 		 591 aa  309  6.999999999999999e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4793  phosphodiesterase  44.85 
 
 		 509 aa  309  8e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0108516  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0859  metal dependent phosphohydrolase  41.91 
 
 		 587 aa  309  9e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7243  phosphodiesterase  38.86 
 
 		 521 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0162  hypothetical protein  45.52 
 
 		 562 aa  307  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.183423  normal  0.57312 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1558  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.51 
 
 		 509 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1346  phosphodiesterase  40.13 
 
 		 519 aa  305  9.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.66517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1081  metal dependent phosphohydrolase  43.83 
 
 		 504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.075195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0122  phosphodiesterase  38.18 
 
 		 519 aa  305  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1372  phosphodiesterase  40.13 
 
 		 519 aa  305  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800868  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0715  metal dependent phosphohydrolase  38.88 
 
 		 516 aa  303  4.0000000000000003e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352371  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1293  phosphodiesterase  43.65 
 
 		 517 aa  303  4.0000000000000003e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000703284  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0788  phosphodiesterase  39.09 
 
 		 522 aa  303  5.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3104  phosphodiesterase  39.66 
 
 		 516 aa  302  9e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000128005  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1160  phosphodiesterase  41.99 
 
 		 510 aa  301  1e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0442  hypothetical protein  38.74 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0114  metal dependent phosphohydrolase  40.65 
 
 		 520 aa  300  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0875  phosphodiesterase  38.07 
 
 		 575 aa  300  4e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06705  hypothetical protein  37.36 
 
 		 522 aa  298  1e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0206529  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1221  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  47.58 
 
 		 533 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1191  phosphodiesterase  39.41 
 
 		 518 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000197151  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0962  phosphodiesterase  41.71 
 
 		 507 aa  297  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0148724  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0284  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 536 aa  297  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.876396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0828  phosphodiesterase  36.91 
 
 		 517 aa  298  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.894152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1127  phosphodiesterase  35.85 
 
 		 522 aa  296  4e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0940  phosphodiesterase  41.26 
 
 		 507 aa  295  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000513456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3549  phosphodiesterase  39.13 
 
 		 521 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000213332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3877  phosphodiesterase  39.13 
 
 		 520 aa  294  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1422  phosphodiesterase  39.13 
 
 		 521 aa  293  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.008621  normal  0.971465 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3825  phosphodiesterase  38.36 
 
 		 521 aa  293  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>