140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1214 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1343  phosphodiesterase  82.01 
 
 		 517 aa  837    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0846  phosphodiesterase  63.41 
 
 		 522 aa  656    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0884  YmdA/YtgF protein  70.3 
 
 		 505 aa  712    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0502  phosphodiesterase  76.79 
 
 		 517 aa  764    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1223  phosphodiesterase  82.01 
 
 		 517 aa  837    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0520  phosphodiesterase  81.62 
 
 		 517 aa  828    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1330  phosphodiesterase  73.52 
 
 		 506 aa  757    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1398  phosphodiesterase  77.78 
 
 		 506 aa  788    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.404741  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1309  phosphodiesterase  78.22 
 
 		 505 aa  796    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0124805  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1214  phosphodiesterase  100 
 
 		 517 aa  1020    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0988  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  46.35 
 
 		 521 aa  451  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.549745  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1475  metal dependent phosphohydrolase  47.9 
 
 		 515 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0039808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1625  phosphodiesterase  44.66 
 
 		 508 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00284901  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1191  phosphodiesterase  44.85 
 
 		 518 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000197151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2430  phosphodiesterase  44.66 
 
 		 520 aa  423  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3790  phosphodiesterase  44.85 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3813  phosphodiesterase  44.66 
 
 		 520 aa  422  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0688282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3627  phosphodiesterase  44.66 
 
 		 520 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3519  phosphodiesterase  44.66 
 
 		 520 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3537  phosphodiesterase  44.66 
 
 		 520 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3914  phosphodiesterase  44.66 
 
 		 520 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00777631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1081  metal dependent phosphohydrolase  45.65 
 
 		 504 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.075195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2086  phosphodiesterase  44.27 
 
 		 518 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3549  phosphodiesterase  44.66 
 
 		 521 aa  421  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000213332  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0968  phosphodiesterase  42.8 
 
 		 533 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00053282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3825  phosphodiesterase  44.47 
 
 		 521 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3877  phosphodiesterase  44.66 
 
 		 520 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1422  phosphodiesterase  44.95 
 
 		 521 aa  420  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.008621  normal  0.971465 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3293  phosphodiesterase  42.8 
 
 		 533 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0715  metal dependent phosphohydrolase  44.18 
 
 		 516 aa  418  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352371  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1919  phosphodiesterase  43.58 
 
 		 512 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0169953  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0605  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 		 522 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1926  phosphodiesterase  43.41 
 
 		 511 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1180  phosphodiesterase  44.82 
 
 		 520 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00430196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1644  phosphodiesterase  43.2 
 
 		 511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2578  metal dependent phosphohydrolase  43.85 
 
 		 520 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.102064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1061  phosphodiesterase  43.56 
 
 		 513 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000060823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1475  metal dependent phosphohydrolase  44.33 
 
 		 487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000182866  normal  0.981892 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1137  phosphodiesterase  44.11 
 
 		 520 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0953  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.65 
 
 		 518 aa  405  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0978  phosphodiesterase  43.31 
 
 		 527 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0108049  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1091  metal dependent phosphohydrolase  47.56 
 
 		 524 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000612767  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1100  phosphodiesterase  44.26 
 
 		 521 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000238727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2350  phosphodiesterase  42.48 
 
 		 520 aa  402  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201473  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1262  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  43.79 
 
 		 509 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1475  metal dependent phosphohydrolase  47.4 
 
 		 512 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331031  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2598  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  44.68 
 
 		 516 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000056493  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2207  phosphodiesterase  41.57 
 
 		 518 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3371  phosphodiesterase  43.3 
 
 		 519 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3500  phosphodiesterase  45.68 
 
 		 521 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000584399  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3104  phosphodiesterase  43.68 
 
 		 516 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000128005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3312  phosphodiesterase  43.02 
 
 		 521 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.924608  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0585  phosphodiesterase  42.69 
 
 		 519 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1337  phosphodiesterase  39.89 
 
 		 540 aa  394  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1184  phosphodiesterase  41.06 
 
 		 519 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.105071 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11870  metal dependent phosphohydrolase  44.25 
 
 		 514 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000537836  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0306  hypothetical protein  40.59 
 
 		 535 aa  391  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.72936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0615  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  45.62 
 
 		 558 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22485  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0524  metal dependent phosphohydrolase  41.44 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00240284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3101  phosphodiesterase  42.28 
 
 		 511 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0679097  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1120  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.74 
 
 		 537 aa  391  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520277  normal  0.168608 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1254  HDIG/KH domain-containing protein  46.4 
 
 		 515 aa  385  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0168178  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1372  phosphodiesterase  47.85 
 
 		 519 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800868  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0608  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.58 
 
 		 520 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000412066  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2159  phosphodiesterase  42.22 
 
 		 531 aa  383  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0442  hypothetical protein  41.91 
 
 		 532 aa  383  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1346  phosphodiesterase  47.62 
 
 		 519 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.66517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0330  phosphodiesterase  39.58 
 
 		 535 aa  382  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000340911  decreased coverage  0.00581399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3291  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.56 
 
 		 523 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0260994  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1693  phosphodiesterase  41.44 
 
 		 519 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00893236  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1617  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.5 
 
 		 510 aa  381  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000205751  hitchhiker  0.00000000000531756 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07460  metal dependent phosphohydrolase  42.19 
 
 		 525 aa  382  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00487641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1127  phosphodiesterase  41.56 
 
 		 522 aa  381  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0777  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  39.38 
 
 		 517 aa  375  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000796077  normal  0.068248 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06705  hypothetical protein  40.49 
 
 		 522 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0206529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2218  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  40.04 
 
 		 502 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10740  metal dependent phosphohydrolase  39.26 
 
 		 513 aa  378  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.462426  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0936  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  43.61 
 
 		 530 aa  374  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2694  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  39.29 
 
 		 527 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0856  phosphodiesterase  38.42 
 
 		 535 aa  375  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000301712  normal  0.0173757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7243  phosphodiesterase  40.79 
 
 		 521 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0853  phosphodiesterase  47.39 
 
 		 519 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.726014  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1490  metal dependent phosphohydrolase  44.42 
 
 		 491 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.355219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0788  phosphodiesterase  40.82 
 
 		 522 aa  370  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3711  phosphodiesterase  38.74 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000469244  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0007  phosphodiesterase  39.38 
 
 		 523 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0813303  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0237  hypothetical protein  39.73 
 
 		 509 aa  368  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0805  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  42.21 
 
 		 501 aa  368  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0284  metal dependent phosphohydrolase  41.45 
 
 		 536 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.876396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0567  metal dependent phosphohydrolase  41.46 
 
 		 509 aa  369  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0798  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  48.22 
 
 		 487 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.164487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1583  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.61 
 
 		 560 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0083  phosphodiesterase  42.89 
 
 		 517 aa  363  3e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.479038  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2017  YmdA/YtgF protein  41.1 
 
 		 546 aa  363  4e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.855551  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1724  phosphodiesterase  41.7 
 
 		 518 aa  363  4e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1558  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  39.77 
 
 		 509 aa  363  4e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0828  phosphodiesterase  43.67 
 
 		 517 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.894152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1160  phosphodiesterase  41.9 
 
 		 510 aa  362  1e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1293  phosphodiesterase  50.94 
 
 		 517 aa  362  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000703284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0122  phosphodiesterase  40.27 
 
 		 519 aa  358  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>