156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1043 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1043  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 488 aa  953    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620631  normal  0.862003 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1625  phosphodiesterase  41.73 
 
 		 508 aa  372  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00284901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23180  conserved hypothetical protein YmdA/YtgF  48.8 
 
 		 488 aa  368  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.476125  normal  0.212245 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1547  metal dependent phosphohydrolase  47.52 
 
 		 512 aa  362  8e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1120  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  45.83 
 
 		 537 aa  360  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520277  normal  0.168608 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1475  metal dependent phosphohydrolase  42.73 
 
 		 487 aa  357  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000182866  normal  0.981892 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1475  metal dependent phosphohydrolase  45.18 
 
 		 512 aa  348  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0988  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 		 521 aa  347  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.549745  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1490  metal dependent phosphohydrolase  46.06 
 
 		 491 aa  345  1e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.355219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0777  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.82 
 
 		 517 aa  345  1e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000796077  normal  0.068248 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07460  metal dependent phosphohydrolase  41.77 
 
 		 525 aa  344  2e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00487641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3291  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.25 
 
 		 523 aa  342  7e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0260994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2218  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  43.1 
 
 		 502 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1926  phosphodiesterase  42.89 
 
 		 511 aa  340  5e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1644  phosphodiesterase  43.11 
 
 		 511 aa  339  7e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1091  metal dependent phosphohydrolase  41 
 
 		 524 aa  339  7e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000612767  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1262  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.26 
 
 		 509 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1919  phosphodiesterase  42.27 
 
 		 512 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0169953  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1061  phosphodiesterase  43.02 
 
 		 513 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000060823  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0805  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  44.71 
 
 		 501 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0953  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 		 518 aa  336  7e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2207  phosphodiesterase  41.72 
 
 		 518 aa  334  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1425  metal dependent phosphohydrolase  44.39 
 
 		 514 aa  334  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.340697  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0936  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  39.64 
 
 		 530 aa  334  3e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1617  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 		 510 aa  332  9e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000205751  hitchhiker  0.00000000000531756 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1254  HDIG/KH domain-containing protein  42.07 
 
 		 515 aa  331  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0168178  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11870  metal dependent phosphohydrolase  41.1 
 
 		 514 aa  331  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000537836  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3293  phosphodiesterase  40.78 
 
 		 533 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0524  metal dependent phosphohydrolase  37.77 
 
 		 513 aa  330  5.0000000000000004e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00240284  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0798  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.19 
 
 		 487 aa  329  7e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.164487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2598  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.35 
 
 		 516 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000056493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0605  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.77 
 
 		 522 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0968  phosphodiesterase  40.35 
 
 		 533 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00053282  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3500  phosphodiesterase  41.48 
 
 		 521 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000584399  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3248  metal dependent phosphohydrolase  43.96 
 
 		 480 aa  328  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3101  phosphodiesterase  39.86 
 
 		 511 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0679097  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1693  phosphodiesterase  38.88 
 
 		 519 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00893236  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1583  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.09 
 
 		 560 aa  326  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2350  phosphodiesterase  40.88 
 
 		 520 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201473  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0715  metal dependent phosphohydrolase  41.69 
 
 		 516 aa  325  8.000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352371  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0585  phosphodiesterase  40.83 
 
 		 519 aa  325  9e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0788  phosphodiesterase  37.14 
 
 		 522 aa  325  1e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06705  hypothetical protein  38.18 
 
 		 522 aa  324  2e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0206529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1475  metal dependent phosphohydrolase  43.01 
 
 		 515 aa  324  3e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0039808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3312  phosphodiesterase  39.88 
 
 		 521 aa  323  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.924608  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1160  phosphodiesterase  36.27 
 
 		 510 aa  324  3e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1081  metal dependent phosphohydrolase  42.33 
 
 		 504 aa  322  7e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.075195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0122  phosphodiesterase  38.34 
 
 		 519 aa  320  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3371  phosphodiesterase  39.64 
 
 		 519 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10740  metal dependent phosphohydrolase  39.87 
 
 		 513 aa  319  7e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.462426  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7243  phosphodiesterase  38.55 
 
 		 521 aa  319  7.999999999999999e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0608  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  38.66 
 
 		 520 aa  318  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000412066  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3992  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  47.33 
 
 		 610 aa  317  4e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.748921  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1184  phosphodiesterase  38.88 
 
 		 519 aa  315  9e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.105071 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0567  metal dependent phosphohydrolase  37.99 
 
 		 509 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0442  hypothetical protein  36.76 
 
 		 532 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2578  metal dependent phosphohydrolase  39.04 
 
 		 520 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.102064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0283  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.83 
 
 		 523 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333798  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0330  phosphodiesterase  41.59 
 
 		 535 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000340911  decreased coverage  0.00581399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1180  phosphodiesterase  40.35 
 
 		 520 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00430196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3711  phosphodiesterase  40.46 
 
 		 510 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000469244  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0846  phosphodiesterase  40.05 
 
 		 522 aa  313  4.999999999999999e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2694  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  43.65 
 
 		 527 aa  313  4.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1100  phosphodiesterase  39.8 
 
 		 521 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000238727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3104  phosphodiesterase  39.24 
 
 		 516 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000128005  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0978  phosphodiesterase  39.09 
 
 		 527 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0108049  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0162  hypothetical protein  45.29 
 
 		 562 aa  311  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.183423  normal  0.57312 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1337  phosphodiesterase  40.84 
 
 		 540 aa  312  1e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127735  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1608  phosphodiesterase  38.24 
 
 		 527 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.92092  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1427  metal dependent phophohydrolase  41.03 
 
 		 588 aa  310  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2017  YmdA/YtgF protein  39.13 
 
 		 546 aa  310  4e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.855551  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2086  phosphodiesterase  40.17 
 
 		 518 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0237  hypothetical protein  40.44 
 
 		 509 aa  309  1.0000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1490  metal dependent phophohydrolase  37.82 
 
 		 527 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1330  phosphodiesterase  38.43 
 
 		 506 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1391  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.07 
 
 		 588 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0559611 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1214  phosphodiesterase  38.48 
 
 		 517 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2159  phosphodiesterase  41.18 
 
 		 531 aa  308  2.0000000000000002e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1354  phosphodiesterase  37.82 
 
 		 527 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0856  phosphodiesterase  41.5 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000301712  normal  0.0173757 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0962  phosphodiesterase  40.7 
 
 		 507 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0148724  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0284  metal dependent phosphohydrolase  36.47 
 
 		 536 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.876396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0515  phosphodiesterase  36.07 
 
 		 510 aa  308  2.0000000000000002e-82  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1191  phosphodiesterase  40.36 
 
 		 518 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000197151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1137  phosphodiesterase  39.1 
 
 		 520 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1346  phosphodiesterase  37.42 
 
 		 519 aa  306  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.66517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1372  phosphodiesterase  37.42 
 
 		 519 aa  306  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800868  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0875  phosphodiesterase  38.55 
 
 		 575 aa  305  9.000000000000001e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0401  phosphodiesterase  36.06 
 
 		 513 aa  304  2.0000000000000002e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0083  phosphodiesterase  37.27 
 
 		 517 aa  305  2.0000000000000002e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.479038  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0828  phosphodiesterase  36.55 
 
 		 517 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.894152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0940  phosphodiesterase  40.47 
 
 		 507 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000513456  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0744  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.53 
 
 		 591 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3549  phosphodiesterase  38.48 
 
 		 521 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000213332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0007  phosphodiesterase  34.33 
 
 		 523 aa  303  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0813303  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0114  metal dependent phosphohydrolase  39.59 
 
 		 520 aa  302  8.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3877  phosphodiesterase  38.27 
 
 		 520 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3825  phosphodiesterase  39.45 
 
 		 521 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3813  phosphodiesterase  39.45 
 
 		 520 aa  299  7e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0688282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1422  phosphodiesterase  38.05 
 
 		 521 aa  299  8e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.008621  normal  0.971465 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>